MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/1322/p2 high quality draft genome

Total Repeats: 20319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_020972	GAA	2	6	27807	27812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468491
503	NC_020972	GGGC	2	8	27873	27880	0 %	0 %	75 %	25 %	478468491
504	NC_020972	T	6	6	27889	27894	0 %	100 %	0 %	0 %	478468491
505	NC_020972	TGA	2	6	27902	27907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468491
506	NC_020972	GGAGA	2	10	27910	27919	40 %	0 %	60 %	0 %	478468491
507	NC_020972	GGATA	2	10	27936	27945	40 %	20 %	40 %	0 %	478468491
508	NC_020972	A	7	7	27960	27966	100 %	0 %	0 %	0 %	478468491
509	NC_020972	AAG	2	6	27977	27982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468491
510	NC_020972	T	6	6	27997	28002	0 %	100 %	0 %	0 %	478468491
511	NC_020972	A	8	8	28094	28101	100 %	0 %	0 %	0 %	478468492
512	NC_020972	TTC	2	6	28138	28143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468492
513	NC_020972	GTTT	2	8	28156	28163	0 %	75 %	25 %	0 %	478468492
514	NC_020972	CAGA	2	8	28178	28185	50 %	0 %	25 %	25 %	478468492
515	NC_020972	TTC	2	6	28256	28261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468492
516	NC_020972	AAG	2	6	28271	28276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468492
517	NC_020972	TTC	2	6	28371	28376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468492
518	NC_020972	AAG	2	6	28385	28390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468492
519	NC_020972	AAG	2	6	28403	28408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468492
520	NC_020972	A	6	6	28409	28414	100 %	0 %	0 %	0 %	478468492
521	NC_020972	GAA	2	6	28641	28646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468493
522	NC_020972	ATCCG	2	10	28661	28670	20 %	20 %	20 %	40 %	478468493
523	NC_020972	TTC	2	6	28774	28779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468493
524	NC_020972	TAG	2	6	28822	28827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468493
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531	NC_020972	AGGGT	2	10	29179	29188	20 %	20 %	60 %	0 %	478468493
532	NC_020972	TTC	2	6	29215	29220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468493
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534	NC_020972	GAA	2	6	29241	29246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478468493
535	NC_020972	TGA	2	6	29255	29260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468493
536	NC_020972	TTC	2	6	29288	29293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468493
537	NC_020972	GC	4	8	29459	29466	0 %	0 %	50 %	50 %	478468493
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539	NC_020972	TA	3	6	29581	29586	50 %	50 %	0 %	0 %	478468493
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543	NC_020972	ACA	2	6	29998	30003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468494
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545	NC_020972	CTTT	2	8	30150	30157	0 %	75 %	0 %	25 %	478468494
546	NC_020972	TTTG	2	8	30165	30172	0 %	75 %	25 %	0 %	478468494
547	NC_020972	TTGT	2	8	30200	30207	0 %	75 %	25 %	0 %	478468494
548	NC_020972	CCTAT	2	10	30219	30228	20 %	40 %	0 %	40 %	478468494
549	NC_020972	T	6	6	30235	30240	0 %	100 %	0 %	0 %	478468494
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552	NC_020972	T	8	8	30469	30476	0 %	100 %	0 %	0 %	478468494
553	NC_020972	ATG	2	6	30494	30499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468494
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557	NC_020972	GTT	2	6	30711	30716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478468495
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559	NC_020972	TC	3	6	30739	30744	0 %	50 %	0 %	50 %	478468495
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561	NC_020972	CTG	2	6	30808	30813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468495
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567	NC_020972	T	6	6	31010	31015	0 %	100 %	0 %	0 %	478468495
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601	NC_020972	CTT	2	6	32504	32509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468497
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611	NC_020972	T	6	6	33175	33180	0 %	100 %	0 %	0 %	478468497
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