MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L1/440/LN complete genome

Total Repeats: 2509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020937	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478447724
2	NC_020937	GGGA	2	8	394	401	25 %	0 %	75 %	0 %	478447724
3	NC_020937	AGTG	2	8	544	551	25 %	25 %	50 %	0 %	478447724
4	NC_020937	TGGC	2	8	578	585	0 %	25 %	50 %	25 %	478447724
5	NC_020937	AATG	2	8	1063	1070	50 %	25 %	25 %	0 %	478447724
6	NC_020937	CTAT	2	8	1397	1404	25 %	50 %	0 %	25 %	478447724
7	NC_020937	AGTA	2	8	2086	2093	50 %	25 %	25 %	0 %	478447725
8	NC_020937	ATGA	2	8	2490	2497	50 %	25 %	25 %	0 %	478447726
9	NC_020937	GATA	2	8	2528	2535	50 %	25 %	25 %	0 %	478447726
10	NC_020937	CATG	2	8	3706	3713	25 %	25 %	25 %	25 %	478447727
11	NC_020937	TTCC	2	8	4011	4018	0 %	50 %	0 %	50 %	478447727
12	NC_020937	TTTA	2	8	4409	4416	25 %	75 %	0 %	0 %	478447728
13	NC_020937	ATCC	2	8	4709	4716	25 %	25 %	0 %	50 %	478447728
14	NC_020937	GACG	2	8	5456	5463	25 %	0 %	50 %	25 %	478447728
15	NC_020937	TTGG	2	8	5559	5566	0 %	50 %	50 %	0 %	478447728
16	NC_020937	TGGA	2	8	5920	5927	25 %	25 %	50 %	0 %	478447729
17	NC_020937	CTTT	2	8	6297	6304	0 %	75 %	0 %	25 %	478447729
18	NC_020937	GGGA	2	8	6812	6819	25 %	0 %	75 %	0 %	478447729
19	NC_020937	GGTG	2	8	7115	7122	0 %	25 %	75 %	0 %	478447730
20	NC_020937	AAAT	2	8	7181	7188	75 %	25 %	0 %	0 %	478447730
21	NC_020937	AAGC	2	8	8419	8426	50 %	0 %	25 %	25 %	478447731
22	NC_020937	ATTG	2	8	8817	8824	25 %	50 %	25 %	0 %	478447732
23	NC_020937	AGCG	2	8	9284	9291	25 %	0 %	50 %	25 %	478447732
24	NC_020937	AAAG	2	8	9305	9312	75 %	0 %	25 %	0 %	478447732
25	NC_020937	CTTT	2	8	9645	9652	0 %	75 %	0 %	25 %	478447732
26	NC_020937	TTCG	2	8	10019	10026	0 %	50 %	25 %	25 %	478447733
27	NC_020937	AATT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	478447733
28	NC_020937	ATGG	2	8	10183	10190	25 %	25 %	50 %	0 %	478447733
29	NC_020937	CTTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	478447734
30	NC_020937	GCAA	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	478447734
31	NC_020937	AGCC	2	8	11255	11262	25 %	0 %	25 %	50 %	478447734
32	NC_020937	GAAA	2	8	11398	11405	75 %	0 %	25 %	0 %	478447734
33	NC_020937	AATG	2	8	12141	12148	50 %	25 %	25 %	0 %	478447735
34	NC_020937	GTTT	2	8	13173	13180	0 %	75 %	25 %	0 %	478447736
35	NC_020937	ATGC	2	8	13603	13610	25 %	25 %	25 %	25 %	478447736
36	NC_020937	TTGT	2	8	14639	14646	0 %	75 %	25 %	0 %	478447737
37	NC_020937	TTCT	2	8	14810	14817	0 %	75 %	0 %	25 %	478447737
38	NC_020937	ATTT	2	8	15016	15023	25 %	75 %	0 %	0 %	478447737
39	NC_020937	TTTC	2	8	15678	15685	0 %	75 %	0 %	25 %	478447738
40	NC_020937	AAAT	2	8	16160	16167	75 %	25 %	0 %	0 %	478447738
41	NC_020937	CTAT	2	8	16859	16866	25 %	50 %	0 %	25 %	478447739
42	NC_020937	GTAA	2	8	17002	17009	50 %	25 %	25 %	0 %	478447739
43	NC_020937	CTAA	2	8	17195	17202	50 %	25 %	0 %	25 %	478447739
44	NC_020937	AGAA	2	8	17458	17465	75 %	0 %	25 %	0 %	478447739
