MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/5291 complete genome

Total Repeats: 20432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_020939	T	8	8	27743	27750	0 %	100 %	0 %	0 %	478448638
503	NC_020939	GAA	2	6	27801	27806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448638
504	NC_020939	GGGC	2	8	27867	27874	0 %	0 %	75 %	25 %	478448638
505	NC_020939	T	6	6	27883	27888	0 %	100 %	0 %	0 %	478448638
506	NC_020939	TGA	2	6	27896	27901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448638
507	NC_020939	GGAGA	2	10	27904	27913	40 %	0 %	60 %	0 %	478448638
508	NC_020939	GGATA	2	10	27930	27939	40 %	20 %	40 %	0 %	478448638
509	NC_020939	A	7	7	27954	27960	100 %	0 %	0 %	0 %	478448638
510	NC_020939	AAG	2	6	27971	27976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448638
511	NC_020939	T	6	6	27991	27996	0 %	100 %	0 %	0 %	478448638
512	NC_020939	A	8	8	28088	28095	100 %	0 %	0 %	0 %	478448639
513	NC_020939	TTC	2	6	28132	28137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448639
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517	NC_020939	TTC	2	6	28365	28370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448639
518	NC_020939	AAG	2	6	28397	28402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448639
519	NC_020939	A	6	6	28403	28408	100 %	0 %	0 %	0 %	478448639
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522	NC_020939	TTC	2	6	28768	28773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448640
523	NC_020939	TAG	2	6	28816	28821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448640
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525	NC_020939	GAT	3	9	28911	28919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448640
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530	NC_020939	AGGGT	2	10	29173	29182	20 %	20 %	60 %	0 %	478448640
531	NC_020939	TTC	2	6	29209	29214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448640
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534	NC_020939	TGA	2	6	29249	29254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448640
535	NC_020939	TTC	2	6	29282	29287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448640
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539	NC_020939	TA	3	6	29575	29580	50 %	50 %	0 %	0 %	478448640
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547	NC_020939	TTGT	2	8	30194	30201	0 %	75 %	25 %	0 %	478448641
548	NC_020939	CCTAT	2	10	30213	30222	20 %	40 %	0 %	40 %	478448641
549	NC_020939	T	6	6	30229	30234	0 %	100 %	0 %	0 %	478448641
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559	NC_020939	TCT	2	6	30780	30785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448642
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565	NC_020939	T	6	6	31004	31009	0 %	100 %	0 %	0 %	478448642
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