MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/7249 complete genome

Total Repeats: 20431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_020944	CTAT	2	8	633489	633496	25 %	50 %	0 %	25 %	478466336
12503	NC_020944	ACTC	2	8	633523	633530	25 %	25 %	0 %	50 %	478466336
12504	NC_020944	CTAC	2	8	633549	633556	25 %	25 %	0 %	50 %	478466336
12505	NC_020944	ATG	2	6	633569	633574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478466336
12506	NC_020944	TGA	2	6	633606	633611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478466336
12507	NC_020944	ATT	2	6	633777	633782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478466336
12508	NC_020944	TTTA	2	8	633812	633819	25 %	75 %	0 %	0 %	478466336
12509	NC_020944	TTCG	2	8	633830	633837	0 %	50 %	25 %	25 %	478466336
12510	NC_020944	AACCTC	2	12	633886	633897	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	478466336
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12512	NC_020944	TCT	2	6	634075	634080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478466337
12513	NC_020944	AC	3	6	634110	634115	50 %	0 %	0 %	50 %	478466337
12514	NC_020944	AGC	2	6	634193	634198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478466337
12515	NC_020944	AGG	2	6	634208	634213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478466337
12516	NC_020944	AAC	2	6	634222	634227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478466337
12517	NC_020944	CTT	2	6	634317	634322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478466337
12518	NC_020944	A	6	6	634366	634371	100 %	0 %	0 %	0 %	478466337
12519	NC_020944	AAG	2	6	634381	634386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478466337
12520	NC_020944	TCG	2	6	634432	634437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478466337
12521	NC_020944	GAA	3	9	634467	634475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478466337
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12523	NC_020944	TAT	2	6	634541	634546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478466337
12524	NC_020944	CTT	2	6	634627	634632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478466337
12525	NC_020944	ATGAA	2	10	634672	634681	60 %	20 %	20 %	0 %	478466337
12526	NC_020944	AC	5	10	634806	634815	50 %	0 %	0 %	50 %	478466337
12527	NC_020944	CT	3	6	634872	634877	0 %	50 %	0 %	50 %	478466337
12528	NC_020944	AGC	2	6	634916	634921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478466337
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12532	NC_020944	TGA	2	6	635060	635065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478466338
12533	NC_020944	TCT	2	6	635090	635095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478466338
12534	NC_020944	CAT	2	6	635109	635114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478466338
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12536	NC_020944	TCCC	2	8	635203	635210	0 %	25 %	0 %	75 %	478466338
12537	NC_020944	ATT	2	6	635225	635230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478466338
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12541	NC_020944	TCC	2	6	635360	635365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478466338
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12544	NC_020944	GT	3	6	635527	635532	0 %	50 %	50 %	0 %	478466338
12545	NC_020944	ACGGA	2	10	635541	635550	40 %	0 %	40 %	20 %	478466338
12546	NC_020944	ATT	2	6	635560	635565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478466338
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12551	NC_020944	AT	3	6	636137	636142	50 %	50 %	0 %	0 %	478466339
12552	NC_020944	GTC	2	6	636155	636160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478466339
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12554	NC_020944	A	6	6	636167	636172	100 %	0 %	0 %	0 %	478466339
12555	NC_020944	TC	3	6	636175	636180	0 %	50 %	0 %	50 %	478466339
12556	NC_020944	AAG	2	6	636234	636239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478466339
12557	NC_020944	GAA	2	6	636269	636274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478466339
12558	NC_020944	AGGA	2	8	636315	636322	50 %	0 %	50 %	0 %	478466339
12559	NC_020944	TTA	2	6	636354	636359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478466339
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12561	NC_020944	ATC	2	6	636431	636436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478466339
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12564	NC_020944	CT	3	6	636611	636616	0 %	50 %	0 %	50 %	478466339
12565	NC_020944	A	6	6	636737	636742	100 %	0 %	0 %	0 %	478466339
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12605	NC_020944	TGC	2	6	637980	637985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478466341
12606	NC_020944	GGCTC	2	10	638054	638063	0 %	20 %	40 %	40 %	478466342
12607	NC_020944	TA	3	6	638077	638082	50 %	50 %	0 %	0 %	478466342
12608	NC_020944	AGCC	2	8	638090	638097	25 %	0 %	25 %	50 %	478466342
12609	NC_020944	TCTT	2	8	638114	638121	0 %	75 %	0 %	25 %	478466342
12610	NC_020944	ATC	2	6	638155	638160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478466342
12611	NC_020944	CT	3	6	638212	638217	0 %	50 %	0 %	50 %	478466342
12612	NC_020944	TGC	2	6	638228	638233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478466342
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12984	NC_020944	GCT	2	6	655708	655713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478466358
12985	NC_020944	CAG	2	6	655779	655784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478466358
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12987	NC_020944	ATAA	2	8	655896	655903	75 %	25 %	0 %	0 %	478466358
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