MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D/SotonD1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20343

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020967	CCGTA	2	10	54417	54426	20 %	20 %	20 %	40 %	478472109
1003	NC_020967	TTA	2	6	54447	54452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478472109
1004	NC_020967	GATT	2	8	54488	54495	25 %	50 %	25 %	0 %	478472109
1005	NC_020967	AATC	2	8	54543	54550	50 %	25 %	0 %	25 %	478472109
1006	NC_020967	A	6	6	54582	54587	100 %	0 %	0 %	0 %	478472109
1007	NC_020967	CTT	2	6	54613	54618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472109
1008	NC_020967	A	7	7	54720	54726	100 %	0 %	0 %	0 %	478472110
1009	NC_020967	TTC	2	6	54743	54748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472110
1010	NC_020967	GGAT	2	8	54836	54843	25 %	25 %	50 %	0 %	478472110
1011	NC_020967	CAA	2	6	54912	54917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478472110
1012	NC_020967	GAA	2	6	54939	54944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478472110
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1014	NC_020967	TCGA	2	8	54998	55005	25 %	25 %	25 %	25 %	478472110
1015	NC_020967	CTTC	2	8	55092	55099	0 %	50 %	0 %	50 %	478472110
1016	NC_020967	GAAT	2	8	55127	55134	50 %	25 %	25 %	0 %	478472110
1017	NC_020967	TGT	2	6	55163	55168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478472110
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1019	NC_020967	TTGA	2	8	55197	55204	25 %	50 %	25 %	0 %	478472110
1020	NC_020967	GTA	2	6	55237	55242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472110
1021	NC_020967	CTT	2	6	55251	55256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472110
1022	NC_020967	A	6	6	55386	55391	100 %	0 %	0 %	0 %	478472110
1023	NC_020967	G	6	6	55442	55447	0 %	0 %	100 %	0 %	478472110
1024	NC_020967	AAT	2	6	55539	55544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478472110
1025	NC_020967	GGAA	2	8	55553	55560	50 %	0 %	50 %	0 %	478472110
1026	NC_020967	GATCTG	2	12	55588	55599	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478472110
1027	NC_020967	GGTTCA	2	12	55725	55736	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478472110
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1029	NC_020967	TGAGT	2	10	55847	55856	20 %	40 %	40 %	0 %	478472110
1030	NC_020967	TCA	3	9	55860	55868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478472110
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1033	NC_020967	GGA	2	6	55926	55931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478472110
1034	NC_020967	TGC	2	6	55961	55966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472110
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1039	NC_020967	CTGG	3	12	56464	56475	0 %	25 %	50 %	25 %	478472111
1040	NC_020967	ATT	2	6	56479	56484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478472111
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1045	NC_020967	TTGC	2	8	56601	56608	0 %	50 %	25 %	25 %	478472111
1046	NC_020967	T	6	6	56653	56658	0 %	100 %	0 %	0 %	478472111
1047	NC_020967	GTA	2	6	56684	56689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472111
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1051	NC_020967	GTTGT	2	10	56894	56903	0 %	60 %	40 %	0 %	478472111
1052	NC_020967	T	6	6	56949	56954	0 %	100 %	0 %	0 %	478472111
1053	NC_020967	A	7	7	56991	56997	100 %	0 %	0 %	0 %	478472111
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1057	NC_020967	CT	3	6	57106	57111	0 %	50 %	0 %	50 %	478472111
1058	NC_020967	TGG	2	6	57142	57147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478472111
1059	NC_020967	GT	3	6	57156	57161	0 %	50 %	50 %	0 %	478472111
1060	NC_020967	TGT	2	6	57165	57170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478472111
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1062	NC_020967	GTT	2	6	57268	57273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478472111
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1067	NC_020967	TGT	2	6	57691	57696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478472111
1068	NC_020967	TG	3	6	57794	57799	0 %	50 %	50 %	0 %	478472111
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1088	NC_020967	TGA	2	6	58523	58528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472112
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1098	NC_020967	T	6	6	59012	59017	0 %	100 %	0 %	0 %	478472112
1099	NC_020967	GCT	2	6	59094	59099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478472112
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1106	NC_020967	TTC	2	6	59255	59260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478472112
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1109	NC_020967	TAGA	2	8	59383	59390	50 %	25 %	25 %	0 %	478472112
1110	NC_020967	TTA	2	6	59469	59474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478472112
1111	NC_020967	TGAA	2	8	59488	59495	50 %	25 %	25 %	0 %	478472112
1112	NC_020967	T	8	8	59565	59572	0 %	100 %	0 %	0 %	478472112
1113	NC_020967	T	6	6	59585	59590	0 %	100 %	0 %	0 %	478472112
1114	NC_020967	T	6	6	59596	59601	0 %	100 %	0 %	0 %	478472112
1115	NC_020967	AGA	2	6	59669	59674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478472113
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1117	NC_020967	T	6	6	59717	59722	0 %	100 %	0 %	0 %	478472113
1118	NC_020967	CGTT	2	8	59868	59875	0 %	50 %	25 %	25 %	478472113
1119	NC_020967	GGAG	2	8	59877	59884	25 %	0 %	75 %	0 %	478472113
1120	NC_020967	GTAA	2	8	59929	59936	50 %	25 %	25 %	0 %	478472113
1121	NC_020967	TCCTAA	2	12	59996	60007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478472113
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1124	NC_020967	TAG	2	6	60104	60109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478472113
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