MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/363 complete genome

Total Repeats: 20451

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020966	AGA	2	6	281181	281186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458797
5502	NC_020966	CTC	2	6	281214	281219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458797
5503	NC_020966	GTA	2	6	281243	281248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458797
5504	NC_020966	ATA	2	6	281270	281275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458797
5505	NC_020966	ACC	2	6	281293	281298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478458797
5506	NC_020966	CCAT	2	8	281305	281312	25 %	25 %	0 %	50 %	478458797
5507	NC_020966	GAG	2	6	281365	281370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458797
5508	NC_020966	GCTT	2	8	281406	281413	0 %	50 %	25 %	25 %	478458797
5509	NC_020966	GCA	2	6	281682	281687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458798
5510	NC_020966	GCT	2	6	281704	281709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458798
5511	NC_020966	TCT	2	6	281710	281715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458798
5512	NC_020966	TTA	2	6	281855	281860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458798
5513	NC_020966	AGC	2	6	281871	281876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458798
5514	NC_020966	ACG	2	6	281921	281926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458798
5515	NC_020966	GTA	2	6	281955	281960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458798
5516	NC_020966	TCT	2	6	282016	282021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458799
5517	NC_020966	TGA	2	6	282045	282050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458799
5518	NC_020966	CT	3	6	282093	282098	0 %	50 %	0 %	50 %	478458799
5519	NC_020966	ATC	2	6	282099	282104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458799
5520	NC_020966	TTC	2	6	282105	282110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458799
5521	NC_020966	GAA	2	6	282136	282141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458799
5522	NC_020966	GA	3	6	282161	282166	50 %	0 %	50 %	0 %	478458799
5523	NC_020966	AAAG	2	8	282193	282200	75 %	0 %	25 %	0 %	478458799
5524	NC_020966	ATA	2	6	282291	282296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458799
5525	NC_020966	CAT	2	6	282359	282364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458799
5526	NC_020966	TAA	2	6	282366	282371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458799
5527	NC_020966	GTT	2	6	282439	282444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458799
5528	NC_020966	GAT	2	6	282472	282477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458799
5529	NC_020966	TTC	2	6	282536	282541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458799
5530	NC_020966	A	6	6	282547	282552	100 %	0 %	0 %	0 %	478458799
5531	NC_020966	TTA	2	6	282569	282574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458799
5532	NC_020966	TAAT	2	8	282614	282621	50 %	50 %	0 %	0 %	478458799
5533	NC_020966	TTC	2	6	282624	282629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458799
5534	NC_020966	AGA	2	6	282660	282665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458799
5535	NC_020966	GAA	2	6	282711	282716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458799
5536	NC_020966	CTT	2	6	282719	282724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458799
5537	NC_020966	TCC	2	6	282894	282899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458799
5538	NC_020966	CAG	2	6	282902	282907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458799
5539	NC_020966	GAA	2	6	283007	283012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458799
5540	NC_020966	CACGCG	2	12	283161	283172	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	478458799
5541	NC_020966	ATT	3	9	283185	283193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458799
5542	NC_020966	TTTCTT	2	12	283340	283351	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478458799
5543	NC_020966	TCT	2	6	283464	283469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458800
5544	NC_020966	TGC	2	6	283487	283492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458800
5545	NC_020966	TGTT	2	8	283515	283522	0 %	75 %	25 %	0 %	478458800
5546	NC_020966	TTG	2	6	283528	283533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458800
5547	NC_020966	AGA	2	6	283552	283557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458800
5548	NC_020966	AAC	2	6	283610	283615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478458800
5549	NC_020966	CAT	2	6	283618	283623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458800
5550	NC_020966	CTT	2	6	283635	283640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458800
5551	NC_020966	GTT	2	6	283647	283652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458800
5552	NC_020966	CAG	2	6	283680	283685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458800
5553	NC_020966	CTG	2	6	283693	283698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458800
5554	NC_020966	GAA	2	6	283728	283733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458800
5555	NC_020966	TATC	2	8	283803	283810	25 %	50 %	0 %	25 %	478458800
5556	NC_020966	AGCT	2	8	283824	283831	25 %	25 %	25 %	25 %	478458800
5557	NC_020966	CTG	2	6	283990	283995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458800
5558	NC_020966	ACG	2	6	284029	284034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458800
5559	NC_020966	TAA	2	6	284092	284097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458800
