MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/Bour complete genome

Total Repeats: 20347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020971	GAA	2	6	27809	27814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461271
502	NC_020971	GGGC	2	8	27875	27882	0 %	0 %	75 %	25 %	478461271
503	NC_020971	T	6	6	27891	27896	0 %	100 %	0 %	0 %	478461271
504	NC_020971	TGA	2	6	27904	27909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461271
505	NC_020971	GGAGA	2	10	27912	27921	40 %	0 %	60 %	0 %	478461271
506	NC_020971	A	7	7	27962	27968	100 %	0 %	0 %	0 %	478461271
507	NC_020971	AAG	2	6	27979	27984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461271
508	NC_020971	T	6	6	27999	28004	0 %	100 %	0 %	0 %	478461271
509	NC_020971	A	8	8	28096	28103	100 %	0 %	0 %	0 %	478461272
510	NC_020971	TTC	2	6	28140	28145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461272
511	NC_020971	GTTT	2	8	28158	28165	0 %	75 %	25 %	0 %	478461272
512	NC_020971	CAGA	2	8	28180	28187	50 %	0 %	25 %	25 %	478461272
513	NC_020971	TTC	2	6	28258	28263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461272
514	NC_020971	AAG	2	6	28273	28278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461272
515	NC_020971	TTC	2	6	28373	28378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461272
516	NC_020971	AAG	2	6	28387	28392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461272
517	NC_020971	AAG	2	6	28405	28410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461272
518	NC_020971	A	6	6	28411	28416	100 %	0 %	0 %	0 %	478461272
519	NC_020971	GAA	2	6	28643	28648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461273
520	NC_020971	ATCCG	2	10	28663	28672	20 %	20 %	20 %	40 %	478461273
521	NC_020971	TTC	2	6	28776	28781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461273
522	NC_020971	TAG	2	6	28824	28829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461273
523	NC_020971	AGA	2	6	28837	28842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461273
524	NC_020971	GAT	3	9	28919	28927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461273
525	NC_020971	GAG	2	6	28962	28967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461273
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529	NC_020971	AGGGT	2	10	29181	29190	20 %	20 %	60 %	0 %	478461273
530	NC_020971	TTC	2	6	29217	29222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461273
531	NC_020971	CAG	2	6	29229	29234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461273
532	NC_020971	GAA	2	6	29243	29248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461273
533	NC_020971	TGA	2	6	29257	29262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461273
534	NC_020971	TTC	2	6	29290	29295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461273
535	NC_020971	GC	4	8	29461	29468	0 %	0 %	50 %	50 %	478461273
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537	NC_020971	TA	3	6	29583	29588	50 %	50 %	0 %	0 %	478461273
538	NC_020971	GAA	2	6	29672	29677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461273
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540	NC_020971	TCT	2	6	29772	29777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461274
541	NC_020971	ACA	2	6	30000	30005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461274
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543	NC_020971	CTTT	2	8	30152	30159	0 %	75 %	0 %	25 %	478461274
544	NC_020971	TTTG	2	8	30167	30174	0 %	75 %	25 %	0 %	478461274
545	NC_020971	TTGT	2	8	30202	30209	0 %	75 %	25 %	0 %	478461274
546	NC_020971	CCTAT	2	10	30221	30230	20 %	40 %	0 %	40 %	478461274
547	NC_020971	T	6	6	30237	30242	0 %	100 %	0 %	0 %	478461274
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551	NC_020971	ATG	2	6	30496	30501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461274
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557	NC_020971	TCT	2	6	30788	30793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461275
558	NC_020971	ACT	2	6	30878	30883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461275
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561	NC_020971	CCT	2	6	30942	30947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478461275
562	NC_020971	AAAC	2	8	30995	31002	75 %	0 %	0 %	25 %	478461275
563	NC_020971	T	6	6	31012	31017	0 %	100 %	0 %	0 %	478461275
564	NC_020971	AAGGA	2	10	31021	31030	60 %	0 %	40 %	0 %	478461275
565	NC_020971	GGC	2	6	31048	31053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478461275
566	NC_020971	GAT	2	6	31127	31132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461275
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568	NC_020971	TAG	2	6	31149	31154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461275
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582	NC_020971	A	7	7	31853	31859	100 %	0 %	0 %	0 %	478461275
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599	NC_020971	GCG	2	6	32656	32661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478461277
600	NC_020971	CT	3	6	32736	32741	0 %	50 %	0 %	50 %	478461277
601	NC_020971	AGA	2	6	32834	32839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461277
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