MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams5 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2239	NC_020936	TCT	2	6	116296	116301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450521
2240	NC_020936	AAGC	2	8	116305	116312	50 %	0 %	25 %	25 %	478450521
2241	NC_020936	TATCG	2	10	116313	116322	20 %	40 %	20 %	20 %	478450521
2242	NC_020936	T	6	6	116329	116334	0 %	100 %	0 %	0 %	478450521
2243	NC_020936	GGTT	2	8	116637	116644	0 %	50 %	50 %	0 %	478450522
2244	NC_020936	T	7	7	116653	116659	0 %	100 %	0 %	0 %	478450522
2245	NC_020936	GCT	2	6	116779	116784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450522
2246	NC_020936	TTTCT	2	10	116829	116838	0 %	80 %	0 %	20 %	478450522
2247	NC_020936	ACA	2	6	116866	116871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450522
2248	NC_020936	GGAGA	2	10	117025	117034	40 %	0 %	60 %	0 %	478450522
2249	NC_020936	TAT	2	6	117054	117059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450522
2250	NC_020936	TATC	2	8	117086	117093	25 %	50 %	0 %	25 %	478450522
2251	NC_020936	TTTG	2	8	117183	117190	0 %	75 %	25 %	0 %	478450522
2252	NC_020936	AGG	3	9	117195	117203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450522
2253	NC_020936	AGA	2	6	117216	117221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450522
2254	NC_020936	GA	3	6	117270	117275	50 %	0 %	50 %	0 %	478450522
2255	NC_020936	A	6	6	117323	117328	100 %	0 %	0 %	0 %	478450522
2256	NC_020936	GTTC	2	8	117379	117386	0 %	50 %	25 %	25 %	478450522
2257	NC_020936	TAA	2	6	117399	117404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450522
2258	NC_020936	ACC	2	6	117415	117420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478450522
2259	NC_020936	GCT	2	6	117433	117438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450522
2260	NC_020936	AGG	2	6	117483	117488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450522
2261	NC_020936	ATT	2	6	117517	117522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450522
2262	NC_020936	TTC	2	6	117534	117539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450522
2263	NC_020936	TGC	2	6	117564	117569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450522
2264	NC_020936	CTG	2	6	117611	117616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450522
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2267	NC_020936	AAG	2	6	117835	117840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450523
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2269	NC_020936	GTT	2	6	117930	117935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450523
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2271	NC_020936	TCC	2	6	117973	117978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450523
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2278	NC_020936	AAG	2	6	118219	118224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450524
2279	NC_020936	TAA	2	6	118232	118237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450524
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2282	NC_020936	T	6	6	118658	118663	0 %	100 %	0 %	0 %	478450525
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2287	NC_020936	GTT	2	6	118935	118940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450525
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2299	NC_020936	CTG	2	6	119560	119565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450526
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2319	NC_020936	GCTA	2	8	120224	120231	25 %	25 %	25 %	25 %	478450527
2320	NC_020936	CGGC	2	8	120273	120280	0 %	0 %	50 %	50 %	478450527
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2348	NC_020936	CCAAT	2	10	122039	122048	40 %	20 %	0 %	40 %	478450528
2349	NC_020936	ATG	2	6	122144	122149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450528
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2351	NC_020936	CTT	2	6	122186	122191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450528
2352	NC_020936	AGA	2	6	122283	122288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450528
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2354	NC_020936	TTTC	2	8	122381	122388	0 %	75 %	0 %	25 %	478450528
2355	NC_020936	AAC	2	6	122432	122437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450528
2356	NC_020936	TGA	2	6	122480	122485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450528
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2359	NC_020936	AAG	2	6	122657	122662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450528
2360	NC_020936	AGA	2	6	122724	122729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450528
2361	NC_020936	TGA	2	6	122736	122741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450528
2362	NC_020936	CTT	2	6	122779	122784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450528
2363	NC_020936	TC	3	6	122802	122807	0 %	50 %	0 %	50 %	478450528
2364	NC_020936	ATC	2	6	122985	122990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450528
2365	NC_020936	AACA	2	8	123009	123016	75 %	0 %	0 %	25 %	478450528
2366	NC_020936	AAAG	2	8	123112	123119	75 %	0 %	25 %	0 %	478450528
2367	NC_020936	GA	3	6	123132	123137	50 %	0 %	50 %	0 %	478450528
2368	NC_020936	GCTTC	2	10	123140	123149	0 %	40 %	20 %	40 %	478450528
2369	NC_020936	CTC	2	6	123177	123182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450528
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2490	NC_020936	ATC	2	6	128916	128921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450534
2491	NC_020936	T	6	6	128922	128927	0 %	100 %	0 %	0 %	478450534
2492	NC_020936	GAA	2	6	128984	128989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450534
2493	NC_020936	CTT	3	9	129014	129022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450534
2494	NC_020936	GAA	2	6	129182	129187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450535
2495	NC_020936	T	6	6	129206	129211	0 %	100 %	0 %	0 %	478450535
2496	NC_020936	AGCT	2	8	129266	129273	25 %	25 %	25 %	25 %	478450536
2497	NC_020936	TTC	2	6	129276	129281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450536
2498	NC_020936	TGA	2	6	129324	129329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450536
2499	NC_020936	ATCCA	2	10	129336	129345	40 %	20 %	0 %	40 %	478450536
2500	NC_020936	T	6	6	129348	129353	0 %	100 %	0 %	0 %	478450536

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