MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/SotonF3 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020964	TCC	2	6	79666	79671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473934
1503	NC_020964	GCT	2	6	79698	79703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473934
1504	NC_020964	TCT	2	6	79709	79714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473934
1505	NC_020964	T	7	7	80405	80411	0 %	100 %	0 %	0 %	478473935
1506	NC_020964	TGA	2	6	80510	80515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473935
1507	NC_020964	TGTCT	2	10	80525	80534	0 %	60 %	20 %	20 %	478473935
1508	NC_020964	TGAT	2	8	80599	80606	25 %	50 %	25 %	0 %	478473935
1509	NC_020964	TCAT	2	8	80621	80628	25 %	50 %	0 %	25 %	478473935
1510	NC_020964	T	6	6	80677	80682	0 %	100 %	0 %	0 %	478473935
1511	NC_020964	TCT	2	6	80789	80794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473935
1512	NC_020964	GAA	2	6	80799	80804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473935
1513	NC_020964	TGC	2	6	80849	80854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478473935
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1515	NC_020964	GAA	2	6	80901	80906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473935
1516	NC_020964	GGA	2	6	80945	80950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478473935
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1518	NC_020964	A	7	7	80992	80998	100 %	0 %	0 %	0 %	478473935
1519	NC_020964	TTACT	2	10	81032	81041	20 %	60 %	0 %	20 %	478473935
1520	NC_020964	TATC	2	8	81048	81055	25 %	50 %	0 %	25 %	478473935
1521	NC_020964	GA	3	6	81066	81071	50 %	0 %	50 %	0 %	478473935
1522	NC_020964	TAT	2	6	81146	81151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473935
1523	NC_020964	TA	3	6	81286	81291	50 %	50 %	0 %	0 %	478473935
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1530	NC_020964	CTT	2	6	81551	81556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473936
1531	NC_020964	CAT	2	6	81598	81603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473936
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1534	NC_020964	GGTT	2	8	81756	81763	0 %	50 %	50 %	0 %	478473936
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1539	NC_020964	T	6	6	81822	81827	0 %	100 %	0 %	0 %	478473936
1540	NC_020964	CGAT	2	8	81884	81891	25 %	25 %	25 %	25 %	478473936
1541	NC_020964	TCAT	2	8	81959	81966	25 %	50 %	0 %	25 %	478473936
1542	NC_020964	TTA	2	6	82009	82014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473936
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1551	NC_020964	CTT	2	6	82321	82326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473937
1552	NC_020964	TTA	2	6	82364	82369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473937
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1554	NC_020964	AGAAA	2	10	82422	82431	80 %	0 %	20 %	0 %	478473937
1555	NC_020964	T	6	6	82477	82482	0 %	100 %	0 %	0 %	478473937
1556	NC_020964	GTTA	2	8	82501	82508	25 %	50 %	25 %	0 %	478473937
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1558	NC_020964	GCG	2	6	82567	82572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478473937
1559	NC_020964	T	6	6	82610	82615	0 %	100 %	0 %	0 %	478473937
1560	NC_020964	TGG	3	9	82636	82644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478473937
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1562	NC_020964	GTT	2	6	82723	82728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473937
1563	NC_020964	TATT	2	8	82733	82740	25 %	75 %	0 %	0 %	478473937
1564	NC_020964	GTG	2	6	82757	82762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478473937
1565	NC_020964	CCT	2	6	82807	82812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478473937
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1569	NC_020964	TTC	2	6	82984	82989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473937
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1598	NC_020964	ATTA	2	8	84019	84026	50 %	50 %	0 %	0 %	478473938
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1611	NC_020964	AG	3	6	84622	84627	50 %	0 %	50 %	0 %	478473939
1612	NC_020964	GAA	2	6	84655	84660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473939
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1627	NC_020964	TTTC	2	8	85336	85343	0 %	75 %	0 %	25 %	478473939
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