MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 20385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_020942	TTA	2	6	232770	232775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456045
4503	NC_020942	GTC	2	6	232791	232796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456045
4504	NC_020942	AAC	2	6	232895	232900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456045
4505	NC_020942	GAA	2	6	232954	232959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456045
4506	NC_020942	GAA	2	6	233021	233026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456045
4507	NC_020942	CAT	2	6	233109	233114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456045
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4509	NC_020942	ATTGCT	2	12	233247	233258	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478456045
4510	NC_020942	ATT	2	6	233280	233285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456045
4511	NC_020942	ACA	2	6	233298	233303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456045
4512	NC_020942	CTA	2	6	233376	233381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456045
4513	NC_020942	TCA	2	6	233383	233388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456045
4514	NC_020942	TG	3	6	233416	233421	0 %	50 %	50 %	0 %	478456045
4515	NC_020942	TCCTAG	2	12	233537	233548	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478456045
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4517	NC_020942	AAC	2	6	233652	233657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456046
4518	NC_020942	GAG	2	6	233691	233696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456046
4519	NC_020942	CT	3	6	233737	233742	0 %	50 %	0 %	50 %	478456046
4520	NC_020942	GATT	2	8	233788	233795	25 %	50 %	25 %	0 %	478456046
4521	NC_020942	TCC	2	6	233803	233808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456046
4522	NC_020942	GAT	2	6	233836	233841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456046
4523	NC_020942	ATG	2	6	233873	233878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456046
4524	NC_020942	CAT	2	6	233911	233916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456046
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4526	NC_020942	AAG	2	6	233943	233948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456046
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4528	NC_020942	GCAACG	2	12	234025	234036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456046
4529	NC_020942	GT	3	6	234059	234064	0 %	50 %	50 %	0 %	478456046
4530	NC_020942	AATT	2	8	234072	234079	50 %	50 %	0 %	0 %	478456046
4531	NC_020942	ATTT	2	8	234135	234142	25 %	75 %	0 %	0 %	478456046
4532	NC_020942	T	6	6	234172	234177	0 %	100 %	0 %	0 %	478456046
4533	NC_020942	TCA	2	6	234180	234185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456046
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4543	NC_020942	TGA	2	6	234984	234989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456047
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4545	NC_020942	A	7	7	235145	235151	100 %	0 %	0 %	0 %	478456047
4546	NC_020942	CCTT	2	8	235153	235160	0 %	50 %	0 %	50 %	478456047
4547	NC_020942	TTG	2	6	235175	235180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456047
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4551	NC_020942	GAA	2	6	235297	235302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456047
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4553	NC_020942	AGA	2	6	235362	235367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456047
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4555	NC_020942	TAC	2	6	235556	235561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456048
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4557	NC_020942	TCT	2	6	235625	235630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456048
4558	NC_020942	TTTC	2	8	235701	235708	0 %	75 %	0 %	25 %	478456048
4559	NC_020942	CTT	2	6	235763	235768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456048
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4563	NC_020942	TAT	2	6	236030	236035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456048
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4574	NC_020942	CTAT	2	8	236558	236565	25 %	50 %	0 %	25 %	478456048
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4589	NC_020942	TGG	2	6	237126	237131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478456049
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4593	NC_020942	ATT	2	6	237385	237390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456049
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4603	NC_020942	GC	3	6	238239	238244	0 %	0 %	50 %	50 %	478456049
4604	NC_020942	GAC	2	6	238266	238271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456049
4605	NC_020942	A	8	8	238308	238315	100 %	0 %	0 %	0 %	478456049
4606	NC_020942	TAA	2	6	238344	238349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456049
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4617	NC_020942	AAG	2	6	238774	238779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456050
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4993	NC_020942	AGT	2	6	258267	258272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456067
4994	NC_020942	GCAG	2	8	258314	258321	25 %	0 %	50 %	25 %	478456067
4995	NC_020942	TCTT	2	8	258331	258338	0 %	75 %	0 %	25 %	478456067
4996	NC_020942	C	7	7	258343	258349	0 %	0 %	0 %	100 %	478456067
4997	NC_020942	AGA	2	6	258359	258364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456067
4998	NC_020942	CTT	2	6	258375	258380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456067
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