MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/Bour complete genome

Total Repeats: 648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020971	TGTGA	2	10	3881	3890	20 %	40 %	40 %	0 %	478461253
2	NC_020971	TTGAA	2	10	4237	4246	40 %	40 %	20 %	0 %	478461254
3	NC_020971	GAGAA	2	10	4531	4540	60 %	0 %	40 %	0 %	478461254
4	NC_020971	GAAAA	2	10	4968	4977	80 %	0 %	20 %	0 %	478461254
5	NC_020971	TTACA	2	10	5123	5132	40 %	40 %	0 %	20 %	478461254
6	NC_020971	GTCTT	2	10	5817	5826	0 %	60 %	20 %	20 %	478461255
7	NC_020971	TGGTA	2	10	8290	8299	20 %	40 %	40 %	0 %	478461257
8	NC_020971	CGAAA	2	10	9698	9707	60 %	0 %	20 %	20 %	478461258
9	NC_020971	GGCTG	2	10	10334	10343	0 %	20 %	60 %	20 %	478461259
10	NC_020971	CCTCT	2	10	11126	11135	0 %	40 %	0 %	60 %	478461260
11	NC_020971	AAAGG	2	10	11285	11294	60 %	0 %	40 %	0 %	478461260
12	NC_020971	AAGAA	2	10	12405	12414	80 %	0 %	20 %	0 %	478461261
13	NC_020971	AAAGA	2	10	13803	13812	80 %	0 %	20 %	0 %	478461262
14	NC_020971	GATTT	2	10	15650	15659	20 %	60 %	20 %	0 %	478461264
15	NC_020971	CGTTC	2	10	16761	16770	0 %	40 %	20 %	40 %	478461265
16	NC_020971	GCTTC	2	10	17134	17143	0 %	40 %	20 %	40 %	478461265
17	NC_020971	GAAGG	2	10	17505	17514	40 %	0 %	60 %	0 %	478461265
18	NC_020971	GTTGT	2	10	20931	20940	0 %	60 %	40 %	0 %	478461268
19	NC_020971	AAGAT	2	10	22043	22052	60 %	20 %	20 %	0 %	478461269
20	NC_020971	TTTGC	2	10	22654	22663	0 %	60 %	20 %	20 %	478461269
21	NC_020971	GGAAA	2	10	24408	24417	60 %	0 %	40 %	0 %	478461269
22	NC_020971	AGAGG	2	10	26133	26142	40 %	0 %	60 %	0 %	478461270
23	NC_020971	GGAGA	2	10	27912	27921	40 %	0 %	60 %	0 %	478461271
24	NC_020971	ATCCG	2	10	28663	28672	20 %	20 %	20 %	40 %	478461273
25	NC_020971	AGGGT	2	10	29181	29190	20 %	20 %	60 %	0 %	478461273
26	NC_020971	CCTAT	2	10	30221	30230	20 %	40 %	0 %	40 %	478461274
27	NC_020971	AAGGA	2	10	31021	31030	60 %	0 %	40 %	0 %	478461275
28	NC_020971	GAGCT	2	10	32060	32069	20 %	20 %	40 %	20 %	478461276
29	NC_020971	TCAGT	2	10	36300	36309	20 %	40 %	20 %	20 %	478461282
30	NC_020971	CTATT	2	10	36734	36743	20 %	60 %	0 %	20 %	478461282
31	NC_020971	TCCTA	2	10	36781	36790	20 %	40 %	0 %	40 %	478461282
32	NC_020971	ACGAT	2	10	38697	38706	40 %	20 %	20 %	20 %	478461283
33	NC_020971	TTTGA	2	10	39062	39071	20 %	60 %	20 %	0 %	478461283
34	NC_020971	AGCAA	2	10	42713	42722	60 %	0 %	20 %	20 %	478461286
35	NC_020971	CGATG	2	10	42770	42779	20 %	20 %	40 %	20 %	478461286
36	NC_020971	TTTAT	2	10	44843	44852	20 %	80 %	0 %	0 %	478461290
37	NC_020971	CTTTC	2	10	46940	46949	0 %	60 %	0 %	40 %	478461292
38	NC_020971	AGTTT	2	10	47479	47488	20 %	60 %	20 %	0 %	478461292
39	NC_020971	CTTTT	2	10	50648	50657	0 %	80 %	0 %	20 %	478461295
40	NC_020971	CCGTA	2	10	54531	54540	20 %	20 %	20 %	40 %	478461298
41	NC_020971	TTATC	2	10	55934	55943	20 %	60 %	0 %	20 %	478461299
42	NC_020971	GTTGT	2	10	57002	57011	0 %	60 %	40 %	0 %	478461300
43	NC_020971	GAGCA	2	10	60090	60099	40 %	0 %	40 %	20 %	478461302
44	NC_020971	TGTGA	2	10	62539	62548	20 %	40 %	40 %	0 %	478461304
45	NC_020971	AGTGA	2	10	64060	64069	40 %	20 %	40 %	0 %	478461305
