MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_020968	T	8	8	27750	27757	0 %	100 %	0 %	0 %	478459475
503	NC_020968	GAA	2	6	27808	27813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459475
504	NC_020968	GGGC	2	8	27874	27881	0 %	0 %	75 %	25 %	478459475
505	NC_020968	T	6	6	27890	27895	0 %	100 %	0 %	0 %	478459475
506	NC_020968	TGA	2	6	27903	27908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459475
507	NC_020968	GGAGA	2	10	27911	27920	40 %	0 %	60 %	0 %	478459475
508	NC_020968	GGATA	2	10	27937	27946	40 %	20 %	40 %	0 %	478459475
509	NC_020968	A	7	7	27961	27967	100 %	0 %	0 %	0 %	478459475
510	NC_020968	AAG	2	6	27978	27983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459475
511	NC_020968	T	6	6	27998	28003	0 %	100 %	0 %	0 %	478459475
512	NC_020968	A	8	8	28095	28102	100 %	0 %	0 %	0 %	478459476
513	NC_020968	TTC	2	6	28139	28144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459476
514	NC_020968	GTTT	2	8	28157	28164	0 %	75 %	25 %	0 %	478459476
515	NC_020968	CAGA	2	8	28179	28186	50 %	0 %	25 %	25 %	478459476
516	NC_020968	TTC	2	6	28257	28262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459476
517	NC_020968	AAG	2	6	28272	28277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459476
518	NC_020968	TTC	2	6	28372	28377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459476
519	NC_020968	AAG	2	6	28386	28391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459476
520	NC_020968	AAG	2	6	28404	28409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459476
521	NC_020968	A	6	6	28410	28415	100 %	0 %	0 %	0 %	478459476
522	NC_020968	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459477
523	NC_020968	ATCCG	2	10	28662	28671	20 %	20 %	20 %	40 %	478459477
524	NC_020968	TTC	2	6	28775	28780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459477
525	NC_020968	TAG	2	6	28823	28828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459477
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527	NC_020968	GAT	3	9	28918	28926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459477
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538	NC_020968	GC	4	8	29460	29467	0 %	0 %	50 %	50 %	478459477
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541	NC_020968	GAA	2	6	29671	29676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459477
542	NC_020968	TGT	2	6	29703	29708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459478
543	NC_020968	TCT	2	6	29771	29776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459478
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548	NC_020968	TTGT	2	8	30201	30208	0 %	75 %	25 %	0 %	478459478
549	NC_020968	CCTAT	2	10	30220	30229	20 %	40 %	0 %	40 %	478459478
550	NC_020968	T	6	6	30236	30241	0 %	100 %	0 %	0 %	478459478
551	NC_020968	ATC	2	6	30315	30320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459478
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554	NC_020968	ATG	2	6	30495	30500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459478
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560	NC_020968	TCT	2	6	30787	30792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459479
561	NC_020968	ACT	2	6	30877	30882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459479
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566	NC_020968	T	6	6	31011	31016	0 %	100 %	0 %	0 %	478459479
567	NC_020968	GAAGG	2	10	31019	31028	40 %	0 %	60 %	0 %	478459479
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