MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/7249 complete genome

Total Repeats: 20431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3003	NC_020944	GCA	2	6	154653	154658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478465898
3004	NC_020944	GAG	2	6	154663	154668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465898
3005	NC_020944	ATT	2	6	154758	154763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465898
3006	NC_020944	CTGT	2	8	154795	154802	0 %	50 %	25 %	25 %	478465898
3007	NC_020944	AGA	2	6	154818	154823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465898
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3010	NC_020944	ATC	2	6	154964	154969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478465898
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3012	NC_020944	CTG	2	6	155051	155056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478465898
3013	NC_020944	GAA	2	6	155080	155085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478465898
3014	NC_020944	GAG	2	6	155146	155151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465898
3015	NC_020944	A	6	6	155249	155254	100 %	0 %	0 %	0 %	478465898
3016	NC_020944	TGT	2	6	155265	155270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478465898
3017	NC_020944	CCTCAT	2	12	155341	155352	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478465898
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3021	NC_020944	TTCTT	2	10	155639	155648	0 %	80 %	0 %	20 %	478465899
3022	NC_020944	GACT	2	8	155667	155674	25 %	25 %	25 %	25 %	478465899
3023	NC_020944	GTA	2	6	155721	155726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465899
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3030	NC_020944	TTA	2	6	156065	156070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478465899
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3044	NC_020944	CCCA	2	8	157022	157029	25 %	0 %	0 %	75 %	478465900
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3058	NC_020944	AG	3	6	157515	157520	50 %	0 %	50 %	0 %	478465900
3059	NC_020944	AG	3	6	157580	157585	50 %	0 %	50 %	0 %	478465900
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3067	NC_020944	CTTG	2	8	158068	158075	0 %	50 %	25 %	25 %	478465901
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3118	NC_020944	A	8	8	160952	160959	100 %	0 %	0 %	0 %	478465904
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3492	NC_020944	TGA	3	9	179981	179989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465915
3493	NC_020944	TGA	2	6	180015	180020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465915
3494	NC_020944	TGG	2	6	180141	180146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478465915
3495	NC_020944	GAG	2	6	180156	180161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478465915
3496	NC_020944	AGT	2	6	180167	180172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465915
3497	NC_020944	GAT	2	6	180261	180266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465915
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3499	NC_020944	GCG	2	6	180296	180301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478465915
3500	NC_020944	TGA	2	6	180350	180355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478465915

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