MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/7249 complete genome

Total Repeats: 12944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020944	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465762
2	NC_020944	GAA	2	6	87	92	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465762
3	NC_020944	GTA	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465762
4	NC_020944	AGT	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465762
5	NC_020944	AAG	2	6	318	323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465762
6	NC_020944	CAA	2	6	332	337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465762
7	NC_020944	AGT	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465762
8	NC_020944	GTG	2	6	374	379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478465762
9	NC_020944	CAG	2	6	410	415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465762
10	NC_020944	GCC	2	6	598	603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478465762
11	NC_020944	TGC	2	6	657	662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465762
12	NC_020944	ATT	2	6	669	674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465762
13	NC_020944	CGA	2	6	691	696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465762
14	NC_020944	TAT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465762
15	NC_020944	GAA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465762
16	NC_020944	AGA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465762
17	NC_020944	AGA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465762
18	NC_020944	CAA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465762
19	NC_020944	TTG	2	6	1179	1184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465762
20	NC_020944	CTC	2	6	1208	1213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465762
21	NC_020944	GAT	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465762
22	NC_020944	GAT	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465762
23	NC_020944	ATG	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465762
24	NC_020944	CCT	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465762
25	NC_020944	CTT	2	6	1607	1612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465762
26	NC_020944	CAG	2	6	1672	1677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465762
27	NC_020944	TGA	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465762
28	NC_020944	ATG	2	6	1930	1935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465763
29	NC_020944	GTG	2	6	1936	1941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478465763
30	NC_020944	TCC	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465763
31	NC_020944	AGC	2	6	1959	1964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465763
32	NC_020944	AGC	2	6	1986	1991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465763
33	NC_020944	AAG	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465763
34	NC_020944	TAC	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465763
35	NC_020944	GCT	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465763
36	NC_020944	AAC	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465763
37	NC_020944	AGA	2	6	2155	2160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465763
38	NC_020944	AGA	2	6	2411	2416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465764
39	NC_020944	ATC	2	6	2418	2423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465764
40	NC_020944	TGC	2	6	2438	2443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465764
41	NC_020944	CAT	2	6	2562	2567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465764
42	NC_020944	AGA	2	6	2591	2596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465764
43	NC_020944	AAG	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465764
44	NC_020944	GGA	2	6	2655	2660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465764
45	NC_020944	ATC	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465765
46	NC_020944	ATA	2	6	2934	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465765
47	NC_020944	AAC	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478465765
48	NC_020944	GGT	2	6	3013	3018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478465765
49	NC_020944	AAT	2	6	3119	3124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465765
50	NC_020944	TTC	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465765
51	NC_020944	GCA	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465765
52	NC_020944	GGA	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465765
53	NC_020944	CAG	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465765
54	NC_020944	GTT	2	6	3257	3262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465765
55	NC_020944	GGT	2	6	3349	3354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478465765
56	NC_020944	AAG	2	6	3507	3512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465765
57	NC_020944	ATT	2	6	3569	3574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465765
58	NC_020944	TTG	2	6	3621	3626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465765
59	NC_020944	AAG	2	6	3732	3737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465765
60	NC_020944	AAG	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465765
61	NC_020944	CAG	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465765
62	NC_020944	GCT	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465765
63	NC_020944	AAG	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465765
64	NC_020944	CAG	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465765
65	NC_020944	GGA	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465765
66	NC_020944	AAT	2	6	4173	4178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465765
67	NC_020944	ATT	2	6	4253	4258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465766
68	NC_020944	TGA	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465766
69	NC_020944	GTA	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465766
70	NC_020944	AGA	2	6	4562	4567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465766
71	NC_020944	GAA	2	6	4746	4751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465766
72	NC_020944	CGT	2	6	4878	4883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465766
73	NC_020944	GTT	2	6	4929	4934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465766
74	NC_020944	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465766
75	NC_020944	TTG	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465766
76	NC_020944	TTC	2	6	5302	5307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465766
77	NC_020944	TCT	2	6	5394	5399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465766
78	NC_020944	AGA	2	6	5414	5419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465766
79	NC_020944	GTT	2	6	5441	5446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465766
80	NC_020944	GGT	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478465766
81	NC_020944	CTC	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465766
82	NC_020944	AGC	2	6	5624	5629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465766
83	NC_020944	ATT	2	6	5743	5748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465767
84	NC_020944	TCT	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465767
85	NC_020944	GCT	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465767
86	NC_020944	GAT	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465767
87	NC_020944	ACG	2	6	5880	5885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465767
88	NC_020944	GAA	2	6	5904	5909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465767
89	NC_020944	AGA	3	9	5981	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465767
90	NC_020944	GCT	2	6	5990	5995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465767
91	NC_020944	AGA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465767
92	NC_020944	TGG	2	6	6035	6040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478465767
93	NC_020944	AGA	3	9	6053	6061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465767
94	NC_020944	GGA	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465767
95	NC_020944	TCA	2	6	6247	6252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465767
96	NC_020944	GGA	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465767
97	NC_020944	CTT	2	6	6344	6349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465767
98	NC_020944	CTG	2	6	6350	6355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465767
99	NC_020944	CAG	2	6	6505	6510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465767
100	NC_020944	AGG	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465768
101	NC_020944	GAA	2	6	7078	7083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465768
102	NC_020944	GCA	2	6	7342	7347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465768
103	NC_020944	AAG	2	6	7383	7388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465768
104	NC_020944	TGC	2	6	7416	7421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465768
105	NC_020944	TCC	2	6	7953	7958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465769
106	NC_020944	GTT	2	6	8061	8066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465769
107	NC_020944	TTA	2	6	8431	8436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465769
108	NC_020944	TTC	2	6	8754	8759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465769
109	NC_020944	GAA	2	6	8898	8903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465770
110	NC_020944	ACC	2	6	9026	9031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478465770
111	NC_020944	CTT	2	6	9079	9084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465770
112	NC_020944	GAG	2	6	9159	9164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465770
113	NC_020944	ATA	2	6	9176	9181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465770
114	NC_020944	AGG	2	6	9200	9205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465770
115	NC_020944	GAA	2	6	9380	9385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465770
116	NC_020944	CAG	2	6	9396	9401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465770
117	NC_020944	TGT	2	6	9467	9472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465770
118	NC_020944	GAG	2	6	9482	9487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465770
119	NC_020944	TAC	2	6	9550	9555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465770
120	NC_020944	GTT	2	6	9654	9659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465770
121	NC_020944	AAG	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465770
122	NC_020944	GAG	2	6	9704	9709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465770
123	NC_020944	TTA	2	6	9991	9996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465771
124	NC_020944	AGA	2	6	10026	10031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465771
125	NC_020944	TGC	2	6	10256	10261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465771
126	NC_020944	GAA	2	6	10283	10288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465771
127	NC_020944	TCG	2	6	10343	10348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465771
128	NC_020944	TGG	2	6	10366	10371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478465771
129	NC_020944	GTA	2	6	10417	10422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465772
130	NC_020944	AGC	2	6	10577	10582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465772
131	NC_020944	CTT	2	6	10591	10596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465772
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163	NC_020944	TAC	2	6	13286	13291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465774
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