45	NC_020937	ATTT	2	8	17604	17611	25 %	75 %	0 %	0 %	478447739
46	NC_020937	TGCG	2	8	19126	19133	0 %	25 %	50 %	25 %	478447741
47	NC_020937	GAAG	2	8	20110	20117	50 %	0 %	50 %	0 %	478447741
48	NC_020937	GATG	2	8	22244	22251	25 %	25 %	50 %	0 %	478447743
49	NC_020937	CATT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	0 %	25 %	478447743
50	NC_020937	GGAG	2	8	23354	23361	25 %	0 %	75 %	0 %	478447743
51	NC_020937	GCTT	2	8	23646	23653	0 %	50 %	25 %	25 %	478447743
52	NC_020937	GGTT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	50 %	0 %	478447743
53	NC_020937	TTCT	2	8	24064	24071	0 %	75 %	0 %	25 %	478447743
54	NC_020937	TAAC	2	8	24166	24173	50 %	25 %	0 %	25 %	478447743
55	NC_020937	CATT	2	8	24289	24296	25 %	50 %	0 %	25 %	478447743
56	NC_020937	GGTA	2	8	24659	24666	25 %	25 %	50 %	0 %	478447743
57	NC_020937	TTGA	2	8	25653	25660	25 %	50 %	25 %	0 %	478447744
58	NC_020937	TAGG	2	8	25877	25884	25 %	25 %	50 %	0 %	478447744
59	NC_020937	TTCC	2	8	26001	26008	0 %	50 %	0 %	50 %	478447744
60	NC_020937	TAGG	2	8	26115	26122	25 %	25 %	50 %	0 %	478447744
61	NC_020937	GCTT	2	8	26887	26894	0 %	50 %	25 %	25 %	478447744
62	NC_020937	GGAA	2	8	27470	27477	50 %	0 %	50 %	0 %	478447745
63	NC_020937	TTAA	2	8	27543	27550	50 %	50 %	0 %	0 %	478447745
64	NC_020937	AAAG	2	8	27593	27600	75 %	0 %	25 %	0 %	478447745
65	NC_020937	GTTT	2	8	28156	28163	0 %	75 %	25 %	0 %	478447746
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68	NC_020937	TTTG	2	8	30165	30172	0 %	75 %	25 %	0 %	478447748
69	NC_020937	TTGT	2	8	30200	30207	0 %	75 %	25 %	0 %	478447748
70	NC_020937	TGGC	2	8	30363	30370	0 %	25 %	50 %	25 %	478447748
71	NC_020937	AAAG	2	8	30923	30930	75 %	0 %	25 %	0 %	478447749
72	NC_020937	AAAC	2	8	30993	31000	75 %	0 %	0 %	25 %	478447749
73	NC_020937	GATG	2	8	31136	31143	25 %	25 %	50 %	0 %	478447749
74	NC_020937	GATA	2	8	32245	32252	50 %	25 %	25 %	0 %	478447751
75	NC_020937	TGAT	2	8	34740	34747	25 %	50 %	25 %	0 %	478447754
76	NC_020937	AAGA	3	12	34868	34879	75 %	0 %	25 %	0 %	478447754
77	NC_020937	AAGC	2	8	35088	35095	50 %	0 %	25 %	25 %	478447755
78	NC_020937	GTTC	2	8	35121	35128	0 %	50 %	25 %	25 %	478447755
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80	NC_020937	TGCT	2	8	35910	35917	0 %	50 %	25 %	25 %	478447756
81	NC_020937	TTGG	2	8	36142	36149	0 %	50 %	50 %	0 %	478447756
82	NC_020937	AGAT	2	8	36862	36869	50 %	25 %	25 %	0 %	478447756
83	NC_020937	CTTT	2	8	37234	37241	0 %	75 %	0 %	25 %	478447757
84	NC_020937	ATGA	2	8	37724	37731	50 %	25 %	25 %	0 %	478447757
85	NC_020937	TAGG	2	8	37883	37890	25 %	25 %	50 %	0 %	478447757
86	NC_020937	CAAT	2	8	38067	38074	50 %	25 %	0 %	25 %	478447757
87	NC_020937	AATG	2	8	38854	38861	50 %	25 %	25 %	0 %	478447757
88	NC_020937	AGAA	2	8	39691	39698	75 %	0 %	25 %	0 %	478447758
89	NC_020937	AAGA	2	8	39743	39750	75 %	0 %	25 %	0 %	478447758
90	NC_020937	ATCC	2	8	39751	39758	25 %	25 %	0 %	50 %	478447758
91	NC_020937	TAAT	2	8	39962	39969	50 %	50 %	0 %	0 %	478447758
92	NC_020937	GTGC	2	8	42050	42057	0 %	25 %	50 %	25 %	478447760
