MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/Bour complete genome

Total Repeats: 20347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_020971	ACA	2	6	635305	635310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461825
12503	NC_020971	CCT	2	6	635315	635320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478461825
12504	NC_020971	A	6	6	635402	635407	100 %	0 %	0 %	0 %	478461825
12505	NC_020971	TCGAG	2	10	635412	635421	20 %	20 %	40 %	20 %	478461825
12506	NC_020971	T	6	6	635439	635444	0 %	100 %	0 %	0 %	478461825
12507	NC_020971	TTG	2	6	635469	635474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461825
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12511	NC_020971	TCA	2	6	635631	635636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461825
12512	NC_020971	CTTT	2	8	635685	635692	0 %	75 %	0 %	25 %	478461825
12513	NC_020971	ATG	3	9	635735	635743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461825
12514	NC_020971	TC	4	8	635760	635767	0 %	50 %	0 %	50 %	478461825
12515	NC_020971	CTA	2	6	635813	635818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461825
12516	NC_020971	TGA	2	6	635826	635831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461825
12517	NC_020971	CAA	2	6	635870	635875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461826
12518	NC_020971	TTTG	2	8	635889	635896	0 %	75 %	25 %	0 %	478461826
12519	NC_020971	TTA	2	6	635917	635922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461826
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12526	NC_020971	GGCTC	2	10	636176	636185	0 %	20 %	40 %	40 %	478461827
12527	NC_020971	TA	3	6	636199	636204	50 %	50 %	0 %	0 %	478461827
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12530	NC_020971	ATC	2	6	636277	636282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461827
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12532	NC_020971	TGC	2	6	636350	636355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461827
12533	NC_020971	CTT	2	6	636418	636423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461827
12534	NC_020971	ACCA	2	8	636508	636515	50 %	0 %	0 %	50 %	478461827
12535	NC_020971	CT	3	6	636546	636551	0 %	50 %	0 %	50 %	478461827
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12543	NC_020971	CTAC	2	8	636864	636871	25 %	25 %	0 %	50 %	478461827
12544	NC_020971	TGG	2	6	636919	636924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478461827
12545	NC_020971	ATT	2	6	636944	636949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461827
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12552	NC_020971	C	6	6	637428	637433	0 %	0 %	0 %	100 %	478461828
12553	NC_020971	TG	3	6	637446	637451	0 %	50 %	50 %	0 %	478461828
12554	NC_020971	GAG	2	6	637507	637512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461828
12555	NC_020971	CT	3	6	637513	637518	0 %	50 %	0 %	50 %	478461828
12556	NC_020971	TCT	2	6	637641	637646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461829
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12558	NC_020971	CTT	2	6	637737	637742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461829
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12560	NC_020971	GCA	2	6	637840	637845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461829
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12581	NC_020971	TCCAT	2	10	638746	638755	20 %	40 %	0 %	40 %	478461830
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12587	NC_020971	A	6	6	638914	638919	100 %	0 %	0 %	0 %	478461830
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12592	NC_020971	TAAACA	2	12	639145	639156	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478461830
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12599	NC_020971	ATGC	2	8	639410	639417	25 %	25 %	25 %	25 %	478461831
12600	NC_020971	ACGA	2	8	639450	639457	50 %	0 %	25 %	25 %	478461831
12601	NC_020971	GA	4	8	639509	639516	50 %	0 %	50 %	0 %	478461831
12602	NC_020971	AAG	2	6	639517	639522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461831
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12604	NC_020971	A	6	6	639536	639541	100 %	0 %	0 %	0 %	478461831
12605	NC_020971	ACA	2	6	639612	639617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461832
12606	NC_020971	ATC	2	6	639620	639625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461832
12607	NC_020971	TCAT	2	8	639633	639640	25 %	50 %	0 %	25 %	478461832
12608	NC_020971	AAG	2	6	639647	639652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461832
12609	NC_020971	TCT	2	6	639654	639659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461832
12610	NC_020971	AAG	2	6	639674	639679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461832
12611	NC_020971	TTTC	2	8	639680	639687	0 %	75 %	0 %	25 %	478461832
12612	NC_020971	CAC	2	6	639696	639701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478461832
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12616	NC_020971	ATA	2	6	639873	639878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461832
12617	NC_020971	CAT	2	6	639899	639904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461832
12618	NC_020971	T	8	8	639931	639938	0 %	100 %	0 %	0 %	478461832
12619	NC_020971	TTC	2	6	639942	639947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461832
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12983	NC_020971	TTC	2	6	659433	659438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461848
12984	NC_020971	ACT	2	6	659463	659468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461848
12985	NC_020971	AGA	2	6	659480	659485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461848
12986	NC_020971	T	6	6	659611	659616	0 %	100 %	0 %	0 %	478461848
12987	NC_020971	GAA	2	6	659691	659696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461848
12988	NC_020971	A	6	6	659977	659982	100 %	0 %	0 %	0 %	478461848
12989	NC_020971	TTTA	2	8	660050	660057	25 %	75 %	0 %	0 %	478461848
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12991	NC_020971	AGA	2	6	660095	660100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461848
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12993	NC_020971	AATC	2	8	660167	660174	50 %	25 %	0 %	25 %	478461848
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