MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 20385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_020942	CTG	2	6	155115	155120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455977
3003	NC_020942	GAA	2	6	155144	155149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455977
3004	NC_020942	GAG	2	6	155210	155215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478455977
3005	NC_020942	A	6	6	155313	155318	100 %	0 %	0 %	0 %	478455977
3006	NC_020942	TGT	2	6	155329	155334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455977
3007	NC_020942	CCTCAT	2	12	155405	155416	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478455977
3008	NC_020942	AGGC	2	8	155435	155442	25 %	0 %	50 %	25 %	478455977
3009	NC_020942	GAGT	2	8	155523	155530	25 %	25 %	50 %	0 %	478455977
3010	NC_020942	CAC	2	6	155675	155680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478455978
3011	NC_020942	TTCTT	2	10	155703	155712	0 %	80 %	0 %	20 %	478455978
3012	NC_020942	GACT	2	8	155731	155738	25 %	25 %	25 %	25 %	478455978
3013	NC_020942	GTA	2	6	155785	155790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455978
3014	NC_020942	TGT	2	6	155854	155859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455978
3015	NC_020942	TA	3	6	155883	155888	50 %	50 %	0 %	0 %	478455978
3016	NC_020942	TGG	3	9	155918	155926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478455978
3017	NC_020942	TTG	2	6	155976	155981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455978
3018	NC_020942	GAT	2	6	156033	156038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455978
3019	NC_020942	CG	3	6	156102	156107	0 %	0 %	50 %	50 %	478455978
3020	NC_020942	TTA	2	6	156129	156134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455978
3021	NC_020942	T	7	7	156288	156294	0 %	100 %	0 %	0 %	478455978
3022	NC_020942	GAA	2	6	156303	156308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455978
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3029	NC_020942	TGGAGA	2	12	156863	156874	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	478455979
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3031	NC_020942	GCA	2	6	156936	156941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455979
3032	NC_020942	TAGA	2	8	156958	156965	50 %	25 %	25 %	0 %	478455979
3033	NC_020942	AG	3	6	157033	157038	50 %	0 %	50 %	0 %	478455979
3034	NC_020942	CCCA	2	8	157086	157093	25 %	0 %	0 %	75 %	478455979
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3049	NC_020942	AG	3	6	157644	157649	50 %	0 %	50 %	0 %	478455979
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3054	NC_020942	ACAT	2	8	157749	157756	50 %	25 %	0 %	25 %	478455979
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3057	NC_020942	CTTG	2	8	158131	158138	0 %	50 %	25 %	25 %	478455980
3058	NC_020942	GA	3	6	158147	158152	50 %	0 %	50 %	0 %	478455980
3059	NC_020942	GCA	2	6	158200	158205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455980
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3061	NC_020942	CTCCAT	2	12	158232	158243	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478455980
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3101	NC_020942	GA	3	6	160829	160834	50 %	0 %	50 %	0 %	478455983
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3105	NC_020942	A	8	8	161014	161021	100 %	0 %	0 %	0 %	478455983
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3494	NC_020942	AAG	3	9	180992	181000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455995
3495	NC_020942	T	6	6	181416	181421	0 %	100 %	0 %	0 %	478455996
3496	NC_020942	TTGAA	2	10	181442	181451	40 %	40 %	20 %	0 %	478455996
3497	NC_020942	TTTG	2	8	181456	181463	0 %	75 %	25 %	0 %	478455996
3498	NC_020942	TGCA	2	8	181574	181581	25 %	25 %	25 %	25 %	478455996
3499	NC_020942	TGT	2	6	181592	181597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455996
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