MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/Bour complete genome

Total Repeats: 20347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_020971	TTC	2	6	258610	258615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461481
5003	NC_020971	ATT	2	6	258633	258638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461481
5004	NC_020971	CT	3	6	258666	258671	0 %	50 %	0 %	50 %	478461481
5005	NC_020971	AGG	2	6	258743	258748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478461481
5006	NC_020971	TAC	2	6	258783	258788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461481
5007	NC_020971	CTT	2	6	258818	258823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461481
5008	NC_020971	TAA	2	6	258980	258985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461481
5009	NC_020971	CTT	3	9	259167	259175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461481
5010	NC_020971	AAAC	2	8	259197	259204	75 %	0 %	0 %	25 %	478461481
5011	NC_020971	AAT	2	6	259242	259247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478461481
5012	NC_020971	TTTCT	2	10	259252	259261	0 %	80 %	0 %	20 %	478461481
5013	NC_020971	TTTA	2	8	259359	259366	25 %	75 %	0 %	0 %	478461481
5014	NC_020971	TC	3	6	259406	259411	0 %	50 %	0 %	50 %	478461481
5015	NC_020971	T	6	6	259416	259421	0 %	100 %	0 %	0 %	478461481
5016	NC_020971	TCT	3	9	259429	259437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461481
5017	NC_020971	GGC	2	6	259451	259456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478461481
5018	NC_020971	GAT	2	6	259466	259471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461481
5019	NC_020971	TCT	2	6	259484	259489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461481
5020	NC_020971	A	6	6	259518	259523	100 %	0 %	0 %	0 %	478461481
5021	NC_020971	TCT	2	6	259536	259541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461481
5022	NC_020971	TGC	2	6	259550	259555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461481
5023	NC_020971	T	6	6	259593	259598	0 %	100 %	0 %	0 %	478461481
5024	NC_020971	TATT	2	8	259652	259659	25 %	75 %	0 %	0 %	478461481
5025	NC_020971	ACTT	2	8	259734	259741	25 %	50 %	0 %	25 %	478461481
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5039	NC_020971	TGCAA	2	10	260672	260681	40 %	20 %	20 %	20 %	478461483
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5041	NC_020971	A	6	6	260724	260729	100 %	0 %	0 %	0 %	478461483
5042	NC_020971	TGC	2	6	260798	260803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461483
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5045	NC_020971	CTGG	2	8	260880	260887	0 %	25 %	50 %	25 %	478461483
5046	NC_020971	TTG	2	6	260939	260944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478461483
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5054	NC_020971	CT	3	6	261324	261329	0 %	50 %	0 %	50 %	478461484
5055	NC_020971	TC	3	6	261340	261345	0 %	50 %	0 %	50 %	478461484
5056	NC_020971	CT	3	6	261352	261357	0 %	50 %	0 %	50 %	478461484
5057	NC_020971	ACCTTT	2	12	261391	261402	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478461484
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5059	NC_020971	T	6	6	261519	261524	0 %	100 %	0 %	0 %	478461484
5060	NC_020971	T	6	6	261584	261589	0 %	100 %	0 %	0 %	478461484
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5072	NC_020971	GAT	2	6	262131	262136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461484
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5097	NC_020971	GTTC	2	8	263132	263139	0 %	50 %	25 %	25 %	478461484
5098	NC_020971	CT	3	6	263195	263200	0 %	50 %	0 %	50 %	478461484
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5107	NC_020971	CCTTT	2	10	263718	263727	0 %	60 %	0 %	40 %	478461484
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5110	NC_020971	A	6	6	263818	263823	100 %	0 %	0 %	0 %	478461484
5111	NC_020971	TAT	2	6	263830	263835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461484
5112	NC_020971	A	7	7	263917	263923	100 %	0 %	0 %	0 %	478461485
5113	NC_020971	TG	3	6	264061	264066	0 %	50 %	50 %	0 %	478461485
5114	NC_020971	GAA	2	6	264127	264132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461485
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5121	NC_020971	AGA	2	6	264514	264519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478461486
5122	NC_020971	CAT	2	6	264576	264581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478461486
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5124	NC_020971	TTC	2	6	265050	265055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461487
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5245	NC_020971	GAC	2	6	271416	271421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478461492
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5493	NC_020971	TCT	2	6	283214	283219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478461501
5494	NC_020971	AGT	2	6	283228	283233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478461501
5495	NC_020971	GCT	2	6	283260	283265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478461501
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5497	NC_020971	CT	3	6	283304	283309	0 %	50 %	0 %	50 %	478461501
5498	NC_020971	TAT	2	6	283323	283328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478461501
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