MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2005	NC_020935	AGTA	2	8	104396	104403	50 %	25 %	25 %	0 %	478452314
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2125	NC_020935	GAT	2	6	110961	110966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452320
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2127	NC_020935	T	6	6	111249	111254	0 %	100 %	0 %	0 %	478452320
2128	NC_020935	TTG	2	6	111273	111278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452320
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2238	NC_020935	TTC	3	9	116251	116259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452322
2239	NC_020935	TCT	2	6	116312	116317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452322
2240	NC_020935	AAGC	2	8	116321	116328	50 %	0 %	25 %	25 %	478452322
2241	NC_020935	TATCG	2	10	116329	116338	20 %	40 %	20 %	20 %	478452322
2242	NC_020935	T	6	6	116345	116350	0 %	100 %	0 %	0 %	478452322
2243	NC_020935	GGTT	2	8	116653	116660	0 %	50 %	50 %	0 %	478452323
2244	NC_020935	T	7	7	116669	116675	0 %	100 %	0 %	0 %	478452323
2245	NC_020935	GCT	2	6	116795	116800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452323
2246	NC_020935	TTTCT	2	10	116845	116854	0 %	80 %	0 %	20 %	478452323
2247	NC_020935	ACA	2	6	116882	116887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452323
2248	NC_020935	GGAGA	2	10	117041	117050	40 %	0 %	60 %	0 %	478452323
2249	NC_020935	TAT	2	6	117070	117075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452323
2250	NC_020935	TATC	2	8	117102	117109	25 %	50 %	0 %	25 %	478452323
2251	NC_020935	TTTG	2	8	117199	117206	0 %	75 %	25 %	0 %	478452323
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2254	NC_020935	GA	3	6	117286	117291	50 %	0 %	50 %	0 %	478452323
2255	NC_020935	A	6	6	117339	117344	100 %	0 %	0 %	0 %	478452323
2256	NC_020935	GTTC	2	8	117395	117402	0 %	50 %	25 %	25 %	478452323
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2260	NC_020935	AGG	2	6	117499	117504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452323
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2263	NC_020935	TGC	2	6	117580	117585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452323
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2287	NC_020935	GTT	2	6	118951	118956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452326
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2299	NC_020935	CTG	2	6	119576	119581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452327
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2319	NC_020935	GCTA	2	8	120240	120247	25 %	25 %	25 %	25 %	478452328
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2354	NC_020935	TTTC	2	8	122397	122404	0 %	75 %	0 %	25 %	478452329
2355	NC_020935	AAC	2	6	122448	122453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452329
2356	NC_020935	TGA	2	6	122496	122501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452329
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2361	NC_020935	TGA	2	6	122752	122757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452329
2362	NC_020935	CTT	2	6	122795	122800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452329
2363	NC_020935	TC	3	6	122818	122823	0 %	50 %	0 %	50 %	478452329
2364	NC_020935	ATC	2	6	123001	123006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452329
2365	NC_020935	AACA	2	8	123025	123032	75 %	0 %	0 %	25 %	478452329
2366	NC_020935	AAAG	2	8	123128	123135	75 %	0 %	25 %	0 %	478452329
2367	NC_020935	GA	3	6	123148	123153	50 %	0 %	50 %	0 %	478452329
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2491	NC_020935	T	6	6	128938	128943	0 %	100 %	0 %	0 %	478452335
2492	NC_020935	GAA	2	6	129000	129005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452335
2493	NC_020935	CTT	3	9	129030	129038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452335
2494	NC_020935	GTA	2	6	129514	129519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452336
2495	NC_020935	TCA	2	6	129558	129563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452336
2496	NC_020935	TTC	2	6	129623	129628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452336
2497	NC_020935	AGC	2	6	129677	129682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452336
2498	NC_020935	AG	3	6	129723	129728	50 %	0 %	50 %	0 %	478452336
2499	NC_020935	TCT	2	6	129745	129750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452336
2500	NC_020935	CTT	2	6	129751	129756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452336

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