46	NC_020971	CCTTC	2	10	64334	64343	0 %	40 %	0 %	60 %	478461305
47	NC_020971	AGGAG	2	10	66562	66571	40 %	0 %	60 %	0 %	478461307
48	NC_020971	GTTAA	2	10	66692	66701	40 %	40 %	20 %	0 %	478461307
49	NC_020971	GGAGC	2	10	69940	69949	20 %	0 %	60 %	20 %	478461310
50	NC_020971	GCGAT	2	10	70130	70139	20 %	20 %	40 %	20 %	478461310
51	NC_020971	CTCTT	2	10	70484	70493	0 %	60 %	0 %	40 %	478461310
52	NC_020971	AGGGG	2	10	71130	71139	20 %	0 %	80 %	0 %	478461310
53	NC_020971	AAGAA	2	10	71172	71181	80 %	0 %	20 %	0 %	478461310
54	NC_020971	ATTGG	2	10	72462	72471	20 %	40 %	40 %	0 %	478461312
55	NC_020971	GAAAA	2	10	73534	73543	80 %	0 %	20 %	0 %	478461312
56	NC_020971	TGGGA	2	10	73951	73960	20 %	20 %	60 %	0 %	478461313
57	NC_020971	TATTT	2	10	76478	76487	20 %	80 %	0 %	0 %	478461314
58	NC_020971	TGTCT	2	10	80271	80280	0 %	60 %	20 %	20 %	478461317
59	NC_020971	TTACT	2	10	80778	80787	20 %	60 %	0 %	20 %	478461317
60	NC_020971	AGAAA	2	10	82168	82177	80 %	0 %	20 %	0 %	478461319
61	NC_020971	GGAAG	2	10	82681	82690	40 %	0 %	60 %	0 %	478461319
62	NC_020971	AGCGA	2	10	85147	85156	40 %	0 %	40 %	20 %	478461321
63	NC_020971	GATCC	2	10	86232	86241	20 %	20 %	20 %	40 %	478461322
64	NC_020971	AGAGC	2	10	87567	87576	40 %	0 %	40 %	20 %	478461323
65	NC_020971	TTTTC	2	10	91299	91308	0 %	80 %	0 %	20 %	478461326
66	NC_020971	GGATG	2	10	91559	91568	20 %	20 %	60 %	0 %	478461327
67	NC_020971	CAACA	2	10	93098	93107	60 %	0 %	0 %	40 %	478461328
68	NC_020971	ACAGC	2	10	94142	94151	40 %	0 %	20 %	40 %	478461329
69	NC_020971	GGAAC	2	10	94855	94864	40 %	0 %	40 %	20 %	478461330
70	NC_020971	GGATT	2	10	95755	95764	20 %	40 %	40 %	0 %	478461330
71	NC_020971	CAATC	2	10	96851	96860	40 %	20 %	0 %	40 %	478461332
72	NC_020971	TTTGC	2	10	96985	96994	0 %	60 %	20 %	20 %	478461332
73	NC_020971	ATTCA	2	10	97249	97258	40 %	40 %	0 %	20 %	478461332
74	NC_020971	GATCC	2	10	97508	97517	20 %	20 %	20 %	40 %	478461332
75	NC_020971	AAGCT	2	10	99132	99141	40 %	20 %	20 %	20 %	478461333
76	NC_020971	AGGGG	2	10	99491	99500	20 %	0 %	80 %	0 %	478461333
77	NC_020971	ATAGC	2	10	100190	100199	40 %	20 %	20 %	20 %	478461334
78	NC_020971	TTCCC	2	10	100794	100803	0 %	40 %	0 %	60 %	478461335
79	NC_020971	AGCGA	2	10	103118	103127	40 %	0 %	40 %	20 %	478461337
80	NC_020971	TTTCT	2	10	103476	103485	0 %	80 %	0 %	20 %	478461337
81	NC_020971	CTTCT	2	10	103530	103539	0 %	60 %	0 %	40 %	478461337
82	NC_020971	ATCAT	2	10	104682	104691	40 %	40 %	0 %	20 %	478461338
83	NC_020971	GGCAT	2	10	105390	105399	20 %	20 %	40 %	20 %	478461338
84	NC_020971	AAAGC	2	10	109116	109125	60 %	0 %	20 %	20 %	478461341
85	NC_020971	GCATT	2	10	110276	110285	20 %	40 %	20 %	20 %	478461343
86	NC_020971	TGTTT	2	10	114965	114974	0 %	80 %	20 %	0 %	478461346
87	NC_020971	CATGT	2	10	115343	115352	20 %	40 %	20 %	20 %	478461346
88	NC_020971	TATCG	2	10	116047	116056	20 %	40 %	20 %	20 %	478461346
89	NC_020971	TTTCT	2	10	116563	116572	0 %	80 %	0 %	20 %	478461347
90	NC_020971	GGAGA	2	10	116759	116768	40 %	0 %	60 %	0 %	478461347
91	NC_020971	AAAGA	2	10	118809	118818	80 %	0 %	20 %	0 %	478461350
