MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/Bour complete genome

Total Repeats: 20347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_020971	CTC	2	6	181473	181478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478461407
3503	NC_020971	GA	3	6	181518	181523	50 %	0 %	50 %	0 %	478461407
3504	NC_020971	GAT	2	6	181573	181578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461407
3505	NC_020971	AAAG	2	8	181726	181733	75 %	0 %	25 %	0 %	478461407
3506	NC_020971	CA	3	6	181831	181836	50 %	0 %	0 %	50 %	478461407
3507	NC_020971	ACA	2	6	181889	181894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461407
3508	NC_020971	CGA	2	6	181907	181912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461407
3509	NC_020971	AAT	2	6	181933	181938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461407
3510	NC_020971	ATT	2	6	181973	181978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461407
3511	NC_020971	GTTT	2	8	182029	182036	0 %	75 %	25 %	0 %	478461407
3512	NC_020971	CTT	2	6	182117	182122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461407
3513	NC_020971	AGA	2	6	182197	182202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461407
3514	NC_020971	TG	3	6	182230	182235	0 %	50 %	50 %	0 %	478461407
3515	NC_020971	G	7	7	182237	182243	0 %	0 %	100 %	0 %	478461407
3516	NC_020971	GA	3	6	182274	182279	50 %	0 %	50 %	0 %	478461407
3517	NC_020971	AGA	2	6	182302	182307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461407
3518	NC_020971	GAA	2	6	182315	182320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461407
3519	NC_020971	AGA	3	9	182359	182367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461407
3520	NC_020971	GATG	2	8	182634	182641	25 %	25 %	50 %	0 %	478461408
3521	NC_020971	TCT	2	6	182651	182656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461408
3522	NC_020971	AGG	2	6	182705	182710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461408
3523	NC_020971	GGA	2	6	182739	182744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461408
3524	NC_020971	TTGAG	2	10	182785	182794	20 %	40 %	40 %	0 %	478461408
3525	NC_020971	GAATG	2	10	182810	182819	40 %	20 %	40 %	0 %	478461408
3526	NC_020971	CT	3	6	182860	182865	0 %	50 %	0 %	50 %	478461408
3527	NC_020971	TGA	2	6	182874	182879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461408
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3530	NC_020971	TGA	2	6	182976	182981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461408
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3533	NC_020971	TTG	2	6	183041	183046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461408
3534	NC_020971	GAC	2	6	183050	183055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461408
3535	NC_020971	GAT	2	6	183080	183085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461408
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3537	NC_020971	GCG	2	6	183114	183119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478461408
3538	NC_020971	ACT	2	6	183162	183167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461408
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3546	NC_020971	GA	3	6	183420	183425	50 %	0 %	50 %	0 %	478461409
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3554	NC_020971	TTG	2	6	183586	183591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461409
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3557	NC_020971	TGA	2	6	183743	183748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461409
3558	NC_020971	CAG	3	9	183816	183824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461409
3559	NC_020971	GTA	2	6	183859	183864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461409
3560	NC_020971	GTTG	2	8	183899	183906	0 %	50 %	50 %	0 %	478461409
3561	NC_020971	GGA	3	9	183914	183922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461409
3562	NC_020971	TC	3	6	183930	183935	0 %	50 %	0 %	50 %	478461409
3563	NC_020971	ATT	2	6	183949	183954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461409
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3565	NC_020971	T	8	8	183991	183998	0 %	100 %	0 %	0 %	478461409
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3572	NC_020971	CTG	2	6	184453	184458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461410
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3584	NC_020971	TCTA	2	8	185416	185423	25 %	50 %	0 %	25 %	478461411
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3594	NC_020971	CTT	2	6	186339	186344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461413
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3598	NC_020971	TA	3	6	186561	186566	50 %	50 %	0 %	0 %	478461413
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3602	NC_020971	T	6	6	186639	186644	0 %	100 %	0 %	0 %	478461413
3603	NC_020971	GCTT	2	8	186658	186665	0 %	50 %	25 %	25 %	478461413
3604	NC_020971	CAC	2	6	186690	186695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478461413
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3607	NC_020971	TGT	2	6	186853	186858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461413
3608	NC_020971	ACGAT	2	10	186925	186934	40 %	20 %	20 %	20 %	478461413
3609	NC_020971	TTTA	2	8	186943	186950	25 %	75 %	0 %	0 %	478461413
3610	NC_020971	AAG	2	6	186954	186959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461413
3611	NC_020971	AGA	2	6	187039	187044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461413
3612	NC_020971	CTT	2	6	187076	187081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461413
3613	NC_020971	A	6	6	187094	187099	100 %	0 %	0 %	0 %	478461413
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3615	NC_020971	GCTT	2	8	187150	187157	0 %	50 %	25 %	25 %	478461413
3616	NC_020971	T	7	7	187156	187162	0 %	100 %	0 %	0 %	478461413
3617	NC_020971	A	6	6	187197	187202	100 %	0 %	0 %	0 %	478461413
3618	NC_020971	GCT	2	6	187286	187291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461413
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3620	NC_020971	GCTT	2	8	187591	187598	0 %	50 %	25 %	25 %	478461413
3621	NC_020971	TAG	2	6	187629	187634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461413
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3623	NC_020971	T	7	7	187672	187678	0 %	100 %	0 %	0 %	478461413
3624	NC_020971	TTA	2	6	187702	187707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461413
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3655	NC_020971	GAC	2	6	189704	189709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461416
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