MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/Bour complete genome

Total Repeats: 20347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_020971	ACT	2	6	308753	308758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461526
6003	NC_020971	GA	3	6	308798	308803	50 %	0 %	50 %	0 %	478461526
6004	NC_020971	ATT	2	6	308855	308860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461526
6005	NC_020971	GAA	2	6	308900	308905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461526
6006	NC_020971	TG	3	6	309008	309013	0 %	50 %	50 %	0 %	478461526
6007	NC_020971	TG	3	6	309030	309035	0 %	50 %	50 %	0 %	478461526
6008	NC_020971	TTC	2	6	309123	309128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461527
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6010	NC_020971	CTG	2	6	309176	309181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461527
6011	NC_020971	CTTTT	2	10	309191	309200	0 %	80 %	0 %	20 %	478461527
6012	NC_020971	TC	3	6	309264	309269	0 %	50 %	0 %	50 %	478461527
6013	NC_020971	GAA	2	6	309280	309285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461527
6014	NC_020971	AGC	2	6	309333	309338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461527
6015	NC_020971	AG	3	6	309429	309434	50 %	0 %	50 %	0 %	478461527
6016	NC_020971	TAC	2	6	309533	309538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461527
6017	NC_020971	CGC	2	6	309541	309546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478461527
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6019	NC_020971	TC	3	6	309563	309568	0 %	50 %	0 %	50 %	478461527
6020	NC_020971	GCA	2	6	309588	309593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461527
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6023	NC_020971	TAA	2	6	309669	309674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461527
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6034	NC_020971	CTA	2	6	310214	310219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461528
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6041	NC_020971	AAC	2	6	310640	310645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461528
6042	NC_020971	ACT	2	6	310660	310665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461528
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6045	NC_020971	GA	3	6	310799	310804	50 %	0 %	50 %	0 %	478461528
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6048	NC_020971	T	6	6	310896	310901	0 %	100 %	0 %	0 %	478461528
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6052	NC_020971	ATT	2	6	311187	311192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461528
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6058	NC_020971	CTC	2	6	311510	311515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478461529
6059	NC_020971	TCTT	2	8	311592	311599	0 %	75 %	0 %	25 %	478461529
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6062	NC_020971	TTC	2	6	311768	311773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461529
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6114	NC_020971	A	6	6	314223	314228	100 %	0 %	0 %	0 %	478461533
6115	NC_020971	CTAA	2	8	314273	314280	50 %	25 %	0 %	25 %	478461533
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6118	NC_020971	T	7	7	314386	314392	0 %	100 %	0 %	0 %	478461533
6119	NC_020971	CTT	2	6	314409	314414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461533
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6245	NC_020971	GCA	2	6	320380	320385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461536
6246	NC_020971	GGA	2	6	320405	320410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461536
6247	NC_020971	GAT	2	6	320470	320475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461536
6248	NC_020971	TCC	2	6	320482	320487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478461536
6249	NC_020971	AT	3	6	320491	320496	50 %	50 %	0 %	0 %	478461536
6250	NC_020971	CGC	2	6	320537	320542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478461536
6251	NC_020971	TGTGT	2	10	320549	320558	0 %	60 %	40 %	0 %	478461536
6252	NC_020971	TGA	2	6	320563	320568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461536
6253	NC_020971	CAT	3	9	320671	320679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461536
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6255	NC_020971	TGC	2	6	320782	320787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461536
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6259	NC_020971	GGA	2	6	321031	321036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461536
6260	NC_020971	AAG	2	6	321075	321080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461536
6261	NC_020971	CG	4	8	321092	321099	0 %	0 %	50 %	50 %	478461536
6262	NC_020971	AGA	2	6	321106	321111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461536
6263	NC_020971	GTT	2	6	321116	321121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461536
6264	NC_020971	AGA	3	9	321130	321138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461536
6265	NC_020971	TGA	2	6	321190	321195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461536
