MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/1322/p2 high quality draft genome

Total Repeats: 20319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_020972	ATCCA	2	10	129353	129362	40 %	20 %	0 %	40 %	478468580
2503	NC_020972	T	6	6	129365	129370	0 %	100 %	0 %	0 %	478468580
2504	NC_020972	CCG	2	6	129396	129401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478468580
2505	NC_020972	CTT	2	6	129424	129429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468580
2506	NC_020972	CTT	2	6	129436	129441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468580
2507	NC_020972	AGAA	2	8	129446	129453	75 %	0 %	25 %	0 %	478468580
2508	NC_020972	GTA	2	6	129515	129520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468580
2509	NC_020972	TCA	2	6	129558	129563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468580
2510	NC_020972	TTC	2	6	129623	129628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468580
2511	NC_020972	AGC	2	6	129677	129682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468580
2512	NC_020972	AG	3	6	129723	129728	50 %	0 %	50 %	0 %	478468580
2513	NC_020972	TCT	2	6	129745	129750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468580
2514	NC_020972	CTT	2	6	129751	129756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468580
2515	NC_020972	ACC	2	6	129893	129898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478468580
2516	NC_020972	CGT	2	6	129919	129924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468580
2517	NC_020972	GAA	2	6	129946	129951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468580
2518	NC_020972	CATC	2	8	130026	130033	25 %	25 %	0 %	50 %	478468580
2519	NC_020972	CTT	2	6	130111	130116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468580
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2521	NC_020972	CAT	2	6	130165	130170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468580
2522	NC_020972	GA	3	6	130185	130190	50 %	0 %	50 %	0 %	478468580
2523	NC_020972	GT	5	10	130232	130241	0 %	50 %	50 %	0 %	478468580
2524	NC_020972	TGC	2	6	130301	130306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468580
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2529	NC_020972	T	6	6	130649	130654	0 %	100 %	0 %	0 %	478468580
2530	NC_020972	GAGG	2	8	130714	130721	25 %	0 %	75 %	0 %	478468580
2531	NC_020972	ATG	2	6	130762	130767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468580
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2537	NC_020972	GTT	2	6	130915	130920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468580
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2542	NC_020972	CTG	2	6	131581	131586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468581
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2552	NC_020972	AAT	2	6	131997	132002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478468581
2553	NC_020972	AG	3	6	132086	132091	50 %	0 %	50 %	0 %	478468581
2554	NC_020972	TGTA	2	8	132109	132116	25 %	50 %	25 %	0 %	478468581
2555	NC_020972	GAG	2	6	132154	132159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478468581
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2557	NC_020972	TAG	2	6	132247	132252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468581
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2559	NC_020972	AT	3	6	132362	132367	50 %	50 %	0 %	0 %	478468581
2560	NC_020972	CTT	2	6	132421	132426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468581
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2562	NC_020972	TTCT	2	8	132523	132530	0 %	75 %	0 %	25 %	478468581
2563	NC_020972	TTC	2	6	132553	132558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468581
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2611	NC_020972	GGA	2	6	134313	134318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478468582
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2994	NC_020972	TGA	3	9	153293	153301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468603
2995	NC_020972	TGTT	2	8	153341	153348	0 %	75 %	25 %	0 %	478468603
2996	NC_020972	CTGTG	2	10	153360	153369	0 %	40 %	40 %	20 %	478468603
2997	NC_020972	AGC	2	6	153438	153443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468603
2998	NC_020972	AG	3	6	153516	153521	50 %	0 %	50 %	0 %	478468603
2999	NC_020972	TTG	2	6	153560	153565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468603
3000	NC_020972	TTA	2	6	153598	153603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468603

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