MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 20385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020942	GCT	2	6	79683	79688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455908
1503	NC_020942	TCT	2	6	79694	79699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455908
1504	NC_020942	T	7	7	80390	80396	0 %	100 %	0 %	0 %	478455909
1505	NC_020942	TGA	2	6	80495	80500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455909
1506	NC_020942	TGTCT	2	10	80510	80519	0 %	60 %	20 %	20 %	478455909
1507	NC_020942	TGAT	2	8	80584	80591	25 %	50 %	25 %	0 %	478455909
1508	NC_020942	TCAT	2	8	80606	80613	25 %	50 %	0 %	25 %	478455909
1509	NC_020942	T	6	6	80662	80667	0 %	100 %	0 %	0 %	478455909
1510	NC_020942	GGTTTA	2	12	80673	80684	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478455909
1511	NC_020942	TCT	2	6	80774	80779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455909
1512	NC_020942	GAA	2	6	80784	80789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455909
1513	NC_020942	TGC	2	6	80834	80839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455909
1514	NC_020942	CAA	2	6	80868	80873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478455909
1515	NC_020942	GAA	2	6	80886	80891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455909
1516	NC_020942	GGA	2	6	80930	80935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478455909
1517	NC_020942	TC	4	8	80958	80965	0 %	50 %	0 %	50 %	478455909
1518	NC_020942	A	7	7	80977	80983	100 %	0 %	0 %	0 %	478455909
1519	NC_020942	TTACT	2	10	81017	81026	20 %	60 %	0 %	20 %	478455909
1520	NC_020942	TATC	2	8	81033	81040	25 %	50 %	0 %	25 %	478455909
1521	NC_020942	GA	3	6	81051	81056	50 %	0 %	50 %	0 %	478455909
1522	NC_020942	TAT	2	6	81131	81136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455909
1523	NC_020942	AGA	2	6	81335	81340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455909
1524	NC_020942	GGGA	2	8	81344	81351	25 %	0 %	75 %	0 %	478455909
1525	NC_020942	CTGC	2	8	81448	81455	0 %	25 %	25 %	50 %	478455910
1526	NC_020942	GCT	2	6	81466	81471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455910
1527	NC_020942	ATT	2	6	81472	81477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455910
1528	NC_020942	CTT	2	6	81515	81520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455910
1529	NC_020942	CTT	2	6	81536	81541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455910
1530	NC_020942	CAT	2	6	81583	81588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455910
1531	NC_020942	TGA	2	6	81705	81710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455910
1532	NC_020942	AGG	2	6	81716	81721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478455910
1533	NC_020942	GGTT	2	8	81741	81748	0 %	50 %	50 %	0 %	478455910
1534	NC_020942	GTC	2	6	81764	81769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455910
1535	NC_020942	CT	3	6	81781	81786	0 %	50 %	0 %	50 %	478455910
1536	NC_020942	GGA	2	6	81787	81792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478455910
1537	NC_020942	CAA	2	6	81793	81798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478455910
1538	NC_020942	AG	3	6	81800	81805	50 %	0 %	50 %	0 %	478455910
1539	NC_020942	T	6	6	81807	81812	0 %	100 %	0 %	0 %	478455910
1540	NC_020942	CGAT	2	8	81869	81876	25 %	25 %	25 %	25 %	478455910
1541	NC_020942	TCAT	2	8	81944	81951	25 %	50 %	0 %	25 %	478455910
1542	NC_020942	TTA	2	6	81994	81999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455910
1543	NC_020942	TG	3	6	82011	82016	0 %	50 %	50 %	0 %	478455910
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1547	NC_020942	T	6	6	82179	82184	0 %	100 %	0 %	0 %	478455911
1548	NC_020942	GAC	2	6	82206	82211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455911
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1550	NC_020942	TTA	2	6	82252	82257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455911
1551	NC_020942	CTT	2	6	82306	82311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455911
1552	NC_020942	TTA	2	6	82349	82354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455911
1553	NC_020942	T	6	6	82357	82362	0 %	100 %	0 %	0 %	478455911
1554	NC_020942	AGAAA	2	10	82407	82416	80 %	0 %	20 %	0 %	478455911
1555	NC_020942	T	6	6	82462	82467	0 %	100 %	0 %	0 %	478455911
1556	NC_020942	GTTA	2	8	82486	82493	25 %	50 %	25 %	0 %	478455911
1557	NC_020942	ACA	2	6	82520	82525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478455911
1558	NC_020942	GCG	2	6	82552	82557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478455911
1559	NC_020942	T	6	6	82595	82600	0 %	100 %	0 %	0 %	478455911
1560	NC_020942	TGG	3	9	82621	82629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478455911
1561	NC_020942	CAG	2	6	82697	82702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455911
1562	NC_020942	GTT	2	6	82708	82713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455911
1563	NC_020942	TATT	2	8	82718	82725	25 %	75 %	0 %	0 %	478455911
1564	NC_020942	GTG	2	6	82742	82747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478455911
1565	NC_020942	CCT	2	6	82792	82797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478455911
1566	NC_020942	GGAAG	2	10	82920	82929	40 %	0 %	60 %	0 %	478455911
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1569	NC_020942	TTC	2	6	82969	82974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455911
1570	NC_020942	T	6	6	83003	83008	0 %	100 %	0 %	0 %	478455911
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1573	NC_020942	GA	3	6	83133	83138	50 %	0 %	50 %	0 %	478455911
1574	NC_020942	GTTC	2	8	83143	83150	0 %	50 %	25 %	25 %	478455911
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1584	NC_020942	T	6	6	83553	83558	0 %	100 %	0 %	0 %	478455912
1585	NC_020942	GTA	2	6	83639	83644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455912
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1594	NC_020942	CATT	2	8	83812	83819	25 %	50 %	0 %	25 %	478455912
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1598	NC_020942	ATTA	2	8	84004	84011	50 %	50 %	0 %	0 %	478455912
1599	NC_020942	TTTG	2	8	84044	84051	0 %	75 %	25 %	0 %	478455912
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1603	NC_020942	CTA	2	6	84356	84361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455912
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1611	NC_020942	AG	3	6	84607	84612	50 %	0 %	50 %	0 %	478455913
1612	NC_020942	GAA	2	6	84640	84645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455913
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1615	NC_020942	AG	3	6	84874	84879	50 %	0 %	50 %	0 %	478455913
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1617	NC_020942	GAAG	2	8	84937	84944	50 %	0 %	50 %	0 %	478455913
1618	NC_020942	A	6	6	84961	84966	100 %	0 %	0 %	0 %	478455913
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1626	NC_020942	ACA	2	6	85266	85271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478455913
1627	NC_020942	TTTC	2	8	85321	85328	0 %	75 %	0 %	25 %	478455913
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