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6267	NC_020971	TAAAG	2	10	321436	321445	60 %	20 %	20 %	0 %	478461537
6268	NC_020971	GAT	2	6	321446	321451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461537
6269	NC_020971	TCC	2	6	321522	321527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478461537
6270	NC_020971	TAA	2	6	321559	321564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461537
6271	NC_020971	TGT	2	6	321592	321597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461537
6272	NC_020971	AAT	2	6	321609	321614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461537
6273	NC_020971	T	7	7	321696	321702	0 %	100 %	0 %	0 %	478461537
6274	NC_020971	CTT	2	6	321722	321727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461537
6275	NC_020971	CTC	2	6	321872	321877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478461537
6276	NC_020971	AAT	2	6	321881	321886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461537
6277	NC_020971	A	6	6	321898	321903	100 %	0 %	0 %	0 %	478461537
6278	NC_020971	CTT	2	6	321924	321929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461537
6279	NC_020971	TAA	2	6	321933	321938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461537
6280	NC_020971	ATGGA	2	10	322061	322070	40 %	20 %	40 %	0 %	478461537
6281	NC_020971	CAA	2	6	322166	322171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461537
6282	NC_020971	CTT	2	6	322188	322193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461537
6283	NC_020971	CAA	2	6	322205	322210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461537
6284	NC_020971	CTC	2	6	322223	322228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478461537
6285	NC_020971	CAA	2	6	322238	322243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461537
6286	NC_020971	TCA	2	6	322507	322512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461538
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6301	NC_020971	TA	3	6	323208	323213	50 %	50 %	0 %	0 %	478461538
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6322	NC_020971	ATG	2	6	324083	324088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461538
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6324	NC_020971	CT	3	6	324134	324139	0 %	50 %	0 %	50 %	478461538
6325	NC_020971	ACA	2	6	324145	324150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478461538
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6330	NC_020971	AAG	2	6	324426	324431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461539
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6332	NC_020971	TGA	2	6	324470	324475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461539
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6335	NC_020971	TCA	2	6	324593	324598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461539
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6343	NC_020971	ATC	2	6	324973	324978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461539
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6345	NC_020971	T	6	6	325036	325041	0 %	100 %	0 %	0 %	478461539
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6351	NC_020971	T	7	7	325206	325212	0 %	100 %	0 %	0 %	478461539
6352	NC_020971	T	6	6	325219	325224	0 %	100 %	0 %	0 %	478461539
6353	NC_020971	TAG	2	6	325287	325292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461539
6354	NC_020971	CAT	2	6	325387	325392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461539
6355	NC_020971	AAGA	2	8	325555	325562	75 %	0 %	25 %	0 %	478461540
6356	NC_020971	AAG	2	6	325640	325645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461540
6357	NC_020971	AAT	2	6	325714	325719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461540
6358	NC_020971	AAG	2	6	325739	325744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461540
6359	NC_020971	TTA	2	6	325847	325852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461540
6360	NC_020971	TA	3	6	325855	325860	50 %	50 %	0 %	0 %	478461540
6361	NC_020971	AGC	2	6	325864	325869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461540
6362	NC_020971	CCTT	2	8	325883	325890	0 %	50 %	0 %	50 %	478461540
6363	NC_020971	T	6	6	325907	325912	0 %	100 %	0 %	0 %	478461540
6364	NC_020971	CCCCT	2	10	325917	325926	0 %	20 %	0 %	80 %	478461540
6365	NC_020971	CTT	2	6	326037	326042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461540
6366	NC_020971	TCC	2	6	326086	326091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478461540
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6493	NC_020971	AGG	3	9	332298	332306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461548
6494	NC_020971	GAG	2	6	332336	332341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461548
6495	NC_020971	TAC	2	6	332366	332371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461548
6496	NC_020971	GAA	2	6	332428	332433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461548
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6500	NC_020971	GA	3	6	332628	332633	50 %	0 %	50 %	0 %	478461548

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