MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 20385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_020942	T	6	6	27880	27885	0 %	100 %	0 %	0 %	478455863
503	NC_020942	TGA	2	6	27893	27898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455863
504	NC_020942	GGAGA	2	10	27901	27910	40 %	0 %	60 %	0 %	478455863
505	NC_020942	A	7	7	27951	27957	100 %	0 %	0 %	0 %	478455863
506	NC_020942	AAG	2	6	27968	27973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455863
507	NC_020942	T	6	6	27988	27993	0 %	100 %	0 %	0 %	478455863
508	NC_020942	A	8	8	28085	28092	100 %	0 %	0 %	0 %	478455864
509	NC_020942	TTC	2	6	28129	28134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455864
510	NC_020942	GTTT	2	8	28147	28154	0 %	75 %	25 %	0 %	478455864
511	NC_020942	CAGA	2	8	28169	28176	50 %	0 %	25 %	25 %	478455864
512	NC_020942	TTC	2	6	28247	28252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455864
513	NC_020942	AAG	2	6	28262	28267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455864
514	NC_020942	TTC	2	6	28362	28367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455864
515	NC_020942	AAG	2	6	28376	28381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455864
516	NC_020942	AAG	2	6	28394	28399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455864
517	NC_020942	A	6	6	28400	28405	100 %	0 %	0 %	0 %	478455864
518	NC_020942	GAA	2	6	28632	28637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455865
519	NC_020942	ATCCG	2	10	28652	28661	20 %	20 %	20 %	40 %	478455865
520	NC_020942	TTC	2	6	28765	28770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455865
521	NC_020942	TAG	2	6	28813	28818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455865
522	NC_020942	AGA	2	6	28826	28831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455865
523	NC_020942	GAT	3	9	28908	28916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455865
524	NC_020942	GAG	2	6	28951	28956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478455865
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528	NC_020942	AGGGT	2	10	29170	29179	20 %	20 %	60 %	0 %	478455865
529	NC_020942	TTC	2	6	29206	29211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455865
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531	NC_020942	GAA	2	6	29232	29237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455865
532	NC_020942	TGA	2	6	29246	29251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455865
533	NC_020942	TTC	2	6	29279	29284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455865
534	NC_020942	GC	4	8	29450	29457	0 %	0 %	50 %	50 %	478455865
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536	NC_020942	TA	3	6	29572	29577	50 %	50 %	0 %	0 %	478455865
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541	NC_020942	ATG	2	6	29999	30004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455866
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543	NC_020942	TTTG	2	8	30156	30163	0 %	75 %	25 %	0 %	478455866
544	NC_020942	TTGT	2	8	30191	30198	0 %	75 %	25 %	0 %	478455866
545	NC_020942	CCTAT	2	10	30210	30219	20 %	40 %	0 %	40 %	478455866
546	NC_020942	T	6	6	30226	30231	0 %	100 %	0 %	0 %	478455866
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549	NC_020942	T	8	8	30460	30467	0 %	100 %	0 %	0 %	478455866
550	NC_020942	ATG	2	6	30485	30490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455866
551	NC_020942	GA	3	6	30523	30528	50 %	0 %	50 %	0 %	478455866
552	NC_020942	AG	3	6	30621	30626	50 %	0 %	50 %	0 %	478455867
553	NC_020942	GTT	2	6	30702	30707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455867
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556	NC_020942	TCT	2	6	30777	30782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455867
557	NC_020942	ACT	2	6	30867	30872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455867
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561	NC_020942	AAAC	2	8	30984	30991	75 %	0 %	0 %	25 %	478455867
562	NC_020942	T	6	6	31001	31006	0 %	100 %	0 %	0 %	478455867
563	NC_020942	AAGGA	2	10	31010	31019	60 %	0 %	40 %	0 %	478455867
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566	NC_020942	GATG	2	8	31127	31134	25 %	25 %	50 %	0 %	478455867
567	NC_020942	TAG	2	6	31138	31143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455867
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587	NC_020942	A	6	6	32154	32159	100 %	0 %	0 %	0 %	478455868
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599	NC_020942	CT	3	6	32725	32730	0 %	50 %	0 %	50 %	478455869
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617	NC_020942	T	6	6	34106	34111	0 %	100 %	0 %	0 %	478455871
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619	NC_020942	TGA	2	6	34231	34236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455871
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621	NC_020942	TC	3	6	34354	34359	0 %	50 %	0 %	50 %	478455871
622	NC_020942	AG	3	6	34367	34372	50 %	0 %	50 %	0 %	478455871
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628	NC_020942	T	6	6	34636	34641	0 %	100 %	0 %	0 %	478455872
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