MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020968	A	7	7	54719	54725	100 %	0 %	0 %	0 %	478459502
1003	NC_020968	TTC	2	6	54742	54747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459502
1004	NC_020968	CAG	2	6	54786	54791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459502
1005	NC_020968	GGAT	2	8	54862	54869	25 %	25 %	50 %	0 %	478459502
1006	NC_020968	CAA	2	6	54938	54943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459502
1007	NC_020968	GAA	2	6	54965	54970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459502
1008	NC_020968	CT	3	6	54989	54994	0 %	50 %	0 %	50 %	478459502
1009	NC_020968	TCGA	2	8	55024	55031	25 %	25 %	25 %	25 %	478459502
1010	NC_020968	GGA	2	6	55058	55063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459502
1011	NC_020968	ATG	2	6	55064	55069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459502
1012	NC_020968	CTTC	2	8	55109	55116	0 %	50 %	0 %	50 %	478459502
1013	NC_020968	GAAT	2	8	55144	55151	50 %	25 %	25 %	0 %	478459502
1014	NC_020968	TGT	2	6	55180	55185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459502
1015	NC_020968	GAT	2	6	55208	55213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459502
1016	NC_020968	TTGA	2	8	55214	55221	25 %	50 %	25 %	0 %	478459502
1017	NC_020968	GTA	2	6	55254	55259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459502
1018	NC_020968	TCA	2	6	55269	55274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459502
1019	NC_020968	GAG	2	6	55292	55297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459502
1020	NC_020968	TCAGA	2	10	55307	55316	40 %	20 %	20 %	20 %	478459502
1021	NC_020968	A	6	6	55406	55411	100 %	0 %	0 %	0 %	478459502
1022	NC_020968	G	6	6	55462	55467	0 %	0 %	100 %	0 %	478459502
1023	NC_020968	GGAA	2	8	55573	55580	50 %	0 %	50 %	0 %	478459502
1024	NC_020968	GATCTG	2	12	55596	55607	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478459502
1025	NC_020968	GTGTAA	2	12	55644	55655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459502
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1028	NC_020968	GGTTCA	2	12	55733	55744	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478459502
1029	NC_020968	TTATC	2	10	55834	55843	20 %	60 %	0 %	20 %	478459502
1030	NC_020968	TGAGT	2	10	55855	55864	20 %	40 %	40 %	0 %	478459502
1031	NC_020968	TCA	3	9	55868	55876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459502
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1033	NC_020968	CTG	2	6	55929	55934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459502
1034	NC_020968	GAG	2	6	55935	55940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459502
1035	NC_020968	TGC	2	6	55969	55974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459502
1036	NC_020968	AT	3	6	56179	56184	50 %	50 %	0 %	0 %	478459502
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1040	NC_020968	CTGG	3	12	56472	56483	0 %	25 %	50 %	25 %	478459503
1041	NC_020968	ATT	2	6	56487	56492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459503
1042	NC_020968	GAT	2	6	56500	56505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459503
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1044	NC_020968	TCC	2	6	56553	56558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459503
1045	NC_020968	TTA	2	6	56566	56571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459503
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1048	NC_020968	T	6	6	56661	56666	0 %	100 %	0 %	0 %	478459503
1049	NC_020968	GTA	2	6	56692	56697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459503
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1053	NC_020968	T	6	6	56957	56962	0 %	100 %	0 %	0 %	478459503
1054	NC_020968	GAAAAG	2	12	56992	57003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459503
1055	NC_020968	TCC	2	6	57007	57012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459503
1056	NC_020968	AGT	3	9	57096	57104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459503
1057	NC_020968	AGCT	2	8	57108	57115	25 %	25 %	25 %	25 %	478459503
1058	NC_020968	CT	3	6	57114	57119	0 %	50 %	0 %	50 %	478459503
1059	NC_020968	GAG	2	6	57127	57132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459503
1060	NC_020968	TGG	2	6	57150	57155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478459503
1061	NC_020968	GT	3	6	57164	57169	0 %	50 %	50 %	0 %	478459503
1062	NC_020968	TGT	2	6	57173	57178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459503
1063	NC_020968	AGT	2	6	57183	57188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459503
1064	NC_020968	GAA	2	6	57226	57231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459503
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1067	NC_020968	AGA	2	6	57502	57507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459503
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1072	NC_020968	GTTG	2	8	57878	57885	0 %	50 %	50 %	0 %	478459503
1073	NC_020968	TAA	2	6	57933	57938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459503
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1083	NC_020968	GTT	2	6	58187	58192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459504
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1095	NC_020968	GTT	2	6	58761	58766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459504
1096	NC_020968	AGGT	2	8	58781	58788	25 %	25 %	50 %	0 %	478459504
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1102	NC_020968	GCT	2	6	59171	59176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459504
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1107	NC_020968	T	6	6	59283	59288	0 %	100 %	0 %	0 %	478459504
1108	NC_020968	CTT	2	6	59301	59306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459504
1109	NC_020968	TTC	2	6	59332	59337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459504
1110	NC_020968	TGG	2	6	59358	59363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478459504
1111	NC_020968	TCC	2	6	59419	59424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459504
1112	NC_020968	TAGA	2	8	59460	59467	50 %	25 %	25 %	0 %	478459504
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1115	NC_020968	T	8	8	59642	59649	0 %	100 %	0 %	0 %	478459504
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1117	NC_020968	T	6	6	59673	59678	0 %	100 %	0 %	0 %	478459504
1118	NC_020968	TGAAAA	2	12	59733	59744	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478459505
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1120	NC_020968	TCT	2	6	59761	59766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459505
1121	NC_020968	T	6	6	59793	59798	0 %	100 %	0 %	0 %	478459505
1122	NC_020968	CGTT	2	8	59944	59951	0 %	50 %	25 %	25 %	478459505
1123	NC_020968	GGAG	2	8	59953	59960	25 %	0 %	75 %	0 %	478459505
1124	NC_020968	GTAA	2	8	60005	60012	50 %	25 %	25 %	0 %	478459505
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