MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 20245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020935	CATG	2	8	78872	78879	25 %	25 %	25 %	25 %	478452289
1503	NC_020935	ATT	2	6	79349	79354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452290
1504	NC_020935	AATT	2	8	79367	79374	50 %	50 %	0 %	0 %	478452290
1505	NC_020935	T	6	6	79397	79402	0 %	100 %	0 %	0 %	478452290
1506	NC_020935	GAG	2	6	79516	79521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452290
1507	NC_020935	TTC	2	6	79608	79613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452290
1508	NC_020935	T	8	8	79615	79622	0 %	100 %	0 %	0 %	478452290
1509	NC_020935	GCC	2	6	79643	79648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478452290
1510	NC_020935	TCC	2	6	79691	79696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452290
1511	NC_020935	GCT	2	6	79723	79728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452290
1512	NC_020935	TCT	2	6	79734	79739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452290
1513	NC_020935	T	7	7	80431	80437	0 %	100 %	0 %	0 %	478452291
1514	NC_020935	TGA	2	6	80536	80541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452291
1515	NC_020935	TGTCT	2	10	80551	80560	0 %	60 %	20 %	20 %	478452291
1516	NC_020935	TGAT	2	8	80625	80632	25 %	50 %	25 %	0 %	478452291
1517	NC_020935	TCAT	2	8	80647	80654	25 %	50 %	0 %	25 %	478452291
1518	NC_020935	T	6	6	80703	80708	0 %	100 %	0 %	0 %	478452291
1519	NC_020935	GGTTTA	2	12	80714	80725	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478452291
1520	NC_020935	TCT	2	6	80815	80820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452291
1521	NC_020935	GAA	2	6	80825	80830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452291
1522	NC_020935	TGC	2	6	80875	80880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452291
1523	NC_020935	CAA	2	6	80909	80914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452291
1524	NC_020935	GAA	2	6	80927	80932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452291
1525	NC_020935	GGA	2	6	80971	80976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452291
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1527	NC_020935	A	7	7	81018	81024	100 %	0 %	0 %	0 %	478452291
1528	NC_020935	TTACT	2	10	81058	81067	20 %	60 %	0 %	20 %	478452291
1529	NC_020935	TATC	2	8	81074	81081	25 %	50 %	0 %	25 %	478452291
1530	NC_020935	GA	3	6	81092	81097	50 %	0 %	50 %	0 %	478452291
1531	NC_020935	TAT	2	6	81172	81177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452291
1532	NC_020935	TA	3	6	81312	81317	50 %	50 %	0 %	0 %	478452291
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1534	NC_020935	GGGA	2	8	81385	81392	25 %	0 %	75 %	0 %	478452291
1535	NC_020935	CTGC	2	8	81489	81496	0 %	25 %	25 %	50 %	478452292
1536	NC_020935	GCT	2	6	81507	81512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452292
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1539	NC_020935	CTT	2	6	81577	81582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452292
1540	NC_020935	CAT	2	6	81624	81629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452292
1541	NC_020935	TGA	2	6	81746	81751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452292
1542	NC_020935	AGG	2	6	81757	81762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452292
1543	NC_020935	GGTT	2	8	81782	81789	0 %	50 %	50 %	0 %	478452292
1544	NC_020935	CT	3	6	81822	81827	0 %	50 %	0 %	50 %	478452292
1545	NC_020935	GGA	2	6	81828	81833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452292
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1548	NC_020935	T	6	6	81848	81853	0 %	100 %	0 %	0 %	478452292
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1550	NC_020935	TCAT	2	8	81985	81992	25 %	50 %	0 %	25 %	478452292
1551	NC_020935	TTA	2	6	82035	82040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452292
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1556	NC_020935	T	6	6	82220	82225	0 %	100 %	0 %	0 %	478452293
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1559	NC_020935	TTA	2	6	82293	82298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452293
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1561	NC_020935	TTA	2	6	82390	82395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452293
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1564	NC_020935	T	6	6	82503	82508	0 %	100 %	0 %	0 %	478452293
1565	NC_020935	GTTA	2	8	82527	82534	25 %	50 %	25 %	0 %	478452293
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1568	NC_020935	GCG	2	6	82593	82598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478452293
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1570	NC_020935	TGG	3	9	82662	82670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478452293
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1574	NC_020935	GTG	2	6	82783	82788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478452293
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1593	NC_020935	T	6	6	83594	83599	0 %	100 %	0 %	0 %	478452294
1594	NC_020935	GTA	2	6	83680	83685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452294
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1599	NC_020935	TCAT	2	8	83786	83793	25 %	50 %	0 %	25 %	478452294
1600	NC_020935	CAA	2	6	83828	83833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452294
1601	NC_020935	CATT	2	8	83853	83860	25 %	50 %	0 %	25 %	478452294
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1603	NC_020935	AGCA	2	8	83892	83899	50 %	0 %	25 %	25 %	478452294
1604	NC_020935	TC	3	6	83914	83919	0 %	50 %	0 %	50 %	478452294
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1607	NC_020935	TTTG	2	8	84085	84092	0 %	75 %	25 %	0 %	478452294
1608	NC_020935	TTG	2	6	84182	84187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452294
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1611	NC_020935	CTA	2	6	84397	84402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452294
1612	NC_020935	TAT	2	6	84450	84455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452294
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1615	NC_020935	TAT	2	6	84590	84595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452295
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1619	NC_020935	AG	3	6	84648	84653	50 %	0 %	50 %	0 %	478452295
1620	NC_020935	GAA	2	6	84681	84686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452295
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1623	NC_020935	AG	3	6	84915	84920	50 %	0 %	50 %	0 %	478452295
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