MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/1322/p2 high quality draft genome

Total Repeats: 20319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5003	NC_020972	CT	3	6	257502	257507	0 %	50 %	0 %	50 %	478468698
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5110	NC_020972	AC	3	6	263320	263325	50 %	0 %	0 %	50 %	478468703
5111	NC_020972	CA	3	6	263384	263389	50 %	0 %	0 %	50 %	478468703
5112	NC_020972	GCA	2	6	263511	263516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478468703
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5118	NC_020972	TCATT	2	10	263954	263963	20 %	60 %	0 %	20 %	478468704
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5121	NC_020972	A	6	6	264002	264007	100 %	0 %	0 %	0 %	478468704
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5370	NC_020972	CAT	2	6	275796	275801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468712
5371	NC_020972	CTT	2	6	275850	275855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478468712
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5374	NC_020972	GTA	2	6	275929	275934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468712
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5402	NC_020972	TAAT	2	8	277300	277307	50 %	50 %	0 %	0 %	478468714
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5477	NC_020972	AAGC	2	8	281405	281412	50 %	0 %	25 %	25 %	478468716
5478	NC_020972	ATG	2	6	281422	281427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478468716
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5483	NC_020972	AG	3	6	281606	281611	50 %	0 %	50 %	0 %	478468716
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5487	NC_020972	GTC	2	6	282019	282024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468717
5488	NC_020972	T	6	6	282038	282043	0 %	100 %	0 %	0 %	478468717
5489	NC_020972	ACT	2	6	282066	282071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468717
5490	NC_020972	ACT	2	6	282135	282140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468717
5491	NC_020972	TGC	2	6	282171	282176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478468717
5492	NC_020972	T	7	7	282181	282187	0 %	100 %	0 %	0 %	478468717
5493	NC_020972	CTCCTA	2	12	282188	282199	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478468717
5494	NC_020972	AAC	2	6	282273	282278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478468717
5495	NC_020972	TC	3	6	282388	282393	0 %	50 %	0 %	50 %	478468717
5496	NC_020972	ATC	2	6	282413	282418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478468717
5497	NC_020972	TGGC	2	8	282423	282430	0 %	25 %	50 %	25 %	478468717
5498	NC_020972	TTCGA	2	10	282442	282451	20 %	40 %	20 %	20 %	478468717
5499	NC_020972	ATT	2	6	282477	282482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478468717
5500	NC_020972	AG	3	6	282484	282489	50 %	0 %	50 %	0 %	478468717

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