MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020935	TCT	2	6	208270	208275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452408
4002	NC_020935	ATA	2	6	208293	208298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452408
4003	NC_020935	TGT	2	6	208429	208434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452408
4004	NC_020935	TAC	2	6	208473	208478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452408
4005	NC_020935	AAG	2	6	208504	208509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452408
4006	NC_020935	TTTA	2	8	208539	208546	25 %	75 %	0 %	0 %	478452408
4007	NC_020935	TTC	3	9	208559	208567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452408
4008	NC_020935	AAC	2	6	208707	208712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452408
4009	NC_020935	T	6	6	208728	208733	0 %	100 %	0 %	0 %	478452408
4010	NC_020935	ATTT	2	8	208844	208851	25 %	75 %	0 %	0 %	478452408
4011	NC_020935	AAT	2	6	208875	208880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452408
4012	NC_020935	GC	3	6	208924	208929	0 %	0 %	50 %	50 %	478452408
4013	NC_020935	AAT	2	6	208986	208991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452408
4014	NC_020935	CCT	2	6	208993	208998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452408
4015	NC_020935	AATT	2	8	209082	209089	50 %	50 %	0 %	0 %	478452408
4016	NC_020935	TTG	2	6	209114	209119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452408
4017	NC_020935	GAG	2	6	209140	209145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452408
4018	NC_020935	GCA	2	6	209299	209304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452408
4019	NC_020935	CAA	2	6	209345	209350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452408
4020	NC_020935	AAT	2	6	209565	209570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452408
4021	NC_020935	GAT	2	6	209631	209636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452408
4022	NC_020935	TTC	2	6	209637	209642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452408
4023	NC_020935	TTTA	2	8	209643	209650	25 %	75 %	0 %	0 %	478452408
4024	NC_020935	ATT	2	6	209681	209686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452409
4025	NC_020935	TTG	2	6	209827	209832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452409
4026	NC_020935	TC	3	6	209857	209862	0 %	50 %	0 %	50 %	478452409
4027	NC_020935	TTC	2	6	209896	209901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452409
4028	NC_020935	AGT	2	6	209914	209919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452409
4029	NC_020935	AACA	2	8	209941	209948	75 %	0 %	0 %	25 %	478452409
4030	NC_020935	TCT	2	6	209967	209972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452409
4031	NC_020935	TGGA	2	8	209999	210006	25 %	25 %	50 %	0 %	478452409
4032	NC_020935	TTC	2	6	210053	210058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452409
4033	NC_020935	TA	3	6	210073	210078	50 %	50 %	0 %	0 %	478452409
4034	NC_020935	TTC	2	6	210101	210106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452409
4035	NC_020935	GCA	2	6	210111	210116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452409
4036	NC_020935	GCT	2	6	210120	210125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452409
4037	NC_020935	GGA	2	6	210177	210182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452409
4038	NC_020935	T	6	6	210245	210250	0 %	100 %	0 %	0 %	478452409
4039	NC_020935	AACG	2	8	210293	210300	50 %	0 %	25 %	25 %	478452409
4040	NC_020935	TCA	2	6	210336	210341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452409
4041	NC_020935	CTTT	2	8	210354	210361	0 %	75 %	0 %	25 %	478452409
4042	NC_020935	CCAT	2	8	210384	210391	25 %	25 %	0 %	50 %	478452409
4043	NC_020935	GA	3	6	210402	210407	50 %	0 %	50 %	0 %	478452409
4044	NC_020935	T	6	6	210422	210427	0 %	100 %	0 %	0 %	478452409
4045	NC_020935	AGG	2	6	210446	210451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452409
4046	NC_020935	CATT	2	8	210468	210475	25 %	50 %	0 %	25 %	478452409
4047	NC_020935	AGA	2	6	210502	210507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452409
4048	NC_020935	CAA	2	6	210515	210520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452409
4049	NC_020935	ATA	4	12	210558	210569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452409
4050	NC_020935	GCT	2	6	210627	210632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452409
4051	NC_020935	GAA	2	6	210712	210717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452409
4052	NC_020935	ACG	2	6	210728	210733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452409
4053	NC_020935	AGCG	2	8	210838	210845	25 %	0 %	50 %	25 %	478452409
4054	NC_020935	CT	3	6	210875	210880	0 %	50 %	0 %	50 %	478452409
4055	NC_020935	CT	3	6	210883	210888	0 %	50 %	0 %	50 %	478452409
4056	NC_020935	AGC	2	6	210890	210895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452409
4057	NC_020935	A	6	6	210962	210967	100 %	0 %	0 %	0 %	478452409
4058	NC_020935	CAC	2	6	210982	210987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478452409
4059	NC_020935	TGTTT	2	10	211032	211041	0 %	80 %	20 %	0 %	478452409
4060	NC_020935	CTA	2	6	211084	211089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452409
4061	NC_020935	TCT	2	6	211104	211109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452409
4062	NC_020935	TAGA	2	8	211135	211142	50 %	25 %	25 %	0 %	478452409
4063	NC_020935	CTTGT	2	10	211213	211222	0 %	60 %	20 %	20 %	478452409
4064	NC_020935	ATT	2	6	211229	211234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452409
4065	NC_020935	AGC	2	6	211280	211285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452409
4066	NC_020935	CAT	2	6	211303	211308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452409
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4068	NC_020935	CG	3	6	211508	211513	0 %	0 %	50 %	50 %	478452409
4069	NC_020935	CTGGAT	2	12	211540	211551	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478452409
4070	NC_020935	GTA	2	6	211765	211770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452409
4071	NC_020935	ACC	2	6	211779	211784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478452409
4072	NC_020935	CTTG	2	8	211807	211814	0 %	50 %	25 %	25 %	478452409
4073	NC_020935	GAAATA	2	12	211863	211874	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478452409
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4077	NC_020935	TTTCT	2	10	212063	212072	0 %	80 %	0 %	20 %	478452409
