MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa3 complete genome

Total Repeats: 20362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5110	NC_020940	ATGA	2	8	262762	262769	50 %	25 %	25 %	0 %	478475003
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5124	NC_020940	CTT	2	6	263295	263300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478475003
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5236	NC_020940	A	6	6	270518	270523	100 %	0 %	0 %	0 %	478475010
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5244	NC_020940	CTA	2	6	270912	270917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478475010
5245	NC_020940	ACTAA	2	10	270977	270986	60 %	20 %	0 %	20 %	478475010
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5492	NC_020940	CTT	2	6	281610	281615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478475019
5493	NC_020940	TCC	2	6	281785	281790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478475019
5494	NC_020940	CAG	2	6	281793	281798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478475019
5495	NC_020940	GAA	2	6	281898	281903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478475019
5496	NC_020940	CACGCG	2	12	282052	282063	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	478475019
5497	NC_020940	ATT	3	9	282076	282084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478475019
5498	NC_020940	TTTCTT	2	12	282231	282242	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478475019
5499	NC_020940	TCT	2	6	282355	282360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478475020
5500	NC_020940	TGC	2	6	282378	282383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478475020

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