93	NC_020937	AGAA	2	8	42469	42476	75 %	0 %	25 %	0 %	478447760
94	NC_020937	GGAT	2	8	42621	42628	25 %	25 %	50 %	0 %	478447760
95	NC_020937	AAAC	2	8	43760	43767	75 %	0 %	0 %	25 %	478447762
96	NC_020937	CAAT	2	8	43964	43971	50 %	25 %	0 %	25 %	478447762
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100	NC_020937	TTGA	2	8	45770	45777	25 %	50 %	25 %	0 %	478447764
101	NC_020937	TGTT	2	8	45942	45949	0 %	75 %	25 %	0 %	478447764
102	NC_020937	CTAT	2	8	45972	45979	25 %	50 %	0 %	25 %	478447764
103	NC_020937	TGTT	2	8	46001	46008	0 %	75 %	25 %	0 %	478447764
104	NC_020937	CTAT	2	8	46297	46304	25 %	50 %	0 %	25 %	478447764
105	NC_020937	AAGA	2	8	46792	46799	75 %	0 %	25 %	0 %	478447765
106	NC_020937	AAGA	2	8	46849	46856	75 %	0 %	25 %	0 %	478447765
107	NC_020937	AAAG	2	8	46889	46896	75 %	0 %	25 %	0 %	478447765
108	NC_020937	AAGA	2	8	47004	47011	75 %	0 %	25 %	0 %	478447765
109	NC_020937	ACTT	2	8	47265	47272	25 %	50 %	0 %	25 %	478447765
110	NC_020937	ATGG	2	8	47891	47898	25 %	25 %	50 %	0 %	478447765
111	NC_020937	AGGA	2	8	47922	47929	50 %	0 %	50 %	0 %	478447765
112	NC_020937	GAAC	2	8	48469	48476	50 %	0 %	25 %	25 %	478447765
113	NC_020937	AACA	2	8	48714	48721	75 %	0 %	0 %	25 %	478447766
114	NC_020937	CTTT	2	8	48910	48917	0 %	75 %	0 %	25 %	478447766
115	NC_020937	CTTT	2	8	49795	49802	0 %	75 %	0 %	25 %	478447767
116	NC_020937	GTAG	2	8	49813	49820	25 %	25 %	50 %	0 %	478447767
117	NC_020937	GAAG	2	8	51243	51250	50 %	0 %	50 %	0 %	478447768
118	NC_020937	TTCA	2	8	51665	51672	25 %	50 %	0 %	25 %	478447768
119	NC_020937	TCTA	2	8	51882	51889	25 %	50 %	0 %	25 %	478447768
120	NC_020937	GGAA	2	8	52999	53006	50 %	0 %	50 %	0 %	478447770
121	NC_020937	TTAA	2	8	53740	53747	50 %	50 %	0 %	0 %	478447770
122	NC_020937	CCTT	2	8	53947	53954	0 %	50 %	0 %	50 %	478447771
123	NC_020937	TTTA	2	8	54114	54121	25 %	75 %	0 %	0 %	478447771
124	NC_020937	AAAG	2	8	54338	54345	75 %	0 %	25 %	0 %	478447771
125	NC_020937	GATT	2	8	54475	54482	25 %	50 %	25 %	0 %	478447771
126	NC_020937	AATC	2	8	54530	54537	50 %	25 %	0 %	25 %	478447771
127	NC_020937	TATT	2	8	54591	54598	25 %	75 %	0 %	0 %	478447771
128	NC_020937	TCGA	2	8	54979	54986	25 %	25 %	25 %	25 %	478447772
129	NC_020937	CTTC	2	8	55073	55080	0 %	50 %	0 %	50 %	478447772
130	NC_020937	GAAT	2	8	55108	55115	50 %	25 %	25 %	0 %	478447772
131	NC_020937	TTGA	2	8	55178	55185	25 %	50 %	25 %	0 %	478447772
132	NC_020937	GGAA	2	8	55534	55541	50 %	0 %	50 %	0 %	478447772
133	NC_020937	AGAA	2	8	55880	55887	75 %	0 %	25 %	0 %	478447772
134	NC_020937	CTGG	3	12	56445	56456	0 %	25 %	50 %	25 %	478447773
135	NC_020937	TTGC	2	8	56579	56586	0 %	50 %	25 %	25 %	478447773
136	NC_020937	AGCG	2	8	56619	56626	25 %	0 %	50 %	25 %	478447773
137	NC_020937	AGCT	2	8	57078	57085	25 %	25 %	25 %	25 %	478447773
138	NC_020937	GGTT	2	8	57772	57779	0 %	50 %	50 %	0 %	478447773
139	NC_020937	GAAA	2	8	58701	58708	75 %	0 %	25 %	0 %	478447774
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