MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams5 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_020936	T	6	6	27875	27880	0 %	100 %	0 %	0 %	478450447
503	NC_020936	TGA	2	6	27888	27893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450447
504	NC_020936	GGAGA	2	10	27896	27905	40 %	0 %	60 %	0 %	478450447
505	NC_020936	GGATA	2	10	27922	27931	40 %	20 %	40 %	0 %	478450447
506	NC_020936	A	7	7	27946	27952	100 %	0 %	0 %	0 %	478450447
507	NC_020936	AAG	2	6	27963	27968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450447
508	NC_020936	T	6	6	27983	27988	0 %	100 %	0 %	0 %	478450447
509	NC_020936	A	8	8	28080	28087	100 %	0 %	0 %	0 %	478450448
510	NC_020936	TTC	2	6	28124	28129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450448
511	NC_020936	GTTT	2	8	28142	28149	0 %	75 %	25 %	0 %	478450448
512	NC_020936	CAGA	2	8	28164	28171	50 %	0 %	25 %	25 %	478450448
513	NC_020936	TTC	2	6	28242	28247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450448
514	NC_020936	AAG	2	6	28257	28262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450448
515	NC_020936	TTC	2	6	28357	28362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450448
516	NC_020936	AAG	2	6	28371	28376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450448
517	NC_020936	AAG	2	6	28389	28394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450448
518	NC_020936	A	6	6	28395	28400	100 %	0 %	0 %	0 %	478450448
519	NC_020936	GAA	2	6	28627	28632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450449
520	NC_020936	ATCCG	2	10	28647	28656	20 %	20 %	20 %	40 %	478450449
521	NC_020936	TTC	2	6	28760	28765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450449
522	NC_020936	TAG	2	6	28808	28813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450449
523	NC_020936	AGA	2	6	28821	28826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450449
524	NC_020936	GAT	3	9	28903	28911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450449
525	NC_020936	GAG	2	6	28946	28951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450449
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529	NC_020936	AGGGT	2	10	29165	29174	20 %	20 %	60 %	0 %	478450449
530	NC_020936	TTC	2	6	29201	29206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450449
531	NC_020936	CAG	2	6	29213	29218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450449
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533	NC_020936	TGA	2	6	29241	29246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450449
534	NC_020936	TTC	2	6	29274	29279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450449
535	NC_020936	GC	4	8	29445	29452	0 %	0 %	50 %	50 %	478450449
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537	NC_020936	TA	3	6	29567	29572	50 %	50 %	0 %	0 %	478450449
538	NC_020936	GAA	2	6	29656	29661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450449
539	NC_020936	TGT	2	6	29688	29693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450450
540	NC_020936	TCT	2	6	29756	29761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450450
541	NC_020936	ACA	2	6	29984	29989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450450
542	NC_020936	ATG	2	6	29994	29999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450450
543	NC_020936	CTTT	2	8	30136	30143	0 %	75 %	0 %	25 %	478450450
544	NC_020936	TTTG	2	8	30151	30158	0 %	75 %	25 %	0 %	478450450
545	NC_020936	TTGT	2	8	30186	30193	0 %	75 %	25 %	0 %	478450450
546	NC_020936	CCTAT	2	10	30205	30214	20 %	40 %	0 %	40 %	478450450
547	NC_020936	T	6	6	30221	30226	0 %	100 %	0 %	0 %	478450450
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550	NC_020936	T	8	8	30455	30462	0 %	100 %	0 %	0 %	478450450
551	NC_020936	ATG	2	6	30480	30485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450450
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555	NC_020936	GTT	2	6	30697	30702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450451
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557	NC_020936	TC	3	6	30725	30730	0 %	50 %	0 %	50 %	478450451
558	NC_020936	TCT	2	6	30772	30777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450451
559	NC_020936	CTG	2	6	30794	30799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450451
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563	NC_020936	CCT	2	6	30926	30931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450451
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565	NC_020936	T	6	6	30996	31001	0 %	100 %	0 %	0 %	478450451
566	NC_020936	GAAGG	2	10	31004	31013	40 %	0 %	60 %	0 %	478450451
567	NC_020936	GGC	2	6	31032	31037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478450451
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570	NC_020936	TAG	2	6	31133	31138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450451
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592	NC_020936	A	6	6	32149	32154	100 %	0 %	0 %	0 %	478450452
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