MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 20385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2242	NC_020942	A	6	6	117284	117289	100 %	0 %	0 %	0 %	478455939
2243	NC_020942	GTTC	2	8	117340	117347	0 %	50 %	25 %	25 %	478455939
2244	NC_020942	TAA	2	6	117360	117365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478455939
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2246	NC_020942	GCT	2	6	117394	117399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455939
2247	NC_020942	AGG	2	6	117444	117449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478455939
2248	NC_020942	ATT	2	6	117478	117483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455939
2249	NC_020942	TTC	2	6	117495	117500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455939
2250	NC_020942	TGC	2	6	117525	117530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455939
2251	NC_020942	CTG	2	6	117572	117577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455939
2252	NC_020942	GCA	2	6	117777	117782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455940
2253	NC_020942	TGC	2	6	117788	117793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455940
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2262	NC_020942	CA	3	6	118401	118406	50 %	0 %	0 %	50 %	478455941
2263	NC_020942	AT	3	6	118607	118612	50 %	50 %	0 %	0 %	478455942
2264	NC_020942	T	6	6	118617	118622	0 %	100 %	0 %	0 %	478455942
2265	NC_020942	AGA	3	9	118623	118631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455942
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2267	NC_020942	GTAG	2	8	118705	118712	25 %	25 %	50 %	0 %	478455942
2268	NC_020942	G	6	6	118753	118758	0 %	0 %	100 %	0 %	478455942
2269	NC_020942	T	6	6	118776	118781	0 %	100 %	0 %	0 %	478455942
2270	NC_020942	GTT	2	6	118894	118899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455942
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2275	NC_020942	CTC	2	6	118994	118999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478455942
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2279	NC_020942	T	6	6	119204	119209	0 %	100 %	0 %	0 %	478455943
2280	NC_020942	TTC	2	6	119290	119295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455943
2281	NC_020942	TCC	2	6	119303	119308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478455943
2282	NC_020942	TTTA	2	8	119321	119328	25 %	75 %	0 %	0 %	478455943
2283	NC_020942	CTG	2	6	119519	119524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455943
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2296	NC_020942	GCTA	2	8	120051	120058	25 %	25 %	25 %	25 %	478455944
2297	NC_020942	GA	3	6	120062	120067	50 %	0 %	50 %	0 %	478455944
2298	NC_020942	AAG	2	6	120070	120075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455944
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2303	NC_020942	GCTA	2	8	120183	120190	25 %	25 %	25 %	25 %	478455944
2304	NC_020942	CGGC	2	8	120232	120239	0 %	0 %	50 %	50 %	478455944
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2312	NC_020942	TCT	2	6	120607	120612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455944
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2321	NC_020942	CTG	2	6	121237	121242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455945
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2349	NC_020942	ATC	2	6	122870	122875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455945
2350	NC_020942	AAAG	2	8	122997	123004	75 %	0 %	25 %	0 %	478455945
2351	NC_020942	GA	3	6	123017	123022	50 %	0 %	50 %	0 %	478455945
2352	NC_020942	GCTTC	2	10	123025	123034	0 %	40 %	20 %	40 %	478455945
2353	NC_020942	TCTA	2	8	123066	123073	25 %	50 %	0 %	25 %	478455945
2354	NC_020942	ACT	2	6	123227	123232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455946
2355	NC_020942	AAGGGT	2	12	123297	123308	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	478455946
2356	NC_020942	AG	3	6	123323	123328	50 %	0 %	50 %	0 %	478455946
2357	NC_020942	T	6	6	123339	123344	0 %	100 %	0 %	0 %	478455946
2358	NC_020942	AGCT	2	8	123372	123379	25 %	25 %	25 %	25 %	478455946
2359	NC_020942	CAA	2	6	123441	123446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478455946
2360	NC_020942	GGC	2	6	123504	123509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478455946
2361	NC_020942	AAG	2	6	123511	123516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455946
2362	NC_020942	ATA	2	6	123597	123602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478455946
2363	NC_020942	TAA	2	6	123726	123731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478455946
2364	NC_020942	TGA	2	6	123815	123820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455946
2365	NC_020942	TCC	2	6	123875	123880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478455946
2366	NC_020942	GAT	2	6	123907	123912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455946
2367	NC_020942	T	7	7	124014	124020	0 %	100 %	0 %	0 %	478455946
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2369	NC_020942	T	6	6	124159	124164	0 %	100 %	0 %	0 %	478455947
2370	NC_020942	GA	3	6	124237	124242	50 %	0 %	50 %	0 %	478455947
2371	NC_020942	GGGTTT	2	12	124260	124271	0 %	50 %	50 %	0 %	478455947
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2485	NC_020942	GTA	2	6	129384	129389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455952
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2491	NC_020942	CTT	2	6	129620	129625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455952
2492	NC_020942	ACC	2	6	129762	129767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478455952
2493	NC_020942	CGT	2	6	129788	129793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455952
2494	NC_020942	GAA	2	6	129815	129820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455952
2495	NC_020942	CATC	2	8	129895	129902	25 %	25 %	0 %	50 %	478455952
2496	NC_020942	CTT	2	6	129980	129985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455952
2497	NC_020942	AAT	2	6	129992	129997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478455952
2498	NC_020942	CAT	2	6	130034	130039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455952
2499	NC_020942	GA	3	6	130054	130059	50 %	0 %	50 %	0 %	478455952
2500	NC_020942	GT	5	10	130101	130110	0 %	50 %	50 %	0 %	478455952

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