MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams5 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020936	CATG	2	8	78856	78863	25 %	25 %	25 %	25 %	478450490
1503	NC_020936	ATT	2	6	79333	79338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450491
1504	NC_020936	AATT	2	8	79351	79358	50 %	50 %	0 %	0 %	478450491
1505	NC_020936	T	6	6	79381	79386	0 %	100 %	0 %	0 %	478450491
1506	NC_020936	GAG	2	6	79500	79505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450491
1507	NC_020936	TTC	2	6	79592	79597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450491
1508	NC_020936	T	8	8	79599	79606	0 %	100 %	0 %	0 %	478450491
1509	NC_020936	GCC	2	6	79627	79632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478450491
1510	NC_020936	TCC	2	6	79675	79680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450491
1511	NC_020936	GCT	2	6	79707	79712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450491
1512	NC_020936	TCT	2	6	79718	79723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450491
1513	NC_020936	T	7	7	80415	80421	0 %	100 %	0 %	0 %	478450492
1514	NC_020936	TGA	2	6	80520	80525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450492
1515	NC_020936	TGTCT	2	10	80535	80544	0 %	60 %	20 %	20 %	478450492
1516	NC_020936	TGAT	2	8	80609	80616	25 %	50 %	25 %	0 %	478450492
1517	NC_020936	TCAT	2	8	80631	80638	25 %	50 %	0 %	25 %	478450492
1518	NC_020936	T	6	6	80687	80692	0 %	100 %	0 %	0 %	478450492
1519	NC_020936	GGTTTA	2	12	80698	80709	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478450492
1520	NC_020936	TCT	2	6	80799	80804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450492
1521	NC_020936	GAA	2	6	80809	80814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450492
1522	NC_020936	TGC	2	6	80859	80864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450492
1523	NC_020936	CAA	2	6	80893	80898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450492
1524	NC_020936	GAA	2	6	80911	80916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450492
1525	NC_020936	GGA	2	6	80955	80960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450492
1526	NC_020936	TC	4	8	80983	80990	0 %	50 %	0 %	50 %	478450492
1527	NC_020936	A	7	7	81002	81008	100 %	0 %	0 %	0 %	478450492
1528	NC_020936	TTACT	2	10	81042	81051	20 %	60 %	0 %	20 %	478450492
1529	NC_020936	TATC	2	8	81058	81065	25 %	50 %	0 %	25 %	478450492
1530	NC_020936	GA	3	6	81076	81081	50 %	0 %	50 %	0 %	478450492
1531	NC_020936	TAT	2	6	81156	81161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450492
1532	NC_020936	TA	3	6	81296	81301	50 %	50 %	0 %	0 %	478450492
1533	NC_020936	AGA	2	6	81360	81365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450492
1534	NC_020936	GGGA	2	8	81369	81376	25 %	0 %	75 %	0 %	478450492
1535	NC_020936	CTGC	2	8	81473	81480	0 %	25 %	25 %	50 %	478450493
1536	NC_020936	GCT	2	6	81491	81496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450493
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1539	NC_020936	CTT	2	6	81561	81566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450493
1540	NC_020936	CAT	2	6	81608	81613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450493
1541	NC_020936	TGA	2	6	81730	81735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450493
1542	NC_020936	AGG	2	6	81741	81746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450493
1543	NC_020936	GGTT	2	8	81766	81773	0 %	50 %	50 %	0 %	478450493
1544	NC_020936	CT	3	6	81806	81811	0 %	50 %	0 %	50 %	478450493
1545	NC_020936	GGA	2	6	81812	81817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450493
1546	NC_020936	CAA	2	6	81818	81823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450493
1547	NC_020936	AG	3	6	81825	81830	50 %	0 %	50 %	0 %	478450493
1548	NC_020936	T	6	6	81832	81837	0 %	100 %	0 %	0 %	478450493
1549	NC_020936	CGAT	2	8	81894	81901	25 %	25 %	25 %	25 %	478450493
1550	NC_020936	TCAT	2	8	81969	81976	25 %	50 %	0 %	25 %	478450493
1551	NC_020936	TTA	2	6	82019	82024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450493
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1556	NC_020936	T	6	6	82204	82209	0 %	100 %	0 %	0 %	478450494
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1559	NC_020936	TTA	2	6	82277	82282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450494
1560	NC_020936	CTT	2	6	82331	82336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450494
1561	NC_020936	TTA	2	6	82374	82379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450494
1562	NC_020936	T	6	6	82382	82387	0 %	100 %	0 %	0 %	478450494
1563	NC_020936	AGAAA	2	10	82432	82441	80 %	0 %	20 %	0 %	478450494
1564	NC_020936	T	6	6	82487	82492	0 %	100 %	0 %	0 %	478450494
1565	NC_020936	GTTA	2	8	82511	82518	25 %	50 %	25 %	0 %	478450494
1566	NC_020936	TGC	2	6	82529	82534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450494
1567	NC_020936	ACA	2	6	82545	82550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450494
1568	NC_020936	GCG	2	6	82577	82582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478450494
1569	NC_020936	T	6	6	82620	82625	0 %	100 %	0 %	0 %	478450494
1570	NC_020936	TGG	3	9	82646	82654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478450494
1571	NC_020936	CAG	2	6	82722	82727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450494
1572	NC_020936	GTT	2	6	82733	82738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450494
1573	NC_020936	TATT	2	8	82743	82750	25 %	75 %	0 %	0 %	478450494
1574	NC_020936	GTG	2	6	82767	82772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478450494
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1583	NC_020936	GTTC	2	8	83168	83175	0 %	50 %	25 %	25 %	478450494
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1593	NC_020936	T	6	6	83578	83583	0 %	100 %	0 %	0 %	478450495
1594	NC_020936	GTA	2	6	83664	83669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450495
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1599	NC_020936	TCAT	2	8	83770	83777	25 %	50 %	0 %	25 %	478450495
1600	NC_020936	CAA	2	6	83812	83817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450495
1601	NC_020936	CATT	2	8	83837	83844	25 %	50 %	0 %	25 %	478450495
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1603	NC_020936	AGCA	2	8	83876	83883	50 %	0 %	25 %	25 %	478450495
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1607	NC_020936	TTTG	2	8	84069	84076	0 %	75 %	25 %	0 %	478450495
1608	NC_020936	TTG	2	6	84166	84171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450495
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1611	NC_020936	CTA	2	6	84381	84386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450495
1612	NC_020936	TAT	2	6	84434	84439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450495
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1615	NC_020936	TAT	2	6	84574	84579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450496
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1619	NC_020936	AG	3	6	84632	84637	50 %	0 %	50 %	0 %	478450496
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1623	NC_020936	AG	3	6	84899	84904	50 %	0 %	50 %	0 %	478450496
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1626	NC_020936	A	6	6	84986	84991	100 %	0 %	0 %	0 %	478450496
1627	NC_020936	AGA	2	6	85036	85041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450496
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