MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams5 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1003	NC_020936	TTC	2	6	54715	54720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450474
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1005	NC_020936	CAA	2	6	54878	54883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450474
1006	NC_020936	GAA	2	6	54905	54910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450474
1007	NC_020936	CT	3	6	54929	54934	0 %	50 %	0 %	50 %	478450474
1008	NC_020936	TCGA	2	8	54964	54971	25 %	25 %	25 %	25 %	478450474
1009	NC_020936	CTTC	2	8	55058	55065	0 %	50 %	0 %	50 %	478450474
1010	NC_020936	GAAT	2	8	55093	55100	50 %	25 %	25 %	0 %	478450474
1011	NC_020936	TGT	2	6	55129	55134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450474
1012	NC_020936	GAT	2	6	55157	55162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450474
1013	NC_020936	TTGA	2	8	55163	55170	25 %	50 %	25 %	0 %	478450474
1014	NC_020936	AGC	2	6	55212	55217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450474
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1018	NC_020936	CAA	2	6	55371	55376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450474
1019	NC_020936	G	6	6	55408	55413	0 %	0 %	100 %	0 %	478450474
1020	NC_020936	AAT	2	6	55505	55510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450474
1021	NC_020936	GGAA	2	8	55519	55526	50 %	0 %	50 %	0 %	478450474
1022	NC_020936	TGG	2	6	55668	55673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478450474
1023	NC_020936	GGTTCA	2	12	55691	55702	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478450474
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1025	NC_020936	AGAA	2	8	55865	55872	75 %	0 %	25 %	0 %	478450474
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1042	NC_020936	T	6	6	56616	56621	0 %	100 %	0 %	0 %	478450475
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1046	NC_020936	GTTGT	2	10	56857	56866	0 %	60 %	40 %	0 %	478450475
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1052	NC_020936	CT	3	6	57069	57074	0 %	50 %	0 %	50 %	478450475
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1055	NC_020936	GT	3	6	57119	57124	0 %	50 %	50 %	0 %	478450475
1056	NC_020936	TGT	2	6	57128	57133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450475
1057	NC_020936	AGT	2	6	57138	57143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450475
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1059	NC_020936	T	6	6	57223	57228	0 %	100 %	0 %	0 %	478450475
1060	NC_020936	TTTG	2	8	57297	57304	0 %	75 %	25 %	0 %	478450475
1061	NC_020936	AGA	2	6	57379	57384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450475
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1101	NC_020936	GCT	2	6	59115	59120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450476
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1107	NC_020936	CTT	2	6	59245	59250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450476
1108	NC_020936	TTC	2	6	59276	59281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450476
1109	NC_020936	TGG	2	6	59302	59307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478450476
1110	NC_020936	TAGA	2	8	59404	59411	50 %	25 %	25 %	0 %	478450476
1111	NC_020936	TTA	2	6	59490	59495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450476
1112	NC_020936	TGAA	2	8	59509	59516	50 %	25 %	25 %	0 %	478450476
1113	NC_020936	TGT	2	6	59523	59528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450476
1114	NC_020936	T	8	8	59586	59593	0 %	100 %	0 %	0 %	478450476
1115	NC_020936	T	6	6	59606	59611	0 %	100 %	0 %	0 %	478450476
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1117	NC_020936	AGA	2	6	59691	59696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450477
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1119	NC_020936	T	6	6	59739	59744	0 %	100 %	0 %	0 %	478450477
1120	NC_020936	CGTT	2	8	59890	59897	0 %	50 %	25 %	25 %	478450477
1121	NC_020936	GGAG	2	8	59899	59906	25 %	0 %	75 %	0 %	478450477
1122	NC_020936	GTAA	2	8	59951	59958	50 %	25 %	25 %	0 %	478450477
1123	NC_020936	TCCTAA	2	12	60018	60029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450477
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1125	NC_020936	T	6	6	60079	60084	0 %	100 %	0 %	0 %	478450477
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