MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa3 complete genome

Total Repeats: 20362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_020940	TTG	2	6	282419	282424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478475020
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5504	NC_020940	AAC	2	6	282501	282506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478475020
5505	NC_020940	CAT	2	6	282509	282514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478475020
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5509	NC_020940	CTG	2	6	282584	282589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478475020
5510	NC_020940	GAA	2	6	282619	282624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478475020
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5512	NC_020940	AGCT	2	8	282715	282722	25 %	25 %	25 %	25 %	478475020
5513	NC_020940	CTG	2	6	282881	282886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478475020
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5521	NC_020940	GAG	2	6	283408	283413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478475020
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5534	NC_020940	TCT	2	6	283950	283955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478475020
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5544	NC_020940	TAC	2	6	284543	284548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478475020
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5550	NC_020940	CAT	2	6	285021	285026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478475021
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5552	NC_020940	ATC	2	6	285069	285074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478475021
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5555	NC_020940	CTG	2	6	285190	285195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478475021
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5605	NC_020940	TTTA	2	8	287424	287431	25 %	75 %	0 %	0 %	478475023
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5993	NC_020940	AGG	2	6	306950	306955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478475043
5994	NC_020940	AGA	2	6	307082	307087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478475043
5995	NC_020940	CGT	2	6	307114	307119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478475043
5996	NC_020940	TAC	2	6	307156	307161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478475043
5997	NC_020940	C	6	6	307176	307181	0 %	0 %	0 %	100 %	478475043
5998	NC_020940	GCA	2	6	307461	307466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478475044
5999	NC_020940	GCT	2	6	307500	307505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478475044
6000	NC_020940	AGA	2	6	307549	307554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478475044

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