MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD6 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_020968	GAA	2	6	231166	231171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459656
4503	NC_020968	GC	3	6	231178	231183	0 %	0 %	50 %	50 %	478459656
4504	NC_020968	ATT	2	6	231226	231231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459656
4505	NC_020968	GCA	2	6	231339	231344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459656
4506	NC_020968	CTA	2	6	231380	231385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459656
4507	NC_020968	CATC	2	8	231395	231402	25 %	25 %	0 %	50 %	478459656
4508	NC_020968	TTA	2	6	231452	231457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459656
4509	NC_020968	TCT	3	9	231472	231480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459656
4510	NC_020968	A	6	6	231548	231553	100 %	0 %	0 %	0 %	478459656
4511	NC_020968	GCT	2	6	231607	231612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459656
4512	NC_020968	TCT	2	6	231742	231747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459656
4513	NC_020968	T	6	6	231921	231926	0 %	100 %	0 %	0 %	478459656
4514	NC_020968	GC	3	6	232080	232085	0 %	0 %	50 %	50 %	478459656
4515	NC_020968	GAC	2	6	232107	232112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478459656
4516	NC_020968	A	8	8	232149	232156	100 %	0 %	0 %	0 %	478459656
4517	NC_020968	TAA	2	6	232185	232190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478459656
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4519	NC_020968	GGA	2	6	232266	232271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478459656
4520	NC_020968	TGA	2	6	232281	232286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459656
4521	NC_020968	TCC	2	6	232290	232295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478459656
4522	NC_020968	AATG	2	8	232318	232325	50 %	25 %	25 %	0 %	478459656
4523	NC_020968	ATT	2	6	232367	232372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459656
4524	NC_020968	ATG	2	6	232413	232418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459657
4525	NC_020968	CAA	2	6	232419	232424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478459657
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4527	NC_020968	A	6	6	232519	232524	100 %	0 %	0 %	0 %	478459657
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4534	NC_020968	C	6	6	232916	232921	0 %	0 %	0 %	100 %	478459657
4535	NC_020968	A	6	6	232956	232961	100 %	0 %	0 %	0 %	478459657
4536	NC_020968	AAG	2	6	233017	233022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478459657
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4540	NC_020968	TCA	2	6	233138	233143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478459657
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4543	NC_020968	CTT	2	6	233325	233330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459658
4544	NC_020968	GCTA	2	8	233350	233357	25 %	25 %	25 %	25 %	478459658
4545	NC_020968	CTT	3	9	233412	233420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459658
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4551	NC_020968	ATT	2	6	233607	233612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478459658
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4553	NC_020968	A	6	6	233652	233657	100 %	0 %	0 %	0 %	478459658
4554	NC_020968	CAAAA	2	10	233659	233668	80 %	0 %	0 %	20 %	478459658
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4612	NC_020968	TTGA	2	8	237183	237190	25 %	50 %	25 %	0 %	478459660
4613	NC_020968	CTT	2	6	237195	237200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478459660
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4994	NC_020968	GCT	2	6	256733	256738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478459680
4995	NC_020968	ATTT	2	8	256790	256797	25 %	75 %	0 %	0 %	478459680
4996	NC_020968	TC	3	6	257042	257047	0 %	50 %	0 %	50 %	478459681
4997	NC_020968	A	6	6	257051	257056	100 %	0 %	0 %	0 %	478459681
4998	NC_020968	ATG	2	6	257062	257067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478459681
4999	NC_020968	ATCT	2	8	257111	257118	25 %	50 %	0 %	25 %	478459681
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