MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE4 complte genome

Total Repeats: 20358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_020969	TCT	2	6	283876	283881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473212
5503	NC_020969	ATTC	2	8	283910	283917	25 %	50 %	0 %	25 %	478473212
5504	NC_020969	ATG	2	6	283937	283942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473212
5505	NC_020969	CTA	2	6	284033	284038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473212
5506	NC_020969	CTT	2	6	284096	284101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473212
5507	NC_020969	AAG	2	6	284168	284173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473212
5508	NC_020969	CAG	2	6	284214	284219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478473212
5509	NC_020969	CTC	2	6	284268	284273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473212
5510	NC_020969	TAC	2	6	284292	284297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473212
5511	NC_020969	GCT	2	6	284342	284347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473212
5512	NC_020969	GAA	2	6	284388	284393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473212
5513	NC_020969	ATA	2	6	284435	284440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478473212
5514	NC_020969	CGTT	2	8	284442	284449	0 %	50 %	25 %	25 %	478473212
5515	NC_020969	ATTC	2	8	284451	284458	25 %	50 %	0 %	25 %	478473212
5516	NC_020969	CAT	2	6	284770	284775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473213
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5520	NC_020969	CTG	2	6	284939	284944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473213
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5523	NC_020969	CAC	2	6	285255	285260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478473213
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5525	NC_020969	CTCC	2	8	285337	285344	0 %	25 %	0 %	75 %	478473213
5526	NC_020969	AAGC	2	8	285359	285366	50 %	0 %	25 %	25 %	478473213
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5536	NC_020969	GTC	2	6	285973	285978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473214
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5542	NC_020969	CTCCTA	2	12	286142	286153	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478473214
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5545	NC_020969	ATC	2	6	286367	286372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473214
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5547	NC_020969	TTCGA	2	10	286396	286405	20 %	40 %	20 %	20 %	478473214
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5606	NC_020969	TG	3	6	289245	289250	0 %	50 %	50 %	0 %	478473217
5607	NC_020969	TA	3	6	289260	289265	50 %	50 %	0 %	0 %	478473217
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