MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A/5291 complete genome

Total Repeats: 20432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020939	GTA	2	6	281955	281960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448870
5502	NC_020939	TCT	2	6	282016	282021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448871
5503	NC_020939	TGA	2	6	282045	282050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448871
5504	NC_020939	CT	3	6	282093	282098	0 %	50 %	0 %	50 %	478448871
5505	NC_020939	ATC	2	6	282099	282104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448871
5506	NC_020939	TTC	2	6	282105	282110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448871
5507	NC_020939	GAA	2	6	282136	282141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448871
5508	NC_020939	GA	3	6	282161	282166	50 %	0 %	50 %	0 %	478448871
5509	NC_020939	AAAG	2	8	282193	282200	75 %	0 %	25 %	0 %	478448871
5510	NC_020939	ATA	2	6	282291	282296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448871
5511	NC_020939	CAT	2	6	282359	282364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448871
5512	NC_020939	TAA	2	6	282366	282371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448871
5513	NC_020939	GTT	2	6	282439	282444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448871
5514	NC_020939	GAT	2	6	282472	282477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448871
5515	NC_020939	TTC	2	6	282536	282541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448871
5516	NC_020939	A	6	6	282547	282552	100 %	0 %	0 %	0 %	478448871
5517	NC_020939	TTA	2	6	282569	282574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448871
5518	NC_020939	TAAT	2	8	282614	282621	50 %	50 %	0 %	0 %	478448871
5519	NC_020939	TTC	2	6	282624	282629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448871
5520	NC_020939	AGA	2	6	282660	282665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448871
5521	NC_020939	GAA	2	6	282711	282716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448871
5522	NC_020939	CTT	2	6	282719	282724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448871
5523	NC_020939	TCC	2	6	282894	282899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478448871
5524	NC_020939	CAG	2	6	282902	282907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448871
5525	NC_020939	GAA	2	6	283007	283012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448871
5526	NC_020939	CACGCG	2	12	283161	283172	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	478448871
5527	NC_020939	ATT	3	9	283185	283193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448871
5528	NC_020939	TTTCTT	2	12	283340	283351	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	478448871
5529	NC_020939	TCT	2	6	283464	283469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448872
5530	NC_020939	TGC	2	6	283487	283492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448872
5531	NC_020939	TGTT	2	8	283515	283522	0 %	75 %	25 %	0 %	478448872
5532	NC_020939	TTG	2	6	283528	283533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448872
5533	NC_020939	AGA	2	6	283552	283557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448872
5534	NC_020939	AAC	2	6	283610	283615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448872
5535	NC_020939	CAT	2	6	283618	283623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448872
5536	NC_020939	CTT	2	6	283635	283640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448872
5537	NC_020939	GTT	2	6	283647	283652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448872
5538	NC_020939	CAG	2	6	283680	283685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448872
5539	NC_020939	CTG	2	6	283693	283698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448872
5540	NC_020939	GAA	2	6	283728	283733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448872
5541	NC_020939	TATC	2	8	283803	283810	25 %	50 %	0 %	25 %	478448872
5542	NC_020939	AGCT	2	8	283824	283831	25 %	25 %	25 %	25 %	478448872
5543	NC_020939	CTG	2	6	283990	283995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448872
5544	NC_020939	ACG	2	6	284029	284034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448872
5545	NC_020939	TAA	2	6	284092	284097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448872
5546	NC_020939	ATA	2	6	284099	284104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448872
5547	NC_020939	ATA	2	6	284154	284159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448872
5548	NC_020939	TGC	2	6	284161	284166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448872
5549	NC_020939	GGA	2	6	284390	284395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478448872
5550	NC_020939	AGA	2	6	284437	284442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448872
5551	NC_020939	GAG	2	6	284517	284522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478448872
5552	NC_020939	GTT	2	6	284527	284532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448872
5553	NC_020939	TTC	2	6	284594	284599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448872
5554	NC_020939	TCT	2	6	284678	284683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448872
5555	NC_020939	AGT	2	6	284692	284697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448872
5556	NC_020939	GCT	2	6	284724	284729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448872
5557	NC_020939	TTC	2	6	284745	284750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448872
5558	NC_020939	CCA	2	6	284756	284761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478448872
5559	NC_020939	CT	3	6	284768	284773	0 %	50 %	0 %	50 %	478448872
5560	NC_020939	TAT	2	6	284787	284792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448872
5561	NC_020939	ACA	2	6	284801	284806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448872
5562	NC_020939	CT	3	6	284880	284885	0 %	50 %	0 %	50 %	478448872
5563	NC_020939	ATA	2	6	284923	284928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448872
5564	NC_020939	AGTT	2	8	285006	285013	25 %	50 %	25 %	0 %	478448872
5565	NC_020939	CT	3	6	285019	285024	0 %	50 %	0 %	50 %	478448872
5566	NC_020939	TCT	2	6	285059	285064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448872
5567	NC_020939	GTA	2	6	285151	285156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448872
5568	NC_020939	AC	3	6	285230	285235	50 %	0 %	0 %	50 %	478448872
5569	NC_020939	TCT	2	6	285236	285241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448872
5570	NC_020939	ATG	2	6	285297	285302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448872
5571	NC_020939	CTA	2	6	285393	285398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448872
5572	NC_020939	CTT	2	6	285456	285461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448872
5573	NC_020939	CAG	2	6	285574	285579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448872
5574	NC_020939	CTC	2	6	285628	285633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478448872
5575	NC_020939	TAC	2	6	285652	285657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448872
5576	NC_020939	GCT	2	6	285702	285707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448872
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5578	NC_020939	ATA	2	6	285795	285800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448872
5579	NC_020939	CGTT	2	8	285802	285809	0 %	50 %	25 %	25 %	478448872
5580	NC_020939	ATTC	2	8	285811	285818	25 %	50 %	0 %	25 %	478448872
5581	NC_020939	CAT	2	6	286130	286135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448873
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5583	NC_020939	ATC	2	6	286178	286183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448873
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5586	NC_020939	CTG	2	6	286299	286304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448873
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5588	NC_020939	CAC	2	6	286615	286620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478448873
5589	NC_020939	CCT	2	6	286649	286654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478448873
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5591	NC_020939	AAGC	2	8	286719	286726	50 %	0 %	25 %	25 %	478448873
5592	NC_020939	ATG	2	6	286736	286741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448873
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5595	NC_020939	A	6	6	286841	286846	100 %	0 %	0 %	0 %	478448873
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5599	NC_020939	CTT	2	6	287223	287228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448874
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5602	NC_020939	GTC	2	6	287333	287338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448874
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5604	NC_020939	ACT	2	6	287380	287385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448874
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5608	NC_020939	CTCCTA	2	12	287502	287513	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478448874
5609	NC_020939	AAC	2	6	287587	287592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448874
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5611	NC_020939	ATC	2	6	287727	287732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448874
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5613	NC_020939	TTCGA	2	10	287756	287765	20 %	40 %	20 %	20 %	478448874
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5619	NC_020939	TTG	2	6	287880	287885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448875
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5992	NC_020939	GAT	2	6	306674	306679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448893
5993	NC_020939	GTT	2	6	306711	306716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448893
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5995	NC_020939	CAT	2	6	306755	306760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448893
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5999	NC_020939	A	6	6	306916	306921	100 %	0 %	0 %	0 %	478448893
6000	NC_020939	ACC	2	6	306933	306938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478448893

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