MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/363 complete genome

Total Repeats: 20451

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_020966	TAT	2	6	230902	230907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458753
4503	NC_020966	TCT	2	6	230962	230967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458753
4504	NC_020966	TTTC	2	8	231038	231045	0 %	75 %	0 %	25 %	478458753
4505	NC_020966	CTT	2	6	231100	231105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458753
4506	NC_020966	TTA	2	6	231167	231172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458753
4507	NC_020966	TGT	2	6	231223	231228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458753
4508	NC_020966	T	6	6	231292	231297	0 %	100 %	0 %	0 %	478458753
4509	NC_020966	TAT	2	6	231367	231372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458753
4510	NC_020966	ATT	2	6	231446	231451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458753
4511	NC_020966	CAC	2	6	231492	231497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478458753
4512	NC_020966	GAA	2	6	231512	231517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458753
4513	NC_020966	ATT	2	6	231578	231583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458753
4514	NC_020966	CAA	2	6	231645	231650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478458753
4515	NC_020966	TTCT	2	8	231714	231721	0 %	75 %	0 %	25 %	478458753
4516	NC_020966	ACT	2	6	231725	231730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458753
4517	NC_020966	ATG	2	6	231767	231772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458753
4518	NC_020966	CTTC	2	8	231774	231781	0 %	50 %	0 %	50 %	478458753
4519	NC_020966	TTAT	2	8	231876	231883	25 %	75 %	0 %	0 %	478458753
4520	NC_020966	CTAT	2	8	231895	231902	25 %	50 %	0 %	25 %	478458753
4521	NC_020966	TCTT	2	8	231942	231949	0 %	75 %	0 %	25 %	478458753
4522	NC_020966	TGC	2	6	231985	231990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458753
4523	NC_020966	CTTAGC	2	12	231991	232002	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478458753
4524	NC_020966	GGA	2	6	232022	232027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458753
4525	NC_020966	CA	3	6	232030	232035	50 %	0 %	0 %	50 %	478458753
4526	NC_020966	TGG	2	6	232094	232099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478458753
4527	NC_020966	TTGG	2	8	232138	232145	0 %	50 %	50 %	0 %	478458753
4528	NC_020966	TGG	3	9	232157	232165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478458753
4529	NC_020966	GTC	2	6	232211	232216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458754
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4532	NC_020966	CTT	2	6	232317	232322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458754
4533	NC_020966	CTA	2	6	232376	232381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478458754
4534	NC_020966	ATTT	2	8	232385	232392	25 %	75 %	0 %	0 %	478458754
4535	NC_020966	TGG	2	6	232463	232468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478458754
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4538	NC_020966	GC	3	6	232674	232679	0 %	0 %	50 %	50 %	478458754
4539	NC_020966	ATT	2	6	232722	232727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458754
4540	NC_020966	GCA	2	6	232835	232840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458754
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4542	NC_020966	CATC	2	8	232891	232898	25 %	25 %	0 %	50 %	478458754
4543	NC_020966	TTA	2	6	232948	232953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458754
4544	NC_020966	TCT	3	9	232968	232976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458754
4545	NC_020966	A	6	6	233044	233049	100 %	0 %	0 %	0 %	478458754
4546	NC_020966	GCT	2	6	233103	233108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478458754
4547	NC_020966	TCT	2	6	233238	233243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458754
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4549	NC_020966	GC	3	6	233576	233581	0 %	0 %	50 %	50 %	478458754
4550	NC_020966	GAC	2	6	233603	233608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478458754
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4552	NC_020966	TAA	2	6	233681	233686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458754
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4554	NC_020966	GGA	2	6	233762	233767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478458754
4555	NC_020966	TGA	2	6	233777	233782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458754
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4557	NC_020966	AATG	2	8	233814	233821	50 %	25 %	25 %	0 %	478458754
4558	NC_020966	ATT	2	6	233863	233868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458754
4559	NC_020966	ATG	2	6	233909	233914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458755
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4561	NC_020966	A	6	6	233941	233946	100 %	0 %	0 %	0 %	478458755
4562	NC_020966	A	6	6	234015	234020	100 %	0 %	0 %	0 %	478458755
4563	NC_020966	AAG	2	6	234111	234116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458755
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4595	NC_020966	TTCT	2	8	235421	235428	0 %	75 %	0 %	25 %	478458756
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4599	NC_020966	CAA	2	6	235738	235743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478458756
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4601	NC_020966	CTT	2	6	235868	235873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458756
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4604	NC_020966	ATG	2	6	236113	236118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458756
4605	NC_020966	TTA	2	6	236224	236229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478458756
4606	NC_020966	GAA	2	6	236269	236274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458756
4607	NC_020966	TTG	2	6	236282	236287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458756
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4609	NC_020966	A	6	6	236674	236679	100 %	0 %	0 %	0 %	478458757
4610	NC_020966	T	7	7	236710	236716	0 %	100 %	0 %	0 %	478458757
4611	NC_020966	GAA	2	6	236723	236728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478458757
4612	NC_020966	CTT	2	6	236777	236782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478458757
4613	NC_020966	AATA	2	8	236816	236823	75 %	25 %	0 %	0 %	478458757
4614	NC_020966	TAA	2	6	236865	236870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478458757
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4622	NC_020966	GTT	2	6	237305	237310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478458757
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4996	NC_020966	GTA	2	6	256000	256005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478458775
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