MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/7249 complete genome

Total Repeats: 20431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_020944	CTG	2	6	180466	180471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465916
3503	NC_020944	CTG	2	6	180474	180479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465916
3504	NC_020944	AGA	3	9	180508	180516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465916
3505	NC_020944	T	7	7	180541	180547	0 %	100 %	0 %	0 %	478465916
3506	NC_020944	TCA	2	6	180579	180584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465916
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3508	NC_020944	TA	3	6	180601	180606	50 %	50 %	0 %	0 %	478465916
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3511	NC_020944	TAG	2	6	180851	180856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465916
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3513	NC_020944	CTC	2	6	180885	180890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465916
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3515	NC_020944	ATT	2	6	181003	181008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465916
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3517	NC_020944	TGA	2	6	181259	181264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465916
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3519	NC_020944	GAA	2	6	181322	181327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465916
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3521	NC_020944	AAG	3	9	181350	181358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465916
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3523	NC_020944	TTGAA	2	10	181957	181966	40 %	40 %	20 %	0 %	478465917
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3530	NC_020944	T	6	6	182176	182181	0 %	100 %	0 %	0 %	478465917
3531	NC_020944	CTC	2	6	182205	182210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478465917
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3554	NC_020944	T	7	7	183294	183300	0 %	100 %	0 %	0 %	478465918
3555	NC_020944	AAG	2	6	183347	183352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465918
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3562	NC_020944	TGA	2	6	183617	183622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465918
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3603	NC_020944	CTG	2	6	185238	185243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465920
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3611	NC_020944	GCA	2	6	185736	185741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465921
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3614	NC_020944	ATA	2	6	186162	186167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478465921
3615	NC_020944	TCTA	2	8	186203	186210	25 %	50 %	0 %	25 %	478465921
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3621	NC_020944	TG	3	6	186927	186932	0 %	50 %	50 %	0 %	478465923
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3992	NC_020944	CT	3	6	206626	206631	0 %	50 %	0 %	50 %	478465949
3993	NC_020944	CTA	2	6	206639	206644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465949
3994	NC_020944	GA	3	6	206645	206650	50 %	0 %	50 %	0 %	478465949
3995	NC_020944	CGA	2	6	206746	206751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465949
3996	NC_020944	ATC	2	6	206784	206789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465949
3997	NC_020944	TCT	2	6	206795	206800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478465949
3998	NC_020944	ATT	2	6	206924	206929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465949
3999	NC_020944	AAACC	2	10	207120	207129	60 %	0 %	0 %	40 %	478465949
4000	NC_020944	GCA	2	6	207156	207161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465949

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