MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis K/SotonK1 complete genome

Total Repeats: 20314

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020965	CAA	2	6	54830	54835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457699
1003	NC_020965	GAA	2	6	54857	54862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457699
1004	NC_020965	CT	3	6	54881	54886	0 %	50 %	0 %	50 %	478457699
1005	NC_020965	TCGA	2	8	54916	54923	25 %	25 %	25 %	25 %	478457699
1006	NC_020965	GGA	2	6	54950	54955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478457699
1007	NC_020965	ATG	2	6	54956	54961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457699
1008	NC_020965	CTTC	2	8	55001	55008	0 %	50 %	0 %	50 %	478457699
1009	NC_020965	GAAT	2	8	55036	55043	50 %	25 %	25 %	0 %	478457699
1010	NC_020965	TGT	2	6	55072	55077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457699
1011	NC_020965	GAT	2	6	55100	55105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457699
1012	NC_020965	TTGA	2	8	55106	55113	25 %	50 %	25 %	0 %	478457699
1013	NC_020965	GTA	2	6	55146	55151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457699
1014	NC_020965	TCA	2	6	55161	55166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457699
1015	NC_020965	GAG	2	6	55184	55189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478457699
1016	NC_020965	TCAGA	2	10	55199	55208	40 %	20 %	20 %	20 %	478457699
1017	NC_020965	A	6	6	55298	55303	100 %	0 %	0 %	0 %	478457699
1018	NC_020965	G	6	6	55354	55359	0 %	0 %	100 %	0 %	478457699
1019	NC_020965	GGAA	2	8	55465	55472	50 %	0 %	50 %	0 %	478457699
1020	NC_020965	GATCTG	2	12	55488	55499	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478457699
1021	NC_020965	GTGTAA	2	12	55536	55547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457699
1022	NC_020965	GCA	2	6	55550	55555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457699
1023	NC_020965	TGG	2	6	55602	55607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478457699
1024	NC_020965	GGTTCA	2	12	55625	55636	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478457699
1025	NC_020965	TTATC	2	10	55726	55735	20 %	60 %	0 %	20 %	478457699
1026	NC_020965	TGAGT	2	10	55747	55756	20 %	40 %	40 %	0 %	478457699
1027	NC_020965	TCA	3	9	55760	55768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457699
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1030	NC_020965	GAG	2	6	55827	55832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478457699
1031	NC_020965	TGC	2	6	55861	55866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457699
1032	NC_020965	AT	3	6	56071	56076	50 %	50 %	0 %	0 %	478457699
1033	NC_020965	TTA	2	6	56086	56091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457699
1034	NC_020965	TGG	2	6	56262	56267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478457700
1035	NC_020965	TGT	2	6	56304	56309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457700
1036	NC_020965	CTGG	3	12	56364	56375	0 %	25 %	50 %	25 %	478457700
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1041	NC_020965	TTA	2	6	56458	56463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457700
1042	NC_020965	TTGC	2	8	56501	56508	0 %	50 %	25 %	25 %	478457700
1043	NC_020965	AGCG	2	8	56541	56548	25 %	0 %	50 %	25 %	478457700
1044	NC_020965	T	6	6	56553	56558	0 %	100 %	0 %	0 %	478457700
1045	NC_020965	GTA	2	6	56584	56589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457700
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1049	NC_020965	GTTGT	2	10	56794	56803	0 %	60 %	40 %	0 %	478457700
1050	NC_020965	T	6	6	56849	56854	0 %	100 %	0 %	0 %	478457700
1051	NC_020965	GAAAAG	2	12	56884	56895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457700
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1053	NC_020965	AGT	3	9	56988	56996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457700
1054	NC_020965	AGCT	2	8	57000	57007	25 %	25 %	25 %	25 %	478457700
1055	NC_020965	CT	3	6	57006	57011	0 %	50 %	0 %	50 %	478457700
1056	NC_020965	GAG	2	6	57019	57024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478457700
1057	NC_020965	TGG	2	6	57042	57047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478457700
1058	NC_020965	GT	3	6	57056	57061	0 %	50 %	50 %	0 %	478457700
1059	NC_020965	TGT	2	6	57065	57070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457700
1060	NC_020965	AGT	2	6	57075	57080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457700
1061	NC_020965	GAA	2	6	57118	57123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457700
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1063	NC_020965	T	6	6	57238	57243	0 %	100 %	0 %	0 %	478457700
1064	NC_020965	AGA	2	6	57394	57399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457700
1065	NC_020965	CAG	2	6	57557	57562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457700
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1067	NC_020965	TGT	2	6	57657	57662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457700
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1069	NC_020965	GTTG	2	8	57770	57777	0 %	50 %	50 %	0 %	478457700
1070	NC_020965	TAA	2	6	57825	57830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478457700
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1080	NC_020965	GTT	2	6	58079	58084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457701
1081	NC_020965	GCT	2	6	58118	58123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457701
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1085	NC_020965	GAG	2	6	58190	58195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478457701
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1088	NC_020965	TGA	2	6	58492	58497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457701
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1092	NC_020965	GTT	2	6	58653	58658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457701
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1098	NC_020965	T	6	6	58981	58986	0 %	100 %	0 %	0 %	478457701
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1108	NC_020965	TCC	2	6	59311	59316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457701
1109	NC_020965	TAGA	2	8	59352	59359	50 %	25 %	25 %	0 %	478457701
1110	NC_020965	TGAA	2	8	59457	59464	50 %	25 %	25 %	0 %	478457701
1111	NC_020965	TGT	2	6	59471	59476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457701
1112	NC_020965	T	8	8	59534	59541	0 %	100 %	0 %	0 %	478457701
1113	NC_020965	T	6	6	59554	59559	0 %	100 %	0 %	0 %	478457701
1114	NC_020965	T	6	6	59565	59570	0 %	100 %	0 %	0 %	478457701
1115	NC_020965	TGAAAA	2	12	59625	59636	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478457702
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1118	NC_020965	T	6	6	59685	59690	0 %	100 %	0 %	0 %	478457702
1119	NC_020965	CGTT	2	8	59836	59843	0 %	50 %	25 %	25 %	478457702
1120	NC_020965	GGAG	2	8	59845	59852	25 %	0 %	75 %	0 %	478457702
1121	NC_020965	GTAA	2	8	59897	59904	50 %	25 %	25 %	0 %	478457702
1122	NC_020965	TCCTAA	2	12	59964	59975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457702
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