MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20343

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2231	NC_020967	T	7	7	116639	116645	0 %	100 %	0 %	0 %	478472158
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2241	NC_020967	A	6	6	117309	117314	100 %	0 %	0 %	0 %	478472158
2242	NC_020967	GTTC	2	8	117365	117372	0 %	50 %	25 %	25 %	478472158
2243	NC_020967	TAA	2	6	117385	117390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478472158
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2245	NC_020967	GCT	2	6	117419	117424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472158
2246	NC_020967	AGG	2	6	117469	117474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478472158
2247	NC_020967	ATT	2	6	117503	117508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478472158
2248	NC_020967	TTC	2	6	117520	117525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472158
2249	NC_020967	TGC	2	6	117550	117555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472158
2250	NC_020967	CTG	2	6	117597	117602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472158
2251	NC_020967	GCA	2	6	117802	117807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478472159
2252	NC_020967	TGC	2	6	117813	117818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472159
2253	NC_020967	AAG	2	6	117821	117826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478472159
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2255	NC_020967	GTT	2	6	117916	117921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478472159
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2267	NC_020967	G	6	6	118778	118783	0 %	0 %	100 %	0 %	478472161
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2278	NC_020967	T	6	6	119229	119234	0 %	100 %	0 %	0 %	478472162
2279	NC_020967	TTC	2	6	119315	119320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472162
2280	NC_020967	TCC	2	6	119328	119333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478472162
2281	NC_020967	TTTA	2	8	119346	119353	25 %	75 %	0 %	0 %	478472162
2282	NC_020967	CTG	2	6	119544	119549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472162
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2297	NC_020967	AAG	2	6	120095	120100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478472163
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2302	NC_020967	GCTA	2	8	120208	120215	25 %	25 %	25 %	25 %	478472163
2303	NC_020967	CGGC	2	8	120257	120264	0 %	0 %	50 %	50 %	478472163
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2350	NC_020967	GA	3	6	123042	123047	50 %	0 %	50 %	0 %	478472164
2351	NC_020967	GCTTC	2	10	123050	123059	0 %	40 %	20 %	40 %	478472164
2352	NC_020967	TCTA	2	8	123091	123098	25 %	50 %	0 %	25 %	478472164
2353	NC_020967	ACT	2	6	123252	123257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478472165
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2355	NC_020967	AG	3	6	123348	123353	50 %	0 %	50 %	0 %	478472165
2356	NC_020967	T	6	6	123364	123369	0 %	100 %	0 %	0 %	478472165
2357	NC_020967	AGCT	2	8	123397	123404	25 %	25 %	25 %	25 %	478472165
2358	NC_020967	CAA	2	6	123466	123471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478472165
2359	NC_020967	GGC	2	6	123529	123534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478472165
2360	NC_020967	AAG	2	6	123536	123541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478472165
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2362	NC_020967	TAA	2	6	123751	123756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478472165
2363	NC_020967	TGA	2	6	123840	123845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472165
2364	NC_020967	TCC	2	6	123900	123905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478472165
2365	NC_020967	GAT	2	6	123932	123937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472165
2366	NC_020967	T	7	7	124039	124045	0 %	100 %	0 %	0 %	478472165
2367	NC_020967	AGA	2	6	124076	124081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478472165
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2492	NC_020967	CGT	2	6	129812	129817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472171
2493	NC_020967	GAA	2	6	129839	129844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478472171
2494	NC_020967	CATC	2	8	129919	129926	25 %	25 %	0 %	50 %	478472171
2495	NC_020967	CTT	2	6	130004	130009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472171
2496	NC_020967	AAT	2	6	130016	130021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478472171
2497	NC_020967	CAT	2	6	130058	130063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478472171
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2499	NC_020967	GT	5	10	130125	130134	0 %	50 %	50 %	0 %	478472171
2500	NC_020967	TGC	2	6	130194	130199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472171

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