MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams5 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_020936	AT	3	6	232439	232444	50 %	50 %	0 %	0 %	478450628
4503	NC_020936	A	6	6	232467	232472	100 %	0 %	0 %	0 %	478450628
4504	NC_020936	A	7	7	232489	232495	100 %	0 %	0 %	0 %	478450628
4505	NC_020936	CAT	2	6	232512	232517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450628
4506	NC_020936	ACA	2	6	232549	232554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450629
4507	NC_020936	TTCAC	2	10	232591	232600	20 %	40 %	0 %	40 %	478450629
4508	NC_020936	CTT	3	9	232646	232654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450629
4509	NC_020936	ATA	2	6	232669	232674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450629
4510	NC_020936	CTGT	2	8	232721	232728	0 %	50 %	25 %	25 %	478450629
4511	NC_020936	TCT	2	6	232729	232734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450629
4512	NC_020936	AAC	2	6	232792	232797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450629
4513	NC_020936	GAG	2	6	232820	232825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450629
4514	NC_020936	AGA	2	6	233025	233030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450629
4515	NC_020936	TCT	2	6	233260	233265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450629
4516	NC_020936	AT	5	10	233280	233289	50 %	50 %	0 %	0 %	478450629
4517	NC_020936	TTGA	2	8	233331	233338	25 %	50 %	25 %	0 %	478450629
4518	NC_020936	CTT	2	6	233343	233348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450629
4519	NC_020936	AAGT	2	8	233412	233419	50 %	25 %	25 %	0 %	478450629
4520	NC_020936	TTCCTT	2	12	233475	233486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450629
4521	NC_020936	GAC	2	6	233714	233719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450629
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4523	NC_020936	TGC	2	6	233811	233816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450629
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4527	NC_020936	ATCC	2	8	233876	233883	25 %	25 %	0 %	50 %	478450629
4528	NC_020936	CTT	2	6	233921	233926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450629
4529	NC_020936	GTGA	2	8	234066	234073	25 %	25 %	50 %	0 %	478450629
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4540	NC_020936	GT	3	6	234720	234725	0 %	50 %	50 %	0 %	478450629
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4554	NC_020936	CAG	2	6	235861	235866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450630
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4559	NC_020936	TCTCCT	2	12	236356	236367	0 %	50 %	0 %	50 %	478450630
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4609	NC_020936	CAAT	2	8	238677	238684	50 %	25 %	0 %	25 %	478450634
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4612	NC_020936	ACAA	2	8	238830	238837	75 %	0 %	0 %	25 %	478450634
4613	NC_020936	CTT	2	6	238842	238847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450634
4614	NC_020936	TCT	2	6	238874	238879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450634
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4619	NC_020936	AGCT	2	8	239113	239120	25 %	25 %	25 %	25 %	478450634
4620	NC_020936	TCT	2	6	239172	239177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450634
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4622	NC_020936	GAG	2	6	239265	239270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450634
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4994	NC_020936	AGA	2	6	257371	257376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450654
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4996	NC_020936	CT	3	6	257459	257464	0 %	50 %	0 %	50 %	478450654
4997	NC_020936	TC	3	6	257475	257480	0 %	50 %	0 %	50 %	478450654
4998	NC_020936	CT	3	6	257487	257492	0 %	50 %	0 %	50 %	478450654
4999	NC_020936	ACCTTT	2	12	257526	257537	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478450654
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