MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 20385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020942	TAT	2	6	207753	207758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456022
4003	NC_020942	GTT	2	6	207835	207840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456023
4004	NC_020942	GATA	2	8	207849	207856	50 %	25 %	25 %	0 %	478456023
4005	NC_020942	TCA	2	6	207897	207902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456023
4006	NC_020942	T	7	7	207925	207931	0 %	100 %	0 %	0 %	478456023
4007	NC_020942	AAG	2	6	207940	207945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456023
4008	NC_020942	GAA	2	6	208189	208194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456023
4009	NC_020942	GAA	2	6	208201	208206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456023
4010	NC_020942	GAAA	2	8	208215	208222	75 %	0 %	25 %	0 %	478456023
4011	NC_020942	ACC	2	6	208250	208255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478456023
4012	NC_020942	A	6	6	208269	208274	100 %	0 %	0 %	0 %	478456023
4013	NC_020942	A	6	6	208298	208303	100 %	0 %	0 %	0 %	478456023
4014	NC_020942	AG	3	6	208352	208357	50 %	0 %	50 %	0 %	478456023
4015	NC_020942	TGC	2	6	208406	208411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456023
4016	NC_020942	AGG	2	6	208427	208432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456023
4017	NC_020942	GGT	2	6	208446	208451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478456024
4018	NC_020942	TGC	2	6	208460	208465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456024
4019	NC_020942	TTTA	2	8	208489	208496	25 %	75 %	0 %	0 %	478456024
4020	NC_020942	CAT	2	6	208566	208571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456024
4021	NC_020942	CTT	3	9	208596	208604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456024
4022	NC_020942	TTTC	2	8	208635	208642	0 %	75 %	0 %	25 %	478456024
4023	NC_020942	ACA	2	6	208718	208723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456024
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4032	NC_020942	AAT	2	6	209103	209108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456024
4033	NC_020942	T	7	7	209466	209472	0 %	100 %	0 %	0 %	478456025
4034	NC_020942	TGAA	2	8	209504	209511	50 %	25 %	25 %	0 %	478456025
4035	NC_020942	TCG	2	6	209618	209623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456025
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4038	NC_020942	CAAGA	2	10	209945	209954	60 %	0 %	20 %	20 %	478456025
4039	NC_020942	AG	3	6	210001	210006	50 %	0 %	50 %	0 %	478456025
4040	NC_020942	TCC	2	6	210039	210044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456025
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4044	NC_020942	ATA	2	6	210146	210151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456025
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4056	NC_020942	CTTTA	2	10	210995	211004	20 %	60 %	0 %	20 %	478456026
4057	NC_020942	TCC	2	6	211108	211113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456026
4058	NC_020942	TCTA	2	8	211172	211179	25 %	50 %	0 %	25 %	478456026
4059	NC_020942	TATT	2	8	211250	211257	25 %	75 %	0 %	0 %	478456026
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4062	NC_020942	CTA	2	6	211339	211344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456027
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4110	NC_020942	CT	3	6	214073	214078	0 %	50 %	0 %	50 %	478456029
4111	NC_020942	TTC	2	6	214162	214167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456029
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4116	NC_020942	A	6	6	214277	214282	100 %	0 %	0 %	0 %	478456029
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4122	NC_020942	TTAC	2	8	214476	214483	25 %	50 %	0 %	25 %	478456029
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4124	NC_020942	A	6	6	214534	214539	100 %	0 %	0 %	0 %	478456029
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4247	NC_020942	CCAT	2	8	220481	220488	25 %	25 %	0 %	50 %	478456034
4248	NC_020942	GA	3	6	220499	220504	50 %	0 %	50 %	0 %	478456034
4249	NC_020942	T	6	6	220519	220524	0 %	100 %	0 %	0 %	478456034
4250	NC_020942	AGG	2	6	220543	220548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456034
4251	NC_020942	CATT	2	8	220565	220572	25 %	50 %	0 %	25 %	478456034
4252	NC_020942	AGA	2	6	220599	220604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456034
4253	NC_020942	CAA	2	6	220612	220617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456034
4254	NC_020942	ATA	4	12	220655	220666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456034
4255	NC_020942	GCT	2	6	220724	220729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456034
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4257	NC_020942	ACG	2	6	220825	220830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456034
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4259	NC_020942	CT	3	6	220972	220977	0 %	50 %	0 %	50 %	478456034
4260	NC_020942	CT	3	6	220980	220985	0 %	50 %	0 %	50 %	478456034
4261	NC_020942	AGC	2	6	220987	220992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456034
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4264	NC_020942	TGTTT	2	10	221129	221138	0 %	80 %	20 %	0 %	478456034
4265	NC_020942	CTA	2	6	221181	221186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456034
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4267	NC_020942	TAGA	2	8	221232	221239	50 %	25 %	25 %	0 %	478456034
4268	NC_020942	CTTGT	2	10	221310	221319	0 %	60 %	20 %	20 %	478456034
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4272	NC_020942	CG	3	6	221605	221610	0 %	0 %	50 %	50 %	478456034
4273	NC_020942	CTGGAT	2	12	221637	221648	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478456034
4274	NC_020942	GTA	2	6	221862	221867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456034
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4277	NC_020942	GAAATA	2	12	221960	221971	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478456034
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4280	NC_020942	CGT	2	6	222153	222158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456034
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4284	NC_020942	CTT	2	6	222357	222362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456035
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4350	NC_020942	TA	3	6	225983	225988	50 %	50 %	0 %	0 %	478456038
4351	NC_020942	CTG	2	6	226025	226030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456038
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4353	NC_020942	TCA	2	6	226069	226074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456038
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4355	NC_020942	ATG	2	6	226580	226585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456039
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4357	NC_020942	AGA	2	6	226657	226662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456039
4358	NC_020942	AAC	2	6	226682	226687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456039
4359	NC_020942	CTC	2	6	226730	226735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456039
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4361	NC_020942	A	6	6	226760	226765	100 %	0 %	0 %	0 %	478456039
4362	NC_020942	CTC	2	6	226775	226780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456039
4363	NC_020942	CGAA	2	8	226782	226789	50 %	0 %	25 %	25 %	478456039
4364	NC_020942	ATT	2	6	226797	226802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456039
4365	NC_020942	GCT	2	6	226882	226887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456039
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4367	NC_020942	AACA	2	8	226949	226956	75 %	0 %	0 %	25 %	478456039
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4494	NC_020942	TAT	2	6	232393	232398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456044
4495	NC_020942	TGT	2	6	232437	232442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456044
4496	NC_020942	ATT	2	6	232514	232519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456044
4497	NC_020942	TCA	2	6	232566	232571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456044
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4499	NC_020942	CATT	2	8	232633	232640	25 %	50 %	0 %	25 %	478456044
4500	NC_020942	CTT	2	6	232663	232668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456044

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