MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis K/SotonK1 complete genome

Total Repeats: 20314

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020965	TAT	2	6	206834	206839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457832
4003	NC_020965	AGT	2	6	206861	206866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457832
4004	NC_020965	GAA	2	6	207242	207247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457833
4005	NC_020965	TCC	2	6	207280	207285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457833
4006	NC_020965	AGGA	2	8	207363	207370	50 %	0 %	50 %	0 %	478457833
4007	NC_020965	TTTG	2	8	207386	207393	0 %	75 %	25 %	0 %	478457833
4008	NC_020965	GAA	2	6	207437	207442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457833
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4013	NC_020965	ACC	2	6	207637	207642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478457833
4014	NC_020965	ATT	2	6	207645	207650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457833
4015	NC_020965	ATC	2	6	207659	207664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457833
4016	NC_020965	CAA	2	6	207779	207784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457833
4017	NC_020965	TGA	2	6	207802	207807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457833
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4019	NC_020965	CT	3	6	207885	207890	0 %	50 %	0 %	50 %	478457833
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4057	NC_020965	TGT	2	6	209585	209590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457835
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4094	NC_020965	GAAC	2	8	211332	211339	50 %	0 %	25 %	25 %	478457837
4095	NC_020965	CA	4	8	211405	211412	50 %	0 %	0 %	50 %	478457837
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4106	NC_020965	TTCC	2	8	211783	211790	0 %	50 %	0 %	50 %	478457837
4107	NC_020965	TAA	2	6	211798	211803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457837
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4110	NC_020965	TTC	2	6	211941	211946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457837
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4118	NC_020965	TCT	2	6	212178	212183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457837
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4240	NC_020965	AGA	2	6	218661	218666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457842
4241	NC_020965	AGT	2	6	218686	218691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457842
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4243	NC_020965	AAC	2	6	218759	218764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457842
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4245	NC_020965	TC	3	6	218862	218867	0 %	50 %	0 %	50 %	478457842
4246	NC_020965	TTC	2	6	218868	218873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457842
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4364	NC_020965	AGC	2	6	224069	224074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457846
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4490	NC_020965	TCTT	2	8	230455	230462	0 %	75 %	0 %	25 %	478457852
4491	NC_020965	TGC	2	6	230498	230503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457852
4492	NC_020965	CTTAGC	2	12	230504	230515	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478457852
4493	NC_020965	GGA	2	6	230535	230540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478457852
4494	NC_020965	CA	3	6	230543	230548	50 %	0 %	0 %	50 %	478457852
4495	NC_020965	TGG	2	6	230607	230612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478457852
4496	NC_020965	TTGG	2	8	230651	230658	0 %	50 %	50 %	0 %	478457852
4497	NC_020965	TGG	3	9	230670	230678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478457852
4498	NC_020965	GTC	2	6	230724	230729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457853
4499	NC_020965	CTT	2	6	230762	230767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457853
4500	NC_020965	AGA	2	6	230808	230813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457853

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