MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_020968	TTG	2	6	282035	282040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459702
5503	NC_020968	AGA	2	6	282059	282064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459702
5504	NC_020968	AAC	2	6	282117	282122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459702
5505	NC_020968	CAT	2	6	282125	282130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459702
5506	NC_020968	CTT	2	6	282142	282147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459702
5507	NC_020968	GTT	2	6	282154	282159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459702
5508	NC_020968	CAG	2	6	282187	282192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459702
5509	NC_020968	CTG	2	6	282200	282205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459702
5510	NC_020968	GAA	2	6	282235	282240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459702
5511	NC_020968	TATC	2	8	282310	282317	25 %	50 %	0 %	25 %	478459702
5512	NC_020968	AGCT	2	8	282331	282338	25 %	25 %	25 %	25 %	478459702
5513	NC_020968	CTG	2	6	282497	282502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459702
5514	NC_020968	ACG	2	6	282536	282541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459702
5515	NC_020968	TAA	2	6	282599	282604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459702
5516	NC_020968	ATA	2	6	282606	282611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459702
5517	NC_020968	ATA	2	6	282661	282666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459702
5518	NC_020968	TGC	2	6	282668	282673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459702
5519	NC_020968	GGA	2	6	282897	282902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459702
5520	NC_020968	AGA	2	6	282944	282949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459702
5521	NC_020968	GAG	2	6	283024	283029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459702
5522	NC_020968	GTT	2	6	283034	283039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459702
5523	NC_020968	TTC	2	6	283101	283106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459702
5524	NC_020968	TCT	2	6	283185	283190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459702
5525	NC_020968	AGT	2	6	283199	283204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459702
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5532	NC_020968	CT	3	6	283387	283392	0 %	50 %	0 %	50 %	478459702
5533	NC_020968	ATA	2	6	283430	283435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459702
5534	NC_020968	CT	3	6	283526	283531	0 %	50 %	0 %	50 %	478459702
5535	NC_020968	TCT	2	6	283566	283571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459702
5536	NC_020968	GTA	2	6	283658	283663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459702
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5538	NC_020968	TCT	2	6	283743	283748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459702
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5542	NC_020968	CAG	2	6	284081	284086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459702
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5544	NC_020968	TAC	2	6	284159	284164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459702
5545	NC_020968	GCT	2	6	284209	284214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459702
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5547	NC_020968	ATA	2	6	284302	284307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459702
5548	NC_020968	CGTT	2	8	284309	284316	0 %	50 %	25 %	25 %	478459702
5549	NC_020968	ATTC	2	8	284318	284325	25 %	50 %	0 %	25 %	478459702
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5555	NC_020968	CTG	2	6	284806	284811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459703
5556	NC_020968	CCA	2	6	284931	284936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478459703
5557	NC_020968	CAC	2	6	285122	285127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478459703
5558	NC_020968	CCT	2	6	285156	285161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459703
5559	NC_020968	CTCC	2	8	285204	285211	0 %	25 %	0 %	75 %	478459703
5560	NC_020968	AAGC	2	8	285226	285233	50 %	0 %	25 %	25 %	478459703
5561	NC_020968	ATG	2	6	285243	285248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459703
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5581	NC_020968	TTCGA	2	10	286263	286272	20 %	40 %	20 %	20 %	478459704
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5589	NC_020968	CTTT	2	8	286577	286584	0 %	75 %	0 %	25 %	478459705
5590	NC_020968	T	7	7	286582	286588	0 %	100 %	0 %	0 %	478459705
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5603	NC_020968	TCTTT	2	10	287020	287029	0 %	80 %	0 %	20 %	478459705
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5605	NC_020968	A	8	8	287128	287135	100 %	0 %	0 %	0 %	478459705
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5613	NC_020968	TA	3	6	287610	287615	50 %	50 %	0 %	0 %	478459706
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5993	NC_020968	TAC	2	6	306774	306779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459725
5994	NC_020968	C	6	6	306794	306799	0 %	0 %	0 %	100 %	478459725
5995	NC_020968	GCA	2	6	307079	307084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459726
5996	NC_020968	GCT	2	6	307118	307123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459726
5997	NC_020968	AGA	2	6	307167	307172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459726
5998	NC_020968	A	6	6	307181	307186	100 %	0 %	0 %	0 %	478459726
5999	NC_020968	A	6	6	307240	307245	100 %	0 %	0 %	0 %	478459726
6000	NC_020968	GTT	2	6	307300	307305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478459726

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