MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/SotonF3 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020964	CCGTA	2	10	54419	54428	20 %	20 %	20 %	40 %	478473916
1003	NC_020964	TTA	2	6	54449	54454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478473916
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1005	NC_020964	AATC	2	8	54545	54552	50 %	25 %	0 %	25 %	478473916
1006	NC_020964	A	6	6	54584	54589	100 %	0 %	0 %	0 %	478473916
1007	NC_020964	CTT	2	6	54615	54620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473916
1008	NC_020964	A	7	7	54722	54728	100 %	0 %	0 %	0 %	478473917
1009	NC_020964	TTC	2	6	54745	54750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473917
1010	NC_020964	GGAT	2	8	54838	54845	25 %	25 %	50 %	0 %	478473917
1011	NC_020964	CAA	2	6	54914	54919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478473917
1012	NC_020964	GAA	2	6	54941	54946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478473917
1013	NC_020964	CT	3	6	54965	54970	0 %	50 %	0 %	50 %	478473917
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1015	NC_020964	CTTC	2	8	55094	55101	0 %	50 %	0 %	50 %	478473917
1016	NC_020964	GAAT	2	8	55129	55136	50 %	25 %	25 %	0 %	478473917
1017	NC_020964	TGT	2	6	55165	55170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473917
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1020	NC_020964	GTA	2	6	55239	55244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473917
1021	NC_020964	CTT	2	6	55253	55258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478473917
1022	NC_020964	A	6	6	55388	55393	100 %	0 %	0 %	0 %	478473917
1023	NC_020964	G	6	6	55444	55449	0 %	0 %	100 %	0 %	478473917
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1026	NC_020964	GATCTG	2	12	55590	55601	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478473917
1027	NC_020964	GGTTCA	2	12	55727	55738	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478473917
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1029	NC_020964	TGAGT	2	10	55849	55858	20 %	40 %	40 %	0 %	478473917
1030	NC_020964	TCA	3	9	55862	55870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478473917
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1039	NC_020964	CTGG	3	12	56466	56477	0 %	25 %	50 %	25 %	478473918
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1046	NC_020964	T	6	6	56655	56660	0 %	100 %	0 %	0 %	478473918
1047	NC_020964	GTA	2	6	56686	56691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473918
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1051	NC_020964	GTTGT	2	10	56896	56905	0 %	60 %	40 %	0 %	478473918
1052	NC_020964	T	6	6	56951	56956	0 %	100 %	0 %	0 %	478473918
1053	NC_020964	A	7	7	56993	56999	100 %	0 %	0 %	0 %	478473918
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1057	NC_020964	CT	3	6	57108	57113	0 %	50 %	0 %	50 %	478473918
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1060	NC_020964	TGT	2	6	57167	57172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478473918
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1109	NC_020964	TAGA	2	8	59385	59392	50 %	25 %	25 %	0 %	478473919
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1111	NC_020964	TGAA	2	8	59490	59497	50 %	25 %	25 %	0 %	478473919
1112	NC_020964	T	8	8	59567	59574	0 %	100 %	0 %	0 %	478473919
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1119	NC_020964	GGAG	2	8	59879	59886	25 %	0 %	75 %	0 %	478473920
1120	NC_020964	GTAA	2	8	59931	59938	50 %	25 %	25 %	0 %	478473920
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1124	NC_020964	TAG	2	6	60106	60111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478473920
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