MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa1 complete genome

Total Repeats: 20362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020970	TCGA	2	8	54914	54921	25 %	25 %	25 %	25 %	478460403
1003	NC_020970	GGA	2	6	54948	54953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478460403
1004	NC_020970	ATG	2	6	54954	54959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460403
1005	NC_020970	CTTC	2	8	54999	55006	0 %	50 %	0 %	50 %	478460403
1006	NC_020970	GAAT	2	8	55034	55041	50 %	25 %	25 %	0 %	478460403
1007	NC_020970	TGT	2	6	55070	55075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478460403
1008	NC_020970	GAT	2	6	55098	55103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460403
1009	NC_020970	TTGA	2	8	55104	55111	25 %	50 %	25 %	0 %	478460403
1010	NC_020970	GTA	2	6	55144	55149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460403
1011	NC_020970	TCA	2	6	55159	55164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460403
1012	NC_020970	GAG	2	6	55182	55187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478460403
1013	NC_020970	TCAGA	2	10	55197	55206	40 %	20 %	20 %	20 %	478460403
1014	NC_020970	A	6	6	55296	55301	100 %	0 %	0 %	0 %	478460403
1015	NC_020970	G	6	6	55352	55357	0 %	0 %	100 %	0 %	478460403
1016	NC_020970	GGAA	2	8	55463	55470	50 %	0 %	50 %	0 %	478460403
1017	NC_020970	GATCTG	2	12	55486	55497	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478460403
1018	NC_020970	GTGTAA	2	12	55534	55545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460403
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1021	NC_020970	GGTTCA	2	12	55623	55634	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478460403
1022	NC_020970	TTATC	2	10	55724	55733	20 %	60 %	0 %	20 %	478460403
1023	NC_020970	TGAGT	2	10	55745	55754	20 %	40 %	40 %	0 %	478460403
1024	NC_020970	TCA	3	9	55758	55766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478460403
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1027	NC_020970	GAG	2	6	55825	55830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478460403
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1030	NC_020970	TTA	2	6	56084	56089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478460403
1031	NC_020970	TGG	2	6	56260	56265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478460404
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1033	NC_020970	CTGG	3	12	56362	56373	0 %	25 %	50 %	25 %	478460404
1034	NC_020970	ATT	2	6	56377	56382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478460404
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1041	NC_020970	T	6	6	56551	56556	0 %	100 %	0 %	0 %	478460404
1042	NC_020970	GTA	2	6	56582	56587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460404
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1045	NC_020970	GTTGT	2	10	56792	56801	0 %	60 %	40 %	0 %	478460404
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1051	NC_020970	CT	3	6	57004	57009	0 %	50 %	0 %	50 %	478460404
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1055	NC_020970	TGT	2	6	57063	57068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478460404
1056	NC_020970	AGT	2	6	57073	57078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460404
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1059	NC_020970	T	6	6	57236	57241	0 %	100 %	0 %	0 %	478460404
1060	NC_020970	TTTG	2	8	57310	57317	0 %	75 %	25 %	0 %	478460404
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1095	NC_020970	T	6	6	58979	58984	0 %	100 %	0 %	0 %	478460405
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1107	NC_020970	TGAA	2	8	59455	59462	50 %	25 %	25 %	0 %	478460405
1108	NC_020970	TGT	2	6	59469	59474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478460405
1109	NC_020970	T	8	8	59532	59539	0 %	100 %	0 %	0 %	478460405
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1111	NC_020970	T	6	6	59563	59568	0 %	100 %	0 %	0 %	478460405
1112	NC_020970	TGAAAA	2	12	59623	59634	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478460406
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1117	NC_020970	GGAG	2	8	59843	59850	25 %	0 %	75 %	0 %	478460406
1118	NC_020970	GTAA	2	8	59895	59902	50 %	25 %	25 %	0 %	478460406
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1122	NC_020970	TAG	2	6	60070	60075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478460406
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