MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 complte genome

Total Repeats: 20358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020969	CTT	2	6	54492	54497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473013
1003	NC_020969	A	7	7	54599	54605	100 %	0 %	0 %	0 %	478473014
1004	NC_020969	TTC	2	6	54622	54627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473014
1005	NC_020969	CAC	2	6	54751	54756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478473014
1006	NC_020969	CAA	2	6	54785	54790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473014
1007	NC_020969	GAA	2	6	54812	54817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473014
1008	NC_020969	CT	3	6	54836	54841	0 %	50 %	0 %	50 %	478473014
1009	NC_020969	TCGA	2	8	54871	54878	25 %	25 %	25 %	25 %	478473014
1010	NC_020969	CTTC	2	8	54965	54972	0 %	50 %	0 %	50 %	478473014
1011	NC_020969	GAAT	2	8	55000	55007	50 %	25 %	25 %	0 %	478473014
1012	NC_020969	TGT	2	6	55036	55041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473014
1013	NC_020969	TGAT	2	8	55071	55078	25 %	50 %	25 %	0 %	478473014
1014	NC_020969	AGC	2	6	55119	55124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473014
1015	NC_020969	TCA	2	6	55125	55130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473014
1016	NC_020969	A	6	6	55259	55264	100 %	0 %	0 %	0 %	478473014
1017	NC_020969	G	6	6	55315	55320	0 %	0 %	100 %	0 %	478473014
1018	NC_020969	GGAA	2	8	55426	55433	50 %	0 %	50 %	0 %	478473014
1019	NC_020969	GATCTG	2	12	55461	55472	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478473014
1020	NC_020969	GTGTAA	2	12	55509	55520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473014
1021	NC_020969	GCA	2	6	55523	55528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473014
1022	NC_020969	GGTTCA	2	12	55598	55609	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478473014
1023	NC_020969	TTATC	2	10	55699	55708	20 %	60 %	0 %	20 %	478473014
1024	NC_020969	GGA	2	6	55799	55804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478473014
1025	NC_020969	TGC	2	6	55834	55839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473014
1026	NC_020969	GTA	2	6	55877	55882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473014
1027	NC_020969	GAGT	2	8	55995	56002	25 %	25 %	50 %	0 %	478473014
1028	NC_020969	AT	3	6	56044	56049	50 %	50 %	0 %	0 %	478473014
1029	NC_020969	TTA	2	6	56059	56064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473014
1030	NC_020969	GTT	2	6	56227	56232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473015
1031	NC_020969	TGT	2	6	56277	56282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473015
1032	NC_020969	CTGG	3	12	56337	56348	0 %	25 %	50 %	25 %	478473015
1033	NC_020969	ATT	2	6	56352	56357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473015
1034	NC_020969	GAT	2	6	56365	56370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473015
1035	NC_020969	TCT	2	6	56383	56388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473015
1036	NC_020969	TCC	2	6	56418	56423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473015
1037	NC_020969	TTA	2	6	56431	56436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473015
1038	NC_020969	TTGC	2	8	56474	56481	0 %	50 %	25 %	25 %	478473015
1039	NC_020969	CGAG	2	8	56516	56523	25 %	0 %	50 %	25 %	478473015
1040	NC_020969	T	6	6	56526	56531	0 %	100 %	0 %	0 %	478473015
1041	NC_020969	GTA	2	6	56557	56562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473015
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1045	NC_020969	GTTGT	2	10	56767	56776	0 %	60 %	40 %	0 %	478473015
1046	NC_020969	T	6	6	56822	56827	0 %	100 %	0 %	0 %	478473015
1047	NC_020969	A	7	7	56864	56870	100 %	0 %	0 %	0 %	478473015
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1051	NC_020969	CT	3	6	56979	56984	0 %	50 %	0 %	50 %	478473015
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1053	NC_020969	TGG	2	6	57015	57020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478473015
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1055	NC_020969	AGT	2	6	57048	57053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473015
1056	NC_020969	GTT	2	6	57141	57146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473015
1057	NC_020969	T	6	6	57145	57150	0 %	100 %	0 %	0 %	478473015
1058	NC_020969	AGA	2	6	57301	57306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473015
1059	NC_020969	CAG	2	6	57464	57469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473015
1060	NC_020969	TTG	2	6	57486	57491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473015
1061	NC_020969	TGT	2	6	57564	57569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473015
1062	NC_020969	TG	3	6	57667	57672	0 %	50 %	50 %	0 %	478473015
1063	NC_020969	GGTT	2	8	57676	57683	0 %	50 %	50 %	0 %	478473015
1064	NC_020969	TAA	2	6	57732	57737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478473015
1065	NC_020969	ACT	2	6	57748	57753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473015
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1068	NC_020969	ATT	2	6	57783	57788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473015
1069	NC_020969	T	6	6	57787	57792	0 %	100 %	0 %	0 %	478473015
1070	NC_020969	ATT	2	6	57802	57807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473015
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1073	NC_020969	GAT	2	6	58058	58063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473016
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1075	NC_020969	GAG	2	6	58094	58099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478473016
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1078	NC_020969	CAT	2	6	58308	58313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473016
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1083	NC_020969	CT	3	6	58551	58556	0 %	50 %	0 %	50 %	478473016
1084	NC_020969	AGGT	2	8	58580	58587	25 %	25 %	50 %	0 %	478473016
1085	NC_020969	ATT	2	6	58675	58680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473016
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1097	NC_020969	TCT	3	9	59093	59101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473016
1098	NC_020969	GGAA	2	8	59128	59135	50 %	0 %	50 %	0 %	478473016
1099	NC_020969	GCT	2	6	59157	59162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473016
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1109	NC_020969	CGTT	2	8	59738	59745	0 %	50 %	25 %	25 %	478473017
1110	NC_020969	GGAG	2	8	59747	59754	25 %	0 %	75 %	0 %	478473017
1111	NC_020969	GTAA	2	8	59799	59806	50 %	25 %	25 %	0 %	478473017
1112	NC_020969	TCCTAA	2	12	59866	59877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473017
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1114	NC_020969	T	6	6	59927	59932	0 %	100 %	0 %	0 %	478473017
1115	NC_020969	AGC	2	6	59975	59980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473017
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1121	NC_020969	CAA	2	6	60135	60140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473017
1122	NC_020969	ATAA	2	8	60172	60179	75 %	25 %	0 %	0 %	478473017
1123	NC_020969	GAGCA	2	10	60212	60221	40 %	0 %	40 %	20 %	478473017
1124	NC_020969	GT	3	6	60250	60255	0 %	50 %	50 %	0 %	478473017
1125	NC_020969	TAG	2	6	60262	60267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473017
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