MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020968	T	8	8	79671	79678	0 %	100 %	0 %	0 %	478459519
1503	NC_020968	ATG	2	6	79687	79692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459519
1504	NC_020968	GCC	2	6	79699	79704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478459519
1505	NC_020968	TCC	2	6	79747	79752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459519
1506	NC_020968	GCT	2	6	79779	79784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459519
1507	NC_020968	TCT	2	6	79790	79795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459519
1508	NC_020968	T	7	7	80484	80490	0 %	100 %	0 %	0 %	478459520
1509	NC_020968	TGA	2	6	80589	80594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459520
1510	NC_020968	TGTCT	2	10	80604	80613	0 %	60 %	20 %	20 %	478459520
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1513	NC_020968	T	6	6	80756	80761	0 %	100 %	0 %	0 %	478459520
1514	NC_020968	GGTTTA	2	12	80767	80778	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478459520
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1519	NC_020968	GAA	2	6	80980	80985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459520
1520	NC_020968	GGA	2	6	81024	81029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459520
1521	NC_020968	TC	4	8	81052	81059	0 %	50 %	0 %	50 %	478459520
1522	NC_020968	A	7	7	81071	81077	100 %	0 %	0 %	0 %	478459520
1523	NC_020968	TTACT	2	10	81111	81120	20 %	60 %	0 %	20 %	478459520
1524	NC_020968	TATC	2	8	81127	81134	25 %	50 %	0 %	25 %	478459520
1525	NC_020968	GA	3	6	81145	81150	50 %	0 %	50 %	0 %	478459520
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1531	NC_020968	GCT	2	6	81560	81565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459521
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1535	NC_020968	CAT	2	6	81677	81682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459521
1536	NC_020968	TGA	2	6	81799	81804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459521
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1539	NC_020968	CT	3	6	81875	81880	0 %	50 %	0 %	50 %	478459521
1540	NC_020968	GGA	2	6	81881	81886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459521
1541	NC_020968	CAA	2	6	81887	81892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459521
1542	NC_020968	AG	3	6	81894	81899	50 %	0 %	50 %	0 %	478459521
1543	NC_020968	T	6	6	81901	81906	0 %	100 %	0 %	0 %	478459521
1544	NC_020968	CGAT	2	8	81963	81970	25 %	25 %	25 %	25 %	478459521
1545	NC_020968	TCAT	2	8	82038	82045	25 %	50 %	0 %	25 %	478459521
1546	NC_020968	TTA	2	6	82088	82093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459521
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1554	NC_020968	TTA	2	6	82346	82351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459522
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1556	NC_020968	TTA	2	6	82443	82448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459522
1557	NC_020968	T	6	6	82451	82456	0 %	100 %	0 %	0 %	478459522
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1559	NC_020968	TTTAGT	2	12	82540	82551	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	478459522
1560	NC_020968	T	6	6	82556	82561	0 %	100 %	0 %	0 %	478459522
1561	NC_020968	GTTA	2	8	82580	82587	25 %	50 %	25 %	0 %	478459522
1562	NC_020968	ACA	2	6	82614	82619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459522
1563	NC_020968	GCG	2	6	82646	82651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478459522
1564	NC_020968	T	6	6	82689	82694	0 %	100 %	0 %	0 %	478459522
1565	NC_020968	TGG	3	9	82715	82723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478459522
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1569	NC_020968	GTG	2	6	82836	82841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478459522
1570	NC_020968	CCT	2	6	82886	82891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459522
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1589	NC_020968	T	6	6	83647	83652	0 %	100 %	0 %	0 %	478459523
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1592	NC_020968	TATG	2	8	83768	83775	25 %	50 %	25 %	0 %	478459523
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1598	NC_020968	ACTG	2	8	83891	83898	25 %	25 %	25 %	25 %	478459523
1599	NC_020968	CATT	2	8	83906	83913	25 %	50 %	0 %	25 %	478459523
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1602	NC_020968	TC	3	6	83967	83972	0 %	50 %	0 %	50 %	478459523
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1606	NC_020968	TTG	2	6	84235	84240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459523
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1609	NC_020968	CTA	2	6	84450	84455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459523
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1611	NC_020968	TAAG	2	8	84527	84534	50 %	25 %	25 %	0 %	478459523
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1623	NC_020968	A	6	6	85055	85060	100 %	0 %	0 %	0 %	478459524
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