5560	NC_020966	ATA	2	6	284099	284104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458800
5561	NC_020966	ATA	2	6	284154	284159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458800
5562	NC_020966	TGC	2	6	284161	284166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458800
5563	NC_020966	GGA	2	6	284390	284395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458800
5564	NC_020966	AGA	2	6	284437	284442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458800
5565	NC_020966	GAG	2	6	284517	284522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458800
5566	NC_020966	GTT	2	6	284527	284532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458800
5567	NC_020966	TTC	2	6	284594	284599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458800
5568	NC_020966	TCT	2	6	284678	284683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458800
5569	NC_020966	AGT	2	6	284692	284697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458800
5570	NC_020966	GCT	2	6	284724	284729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458800
5571	NC_020966	TTC	2	6	284745	284750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458800
5572	NC_020966	CCA	2	6	284756	284761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478458800
5573	NC_020966	CT	3	6	284768	284773	0 %	50 %	0 %	50 %	478458800
5574	NC_020966	TAT	2	6	284787	284792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458800
5575	NC_020966	ACA	2	6	284801	284806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478458800
5576	NC_020966	CT	3	6	284880	284885	0 %	50 %	0 %	50 %	478458800
5577	NC_020966	ATA	2	6	284923	284928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458800
5578	NC_020966	AGTT	2	8	285006	285013	25 %	50 %	25 %	0 %	478458800
5579	NC_020966	CT	3	6	285019	285024	0 %	50 %	0 %	50 %	478458800
5580	NC_020966	TCT	2	6	285059	285064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458800
5581	NC_020966	GTA	2	6	285151	285156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458800
5582	NC_020966	AC	3	6	285230	285235	50 %	0 %	0 %	50 %	478458800
5583	NC_020966	TCT	2	6	285236	285241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458800
5584	NC_020966	ATG	2	6	285297	285302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458800
5585	NC_020966	CTA	2	6	285393	285398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458800
5586	NC_020966	CTT	2	6	285456	285461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458800
5587	NC_020966	CAG	2	6	285574	285579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458800
5588	NC_020966	CTC	2	6	285628	285633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458800
5589	NC_020966	TAC	2	6	285652	285657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458800
5590	NC_020966	GCT	2	6	285702	285707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458800
5591	NC_020966	GAA	2	6	285748	285753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458800
5592	NC_020966	ATA	2	6	285795	285800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458800
5593	NC_020966	CGTT	2	8	285802	285809	0 %	50 %	25 %	25 %	478458800
5594	NC_020966	ATTC	2	8	285811	285818	25 %	50 %	0 %	25 %	478458800
5595	NC_020966	CAT	2	6	286130	286135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458801
5596	NC_020966	T	9	9	286135	286143	0 %	100 %	0 %	0 %	478458801
5597	NC_020966	ATC	2	6	286178	286183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458801
5598	NC_020966	TTC	2	6	286219	286224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458801
5599	NC_020966	GT	3	6	286243	286248	0 %	50 %	50 %	0 %	478458801
5600	NC_020966	CTG	2	6	286299	286304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458801
5601	NC_020966	CCA	2	6	286424	286429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478458801
5602	NC_020966	CAC	2	6	286615	286620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478458801
5603	NC_020966	CCT	2	6	286649	286654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458801
5604	NC_020966	CTCC	2	8	286697	286704	0 %	25 %	0 %	75 %	478458801
5605	NC_020966	AAGC	2	8	286719	286726	50 %	0 %	25 %	25 %	478458801
5606	NC_020966	ATG	2	6	286736	286741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458801
5607	NC_020966	T	6	6	286792	286797	0 %	100 %	0 %	0 %	478458801
5608	NC_020966	CTC	2	6	286798	286803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478458801
5609	NC_020966	A	6	6	286841	286846	100 %	0 %	0 %	0 %	478458801
5610	NC_020966	GAT	2	6	286847	286852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458801
5611	NC_020966	A	7	7	286853	286859	100 %	0 %	0 %	0 %	478458801
5612	NC_020966	AG	3	6	286920	286925	50 %	0 %	50 %	0 %	478458801
5613	NC_020966	CTT	2	6	287223	287228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458802
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5615	NC_020966	GCTGT	2	10	287265	287274	0 %	40 %	40 %	20 %	478458802
5616	NC_020966	GTC	2	6	287333	287338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458802
5617	NC_020966	T	6	6	287352	287357	0 %	100 %	0 %	0 %	478458802
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5619	NC_020966	ACT	2	6	287449	287454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458802
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5621	NC_020966	T	7	7	287495	287501	0 %	100 %	0 %	0 %	478458802
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5991	NC_020966	A	6	6	305969	305974	100 %	0 %	0 %	0 %	478458820
5992	NC_020966	TA	3	6	306067	306072	50 %	50 %	0 %	0 %	478458820
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