4078	NC_020935	TAA	2	6	212092	212097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452410
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4081	NC_020935	ACG	2	6	212398	212403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452410
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4083	NC_020935	AATA	2	8	212691	212698	75 %	25 %	0 %	0 %	478452411
4084	NC_020935	CTT	2	6	212741	212746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452411
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4088	NC_020935	AAG	2	6	212924	212929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452411
4089	NC_020935	CTT	2	6	212930	212935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452411
4090	NC_020935	CTT	2	6	212957	212962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452411
4091	NC_020935	CTG	2	6	213016	213021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452412
4092	NC_020935	CCA	2	6	213080	213085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478452412
4093	NC_020935	CAAA	2	8	213100	213107	75 %	0 %	0 %	25 %	478452412
4094	NC_020935	CCA	2	6	213119	213124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478452412
4095	NC_020935	GCA	2	6	213131	213136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452412
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4097	NC_020935	TAC	2	6	213195	213200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452412
4098	NC_020935	CTT	2	6	213258	213263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452412
4099	NC_020935	TA	3	6	213384	213389	50 %	50 %	0 %	0 %	478452413
4100	NC_020935	ATG	2	6	213437	213442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452413
4101	NC_020935	TGT	2	6	213445	213450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452413
4102	NC_020935	GC	3	6	213510	213515	0 %	0 %	50 %	50 %	478452413
4103	NC_020935	AGA	2	6	213572	213577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452413
4104	NC_020935	ATT	2	6	213587	213592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452413
4105	NC_020935	CTG	2	6	213739	213744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452413
4106	NC_020935	CAC	2	6	213767	213772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478452413
4107	NC_020935	TCT	2	6	213837	213842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452413
4108	NC_020935	C	6	6	213881	213886	0 %	0 %	0 %	100 %	478452413
4109	NC_020935	ATGA	2	8	213887	213894	50 %	25 %	25 %	0 %	478452413
4110	NC_020935	T	6	6	213921	213926	0 %	100 %	0 %	0 %	478452413
4111	NC_020935	GCA	2	6	214009	214014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452413
4112	NC_020935	GAA	2	6	214027	214032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452413
4113	NC_020935	GAAA	2	8	214080	214087	75 %	0 %	25 %	0 %	478452413
4114	NC_020935	TCA	2	6	214128	214133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452413
4115	NC_020935	ATG	2	6	214143	214148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452413
4116	NC_020935	TCC	2	6	214154	214159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452413
4117	NC_020935	T	6	6	214160	214165	0 %	100 %	0 %	0 %	478452413
4118	NC_020935	TAA	2	6	214240	214245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452413
4119	NC_020935	AGC	2	6	214286	214291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452413
4120	NC_020935	GAT	2	6	214321	214326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452413
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4122	NC_020935	AGA	2	6	214753	214758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452414
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4245	NC_020935	AAG	2	6	220088	220093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452418
4246	NC_020935	CCT	2	6	220100	220105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452418
4247	NC_020935	TCCT	2	8	220133	220140	0 %	50 %	0 %	50 %	478452418
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4249	NC_020935	CTT	2	6	220169	220174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452418
4250	NC_020935	CAA	2	6	220180	220185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452418
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4252	NC_020935	CTGA	2	8	220225	220232	25 %	25 %	25 %	25 %	478452418
4253	NC_020935	GAA	2	6	220334	220339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452418
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4278	NC_020935	A	7	7	221486	221492	100 %	0 %	0 %	0 %	478452419
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4354	NC_020935	TAC	2	6	225499	225504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452424
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4357	NC_020935	GCTTG	2	10	225632	225641	0 %	40 %	40 %	20 %	478452424
4358	NC_020935	TTTC	2	8	225644	225651	0 %	75 %	0 %	25 %	478452424
4359	NC_020935	CTT	2	6	225706	225711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452424
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4362	NC_020935	TAT	2	6	225973	225978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452424
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4365	NC_020935	GAA	2	6	226118	226123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452424
4366	NC_020935	ATT	2	6	226184	226189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452424
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4368	NC_020935	TTCT	2	8	226320	226327	0 %	75 %	0 %	25 %	478452424
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4491	NC_020935	CAT	2	6	232466	232471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452428
4492	NC_020935	ACA	2	6	232503	232508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452429
4493	NC_020935	TTCAC	2	10	232545	232554	20 %	40 %	0 %	40 %	478452429
4494	NC_020935	CTT	3	9	232600	232608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452429
4495	NC_020935	ATA	2	6	232623	232628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452429
4496	NC_020935	CTGT	2	8	232675	232682	0 %	50 %	25 %	25 %	478452429
4497	NC_020935	TCT	2	6	232683	232688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452429
4498	NC_020935	AAC	2	6	232746	232751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452429
4499	NC_020935	GAG	2	6	232774	232779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452429
4500	NC_020935	AGA	2	6	232979	232984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452429

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