MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/SotonF3 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_020964	GCA	2	6	155061	155066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478474003
3003	NC_020964	CTG	2	6	155135	155140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478474003
3004	NC_020964	GAA	2	6	155164	155169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478474003
3005	NC_020964	GAG	2	6	155230	155235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478474003
3006	NC_020964	A	6	6	155333	155338	100 %	0 %	0 %	0 %	478474003
3007	NC_020964	TGT	2	6	155349	155354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478474003
3008	NC_020964	CCTCAT	2	12	155425	155436	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478474003
3009	NC_020964	AGGC	2	8	155455	155462	25 %	0 %	50 %	25 %	478474003
3010	NC_020964	GAGT	2	8	155543	155550	25 %	25 %	50 %	0 %	478474003
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3012	NC_020964	TTCTT	2	10	155723	155732	0 %	80 %	0 %	20 %	478474004
3013	NC_020964	GACT	2	8	155751	155758	25 %	25 %	25 %	25 %	478474004
3014	NC_020964	GTA	2	6	155805	155810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474004
3015	NC_020964	TGT	2	6	155874	155879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478474004
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3017	NC_020964	TGG	3	9	155938	155946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478474004
3018	NC_020964	TTG	2	6	155996	156001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478474004
3019	NC_020964	GAT	2	6	156053	156058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474004
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3021	NC_020964	TTA	2	6	156149	156154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478474004
3022	NC_020964	T	7	7	156308	156314	0 %	100 %	0 %	0 %	478474004
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3055	NC_020964	ACAT	2	8	157769	157776	50 %	25 %	0 %	25 %	478474005
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3060	NC_020964	GCA	2	6	158220	158225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478474006
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3062	NC_020964	CTCCAT	2	12	158252	158263	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478474006
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3102	NC_020964	GA	3	6	160849	160854	50 %	0 %	50 %	0 %	478474009
3103	NC_020964	ATT	2	6	160869	160874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478474009
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3494	NC_020964	TGA	2	6	180913	180918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474021
3495	NC_020964	AGAGT	2	10	180921	180930	40 %	20 %	40 %	0 %	478474021
3496	NC_020964	GAA	2	6	180976	180981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478474021
3497	NC_020964	AGG	2	6	180998	181003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478474021
3498	NC_020964	AAG	3	9	181004	181012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478474021
3499	NC_020964	T	6	6	181428	181433	0 %	100 %	0 %	0 %	478474022
3500	NC_020964	TTGAA	2	10	181454	181463	40 %	40 %	20 %	0 %	478474022

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