MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/1322/p2 high quality draft genome

Total Repeats: 20319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020972	A	6	6	54569	54574	100 %	0 %	0 %	0 %	478468517
1003	NC_020972	TATT	2	8	54591	54598	25 %	75 %	0 %	0 %	478468517
1004	NC_020972	CTT	2	6	54600	54605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468517
1005	NC_020972	A	7	7	54707	54713	100 %	0 %	0 %	0 %	478468518
1006	NC_020972	TTC	2	6	54730	54735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468518
1007	NC_020972	CAC	2	6	54859	54864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478468518
1008	NC_020972	CAA	2	6	54893	54898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468518
1009	NC_020972	GAA	2	6	54920	54925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468518
1010	NC_020972	CT	3	6	54944	54949	0 %	50 %	0 %	50 %	478468518
1011	NC_020972	TCGA	2	8	54979	54986	25 %	25 %	25 %	25 %	478468518
1012	NC_020972	CTTC	2	8	55073	55080	0 %	50 %	0 %	50 %	478468518
1013	NC_020972	GAAT	2	8	55108	55115	50 %	25 %	25 %	0 %	478468518
1014	NC_020972	TGT	2	6	55144	55149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468518
1015	NC_020972	GAT	2	6	55172	55177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468518
1016	NC_020972	TTGA	2	8	55178	55185	25 %	50 %	25 %	0 %	478468518
1017	NC_020972	AGC	2	6	55227	55232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468518
1018	NC_020972	TCA	2	6	55233	55238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468518
1019	NC_020972	AAG	2	6	55295	55300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468518
1020	NC_020972	A	6	6	55367	55372	100 %	0 %	0 %	0 %	478468518
1021	NC_020972	CAA	2	6	55386	55391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468518
1022	NC_020972	G	6	6	55423	55428	0 %	0 %	100 %	0 %	478468518
1023	NC_020972	AAT	2	6	55520	55525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478468518
1024	NC_020972	GGAA	2	8	55534	55541	50 %	0 %	50 %	0 %	478468518
1025	NC_020972	TGG	2	6	55683	55688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478468518
1026	NC_020972	GGTTCA	2	12	55706	55717	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478468518
1027	NC_020972	TTATC	2	10	55807	55816	20 %	60 %	0 %	20 %	478468518
1028	NC_020972	AGAA	2	8	55880	55887	75 %	0 %	25 %	0 %	478468518
1029	NC_020972	CTG	2	6	55902	55907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468518
1030	NC_020972	GAG	2	6	55908	55913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478468518
1031	NC_020972	AT	3	6	56152	56157	50 %	50 %	0 %	0 %	478468518
1032	NC_020972	TTA	2	6	56167	56172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468518
1033	NC_020972	TGT	2	6	56334	56339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468519
1034	NC_020972	TGG	2	6	56343	56348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478468519
1035	NC_020972	T	6	6	56380	56385	0 %	100 %	0 %	0 %	478468519
1036	NC_020972	CTGG	3	12	56445	56456	0 %	25 %	50 %	25 %	478468519
1037	NC_020972	ATT	2	6	56460	56465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468519
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1041	NC_020972	TCC	2	6	56523	56528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478468519
1042	NC_020972	TTA	2	6	56536	56541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468519
1043	NC_020972	TTGC	2	8	56579	56586	0 %	50 %	25 %	25 %	478468519
1044	NC_020972	AGCG	2	8	56619	56626	25 %	0 %	50 %	25 %	478468519
1045	NC_020972	T	6	6	56631	56636	0 %	100 %	0 %	0 %	478468519
1046	NC_020972	GTA	2	6	56662	56667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468519
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1048	NC_020972	GAT	2	6	56791	56796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468519
1049	NC_020972	GTTGT	2	10	56872	56881	0 %	60 %	40 %	0 %	478468519
1050	NC_020972	T	6	6	56927	56932	0 %	100 %	0 %	0 %	478468519
1051	NC_020972	GAAAAG	2	12	56962	56973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468519
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1053	NC_020972	AGT	3	9	57066	57074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468519
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1055	NC_020972	CT	3	6	57084	57089	0 %	50 %	0 %	50 %	478468519
1056	NC_020972	GAG	2	6	57097	57102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478468519
1057	NC_020972	TGG	2	6	57120	57125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478468519
1058	NC_020972	GT	3	6	57134	57139	0 %	50 %	50 %	0 %	478468519
1059	NC_020972	TGT	2	6	57143	57148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468519
1060	NC_020972	AGT	2	6	57153	57158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468519
1061	NC_020972	GTT	2	6	57246	57251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468519
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1065	NC_020972	CAT	2	6	57578	57583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468519
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1067	NC_020972	TG	3	6	57775	57780	0 %	50 %	50 %	0 %	478468519
1068	NC_020972	GGTT	2	8	57784	57791	0 %	50 %	50 %	0 %	478468519
1069	NC_020972	TAA	2	6	57840	57845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478468519
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1097	NC_020972	CAC	2	6	58865	58870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478468520
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1101	NC_020972	CAA	2	6	59104	59109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468520
1102	NC_020972	GCT	2	6	59133	59138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468520
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1107	NC_020972	T	8	8	59245	59252	0 %	100 %	0 %	0 %	478468520
1108	NC_020972	CTT	2	6	59263	59268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468520
1109	NC_020972	TTC	2	6	59294	59299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468520
1110	NC_020972	TGG	2	6	59320	59325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478468520
1111	NC_020972	TAGA	2	8	59422	59429	50 %	25 %	25 %	0 %	478468520
1112	NC_020972	TTA	2	6	59508	59513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468520
1113	NC_020972	TGAA	2	8	59527	59534	50 %	25 %	25 %	0 %	478468520
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1121	NC_020972	CGTT	2	8	59908	59915	0 %	50 %	25 %	25 %	478468521
1122	NC_020972	GGAG	2	8	59917	59924	25 %	0 %	75 %	0 %	478468521
1123	NC_020972	GTAA	2	8	59969	59976	50 %	25 %	25 %	0 %	478468521
1124	NC_020972	TCCTAA	2	12	60036	60047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468521
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1127	NC_020972	AGC	2	6	60145	60150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468521
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1250	NC_020972	TAG	2	6	66554	66559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468526
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