92	NC_020971	TAGGA	2	10	122475	122484	40 %	20 %	40 %	0 %	478461353
93	NC_020971	GCTTC	2	10	122804	122813	0 %	40 %	20 %	40 %	478461354
94	NC_020971	TACAA	2	10	126593	126602	60 %	20 %	0 %	20 %	478461359
95	NC_020971	ATCCA	2	10	129001	129010	40 %	20 %	0 %	40 %	478461362
96	NC_020971	GAAGA	2	10	130551	130560	60 %	0 %	40 %	0 %	478461362
97	NC_020971	AAAAG	2	10	132464	132473	80 %	0 %	20 %	0 %	478461363
98	NC_020971	GATTC	2	10	132795	132804	20 %	40 %	20 %	20 %	478461363
99	NC_020971	ATTGG	2	10	136080	136089	20 %	40 %	40 %	0 %	478461366
100	NC_020971	ATTGT	2	10	136113	136122	20 %	60 %	20 %	0 %	478461366
101	NC_020971	TGTTT	2	10	136539	136548	0 %	80 %	20 %	0 %	478461367
102	NC_020971	TCCAG	2	10	140287	140296	20 %	20 %	20 %	40 %	478461373
103	NC_020971	GTACA	2	10	141018	141027	40 %	20 %	20 %	20 %	478461374
104	NC_020971	TAGAT	2	10	141391	141400	40 %	40 %	20 %	0 %	478461374
105	NC_020971	AAAAC	2	10	142283	142292	80 %	0 %	0 %	20 %	478461375
106	NC_020971	TGCTA	2	10	143369	143378	20 %	40 %	20 %	20 %	478461377
107	NC_020971	GGAGC	2	10	143416	143425	20 %	0 %	60 %	20 %	478461377
108	NC_020971	CTGGG	2	10	144831	144840	0 %	20 %	60 %	20 %	478461379
109	NC_020971	GTTTT	2	10	145578	145587	0 %	80 %	20 %	0 %	478461380
110	NC_020971	GAACC	2	10	149312	149321	40 %	0 %	20 %	40 %	478461381
111	NC_020971	ATTCT	2	10	152808	152817	20 %	60 %	0 %	20 %	478461385
112	NC_020971	CTGTG	2	10	153012	153021	0 %	40 %	40 %	20 %	478461385
113	NC_020971	TTCTT	2	10	155485	155494	0 %	80 %	0 %	20 %	478461388
114	NC_020971	AGGAA	2	10	160045	160054	60 %	0 %	40 %	0 %	478461393
115	NC_020971	AGAGA	2	10	163276	163285	60 %	0 %	40 %	0 %	478461396
116	NC_020971	AGCAA	2	10	163711	163720	60 %	0 %	20 %	20 %	478461396
117	NC_020971	CAAAA	2	10	167214	167223	80 %	0 %	0 %	20 %	478461398
118	NC_020971	AAGAG	2	10	168047	168056	60 %	0 %	40 %	0 %	478461398
119	NC_020971	GATTG	2	10	168392	168401	20 %	40 %	40 %	0 %	478461398
120	NC_020971	GTTTT	2	10	174874	174883	0 %	80 %	20 %	0 %	478461402
121	NC_020971	TATTG	2	10	174897	174906	20 %	60 %	20 %	0 %	478461402
122	NC_020971	CAGCA	2	10	175256	175265	40 %	0 %	20 %	40 %	478461402
123	NC_020971	TAGGA	2	10	175561	175570	40 %	20 %	40 %	0 %	478461403
124	NC_020971	TGATT	2	10	177488	177497	20 %	60 %	20 %	0 %	478461404
125	NC_020971	TCAAT	2	10	178129	178138	40 %	40 %	0 %	20 %	478461404
126	NC_020971	TTTTC	2	10	178168	178177	0 %	80 %	0 %	20 %	478461404
127	NC_020971	GGAAT	2	10	179734	179743	40 %	20 %	40 %	0 %	478461405
128	NC_020971	AGAGT	2	10	180692	180701	40 %	20 %	40 %	0 %	478461406
129	NC_020971	TTGAA	2	10	181225	181234	40 %	40 %	20 %	0 %	478461407
130	NC_020971	TTGAG	2	10	182785	182794	20 %	40 %	40 %	0 %	478461408
131	NC_020971	GAATG	2	10	182810	182819	40 %	20 %	40 %	0 %	478461408
132	NC_020971	AGAGA	2	10	184853	184862	60 %	0 %	40 %	0 %	478461411
133	NC_020971	ACGAT	2	10	186925	186934	40 %	20 %	20 %	20 %	478461413
134	NC_020971	GGATC	2	10	190017	190026	20 %	20 %	40 %	20 %	478461416
135	NC_020971	CAGAT	2	10	190132	190141	40 %	20 %	20 %	20 %	478461416
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